More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2923 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 132 aa  265  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  96.97 
 
 		 132 aa  259  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  94.26 
 
 		 131 aa  238  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  92.62 
 
 		 131 aa  233  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  94.96 
 
 		 132 aa  232  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  82.31 
 
 		 131 aa  218  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  82.31 
 
 		 131 aa  218  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  82.31 
 
 		 131 aa  218  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  82.31 
 
 		 131 aa  218  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  82.31 
 
 		 131 aa  218  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  82.31 
 
 		 131 aa  218  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  82.31 
 
 		 131 aa  218  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  82.31 
 
 		 131 aa  218  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  82.31 
 
 		 131 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3474  50S ribosomal protein L17  81.54 
 
 		 131 aa  216  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  84.5 
 
 		 129 aa  216  6e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  81.54 
 
 		 131 aa  216  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  81.54 
 
 		 131 aa  216  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2732  50S ribosomal protein L17  81.54 
 
 		 131 aa  216  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  81.54 
 
 		 131 aa  216  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  81.54 
 
 		 131 aa  216  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0346  50S ribosomal protein L17  80.3 
 
 		 132 aa  215  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.962629  unclonable  0.0000000436647 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0346  50S ribosomal protein L17  80.15 
 
 		 133 aa  215  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.000393302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0502  50S ribosomal protein L17  78.79 
 
 		 132 aa  212  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  79.07 
 
 		 129 aa  211  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  87.39 
 
 		 131 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  86.55 
 
 		 130 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  86.55 
 
 		 130 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  79.07 
 
 		 129 aa  211  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5044  50S ribosomal protein L17  83.47 
 
 		 132 aa  210  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0627  50S ribosomal protein L17P  77.69 
 
 		 134 aa  209  7.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  78.03 
 
 		 132 aa  209  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  85.71 
 
 		 131 aa  208  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2300  ribosomal protein L17  75.76 
 
 		 133 aa  205  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  77.1 
 
 		 131 aa  205  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1048  ribosomal protein L17  85.34 
 
 		 130 aa  203  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  80.83 
 
 		 132 aa  200  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  75.97 
 
 		 129 aa  200  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3416  50S ribosomal protein L17P  82.2 
 
 		 131 aa  199  9e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  77.1 
 
 		 131 aa  199  9e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3922  ribosomal protein L17  76.98 
 
 		 132 aa  196  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  75.2 
 
 		 127 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  75.2 
 
 		 127 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  75.2 
 
 		 127 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  75.2 
 
 		 127 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  75.2 
 
 		 127 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  75.2 
 
 		 127 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  75.2 
 
 		 127 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  75.2 
 
 		 127 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  75.2 
 
 		 127 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  72.31 
 
 		 131 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  72.31 
 
 		 131 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  71.97 
 
 		 132 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  71.97 
 
 		 132 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  72.31 
 
 		 131 aa  194  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  72.31 
 
 		 131 aa  194  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  72.31 
 
 		 131 aa  194  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  72.31 
 
 		 131 aa  194  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  75 
 
 		 127 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  75 
 
 		 127 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  75 
 
 		 127 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  75 
 
 		 127 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  75 
 
 		 127 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  72.73 
 
 		 128 aa  194  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  73.64 
 
 		 129 aa  193  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  73.64 
 
 		 129 aa  191  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  71.21 
 
 		 130 aa  191  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  73.64 
 
 		 129 aa  191  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  73.64 
 
 		 129 aa  191  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  71.54 
 
 		 130 aa  191  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  72.73 
 
 		 126 aa  191  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  71.54 
 
 		 130 aa  191  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  76.27 
 
 		 130 aa  190  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2615  ribosomal protein L17  73.98 
 
 		 126 aa  189  8e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.718134  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3498  ribosomal protein L17  73.98 
 
 		 126 aa  189  8e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110108  hitchhiker  0.0000306031 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  74.4 
 
 		 127 aa  189  9e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  72.22 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  71.32 
 
 		 130 aa  189  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  70.31 
 
 		 128 aa  187  2.9999999999999997e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  73.11 
 
 		 133 aa  187  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  73.02 
 
 		 125 aa  187  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  71.09 
 
 		 128 aa  186  5.999999999999999e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  73.95 
 
 		 126 aa  186  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  74.79 
 
 		 128 aa  186  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  70.63 
 
 		 127 aa  185  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  73.95 
 
 		 133 aa  185  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0781  50S ribosomal protein L17  72 
 
 		 127 aa  184  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478066  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  70.63 
 
 		 126 aa  182  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  70.63 
 
 		 126 aa  182  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  73.11 
 
 		 130 aa  181  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  65.91 
 
 		 132 aa  180  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0627  50S ribosomal protein L17  66.92 
 
 		 134 aa  180  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  72.27 
 
 		 131 aa  180  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5054  50S ribosomal protein L17  70.31 
 
 		 128 aa  180  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088451  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  73.11 
 
 		 132 aa  179  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  67.67 
 
 		 134 aa  179  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  72.27 
 
 		 131 aa  179  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  72.27 
 
 		 131 aa  179  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  72.27 
 
 		 131 aa  179  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0480  50S ribosomal protein L17  70.87 
 
 		 128 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>