More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2881 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2951  histidinol-phosphate aminotransferase  90.91 
 
 		 374 aa  674    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  96.79 
 
 		 374 aa  712    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2881  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 374 aa  751    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  78.06 
 
 		 366 aa  584  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  76.94 
 
 		 366 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  71.92 
 
 		 356 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  69.65 
 
 		 356 aa  495  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  69.91 
 
 		 356 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  67.13 
 
 		 364 aa  482  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  69.59 
 
 		 357 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0353  histidinol-phosphate aminotransferase  69.01 
 
 		 357 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2681  histidinol-phosphate aminotransferase  69.59 
 
 		 357 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0426  histidinol-phosphate aminotransferase  69.59 
 
 		 357 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0405  histidinol-phosphate aminotransferase  69.59 
 
 		 357 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290947 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2992  histidinol-phosphate aminotransferase  68.71 
 
 		 356 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0344  histidinol-phosphate aminotransferase  69.3 
 
 		 357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1789  histidinol-phosphate aminotransferase  68.71 
 
 		 356 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3723  histidinol-phosphate aminotransferase  68.71 
 
 		 356 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3665  histidinol-phosphate aminotransferase  68.71 
 
 		 356 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802766  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2713  histidinol-phosphate aminotransferase  68.71 
 
 		 356 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3692  histidinol-phosphate aminotransferase  68.42 
 
 		 356 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3240  histidinol-phosphate aminotransferase  69.01 
 
 		 356 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2764  histidinol-phosphate aminotransferase  68.71 
 
 		 356 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0729  histidinol-phosphate aminotransferase  59.28 
 
 		 368 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  56.67 
 
 		 375 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0697  histidinol-phosphate aminotransferase  56.13 
 
 		 365 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0832  histidinol-phosphate aminotransferase  58.24 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0805  histidinol-phosphate aminotransferase  56.23 
 
 		 358 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0762  histidinol-phosphate aminotransferase  59.56 
 
 		 368 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.865966  normal  0.0190089 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2947  histidinol-phosphate aminotransferase  54.9 
 
 		 369 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1167  histidinol-phosphate aminotransferase  54.59 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1031  histidinol-phosphate aminotransferase  55.68 
 
 		 370 aa  378  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  53.28 
 
 		 368 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  54.29 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5521  histidinol-phosphate aminotransferase  55.12 
 
 		 374 aa  368  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  50.97 
 
 		 360 aa  354  2e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4374  histidinol-phosphate aminotransferase  54.4 
 
 		 396 aa  353  4e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279737  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  52.07 
 
 		 365 aa  339  5e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  52.37 
 
 		 365 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  47.37 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2651  histidinol-phosphate aminotransferase  49.86 
 
 		 359 aa  290  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3042  histidinol-phosphate aminotransferase  49.86 
 
 		 359 aa  290  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  35.13 
 
 		 351 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  32.59 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  32.29 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 		 351 aa  199  6e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  31.91 
 
 		 349 aa  199  6e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 349 aa  196  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  34.96 
 
 		 355 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  32.77 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  36.12 
 
 		 363 aa  193  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  36.68 
 
 		 363 aa  192  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  36.56 
 
 		 369 aa  191  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  35.83 
 
 		 360 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  37.33 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  34.92 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  31.39 
 
 		 371 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  33.81 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  34.02 
 
 		 357 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  37.54 
 
 		 374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  34.77 
 
 		 363 aa  182  7e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  36.57 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  34.71 
 
 		 351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1151  histidinol-phosphate aminotransferase  39.78 
 
 		 367 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  32.05 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  29.97 
 
 		 350 aa  178  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  34.79 
 
 		 355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  35.03 
 
 		 357 aa  172  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  31.32 
 
 		 355 aa  172  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3996  histidinol-phosphate aminotransferase  34.68 
 
 		 361 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.784945 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  32.76 
 
 		 370 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  36.07 
 
 		 383 aa  170  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  30.68 
 
 		 357 aa  169  6e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  34.24 
 
 		 352 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  35.41 
 
 		 362 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  33.53 
 
 		 360 aa  169  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  33.84 
 
 		 355 aa  168  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  37.46 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1092  histidinol-phosphate aminotransferase  34.27 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.72079  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  33.8 
 
 		 369 aa  166  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1477  histidinol-phosphate aminotransferase  29.43 
 
 		 357 aa  165  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07350  histidinol-phosphate aminotransferase  35.64 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  35.28 
 
 		 356 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  30.41 
 
 		 350 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1917  histidinol-phosphate aminotransferase  35.59 
 
 		 453 aa  162  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0201149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10880  histidinol-phosphate aminotransferase  36.78 
 
 		 374 aa  162  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  31.86 
 
 		 357 aa  162  7e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1167  aminotransferase class I and II  31.94 
 
 		 352 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.342737  normal  0.371786 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4228  aminotransferase class I and II  36 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1557  class I/II aminotransferase  29.14 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  32.35 
 
 		 373 aa  160  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  37.35 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  38.19 
 
 		 374 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  35.82 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3241  histidinol-phosphate aminotransferase  34.06 
 
 		 377 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471866  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  30.35 
 
 		 368 aa  157  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2896  histidinol-phosphate aminotransferase  37.06 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00341068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4253  aminotransferase class I and II  35.51 
 
 		 347 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377555  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  34.92 
 
 		 373 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3026  histidinol-phosphate aminotransferase  34.07 
 
 		 397 aa  155  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.992363  normal  0.0418598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>