More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2813 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00382  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  70.53 
 
 
663 aa  976    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000524598  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3178  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  70.53 
 
 
663 aa  976    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000236873  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0049  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  69.2 
 
 
659 aa  919    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0813  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  70.02 
 
 
672 aa  951    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0189476  normal  0.73245 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1976  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  71.58 
 
 
668 aa  951    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0655  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  73.47 
 
 
665 aa  953    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1370  ubiquinol oxidase, subunit I  69.28 
 
 
668 aa  937    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.262769  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1859  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase subunit I  68.13 
 
 
658 aa  917    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.113858 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2916  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase subunit I  94.99 
 
 
659 aa  1248    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal  0.149288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0771  quinol oxidase, subunit I  52.67 
 
 
644 aa  662    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314385  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0432  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  68.65 
 
 
661 aa  944    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.911971 
 
 
-
 
NC_004310  BR0043  ubiquinol oxidase subunit I  67.68 
 
 
659 aa  923    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1326  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  68.69 
 
 
670 aa  932    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0668  quinol oxidase subunit I  52.99 
 
 
647 aa  661    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0740  cytochrome-c oxidase  73.47 
 
 
665 aa  953    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0612  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  52.99 
 
 
647 aa  661    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4375  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  70.02 
 
 
672 aa  952    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.962664 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0613  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  52.99 
 
 
647 aa  661    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.666796  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5734  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  64.39 
 
 
667 aa  870    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0637775  normal  0.0130866 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2412  ubiquinol oxidase subunit 1  70.48 
 
 
560 aa  798    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0195  ubiquinol oxidase, subunit I  69.28 
 
 
668 aa  937    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0295  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  63.72 
 
 
664 aa  881    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1142  cytochrome-c oxidase  68.54 
 
 
670 aa  941    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.303035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0836  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  70.17 
 
 
672 aa  954    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.630143  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05492  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  67.64 
 
 
678 aa  921    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0983  cytochrome-c oxidase  78.33 
 
 
657 aa  1063    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0766124  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4578  cytochrome-c oxidase  70.08 
 
 
659 aa  935    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4891  cytochrome-c oxidase  68.05 
 
 
667 aa  894    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271265  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2222  cytochrome-c oxidase  64.25 
 
 
667 aa  855    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153273  normal  0.0859348 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4351  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  68.61 
 
 
659 aa  946    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0770  cytochrome c oxidase, subunit I  53.47 
 
 
657 aa  706    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1743  cytochrome-c oxidase  67.38 
 
 
668 aa  902    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0545412  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1567  ubiquinol oxidase, subunit I  69.28 
 
 
668 aa  937    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2834  ubiquinol oxidase polypeptide I  69.28 
 
 
668 aa  934    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0992  ubiquinol oxidase, subunit I  69.28 
 
 
668 aa  939    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.502961  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2776  cytochrome-c oxidase  63.78 
 
 
646 aa  842    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842999  normal  0.700604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4647  cytochrome-c oxidase  68.34 
 
 
676 aa  915    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1391  normal  0.331546 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5375  cytochrome-c oxidase  69.74 
 
 
668 aa  944    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686893 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2715  ubiquinol oxidase, subunit I  69.28 
 
 
668 aa  935    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0702  quinol oxidase subunit I  52.99 
 
 
644 aa  662    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2089  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  70.73 
 
 
668 aa  951    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330323  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2031  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  66.31 
 
 
669 aa  895    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0504466  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0480  ubiquinol oxidase, subunit I  70.2 
 
 
668 aa  949    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.070383  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0226  ubiquinol oxidase, subunit I  69.28 
 
 
668 aa  937    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1787  ubiquinol oxidase, subunit I  68.53 
 
 
670 aa  932    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572465  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0471  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  70.53 
 
 
663 aa  976    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000517017  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0090  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  67.88 
 
 
659 aa  926    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.949394 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3648  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  67.68 
 
 
670 aa  903    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573028  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4219  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  68.61 
 
 
659 aa  946    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0241  cytochrome-c oxidase  67.27 
 
 
669 aa  904    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515417  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0043  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  67.68 
 
 
659 aa  922    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.438078  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3202  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  70.53 
 
 
663 aa  976    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154912  hitchhiker  0.000119789 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0367  cytochrome-c oxidase  67.33 
 
 
662 aa  938    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3859  cytochrome-c oxidase  68.45 
 
 
659 aa  954    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1294  cytochrome-c oxidase  71.82 
 
 
659 aa  989    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0028015  hitchhiker  0.0019187 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2773  ubiquinol oxidase, subunit I  69.28 
 
 
668 aa  935    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.668057  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0466  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  70.53 
 
 
663 aa  976    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000180375  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0506  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  70.53 
 
 
663 aa  976    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000135927  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1636  cytochrome-c oxidase  70.14 
 
 
662 aa  960    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551524  normal  0.0691179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3171  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  60.76 
 
 
666 aa  826    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.404396  normal  0.0592526 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0596  cytochrome-c oxidase  66.62 
 
 
669 aa  874    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1089  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  71.84 
 
 
663 aa  985    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000953618  hitchhiker  0.0000000467486 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0955  cytochrome-c oxidase  68.59 
 
 
659 aa  946    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3452  cytochrome-c oxidase  57.01 
 
 
658 aa  744    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0898  cytochrome-c oxidase  70.93 
 
 
663 aa  963    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00392168  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4371  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  66.46 
 
 
669 aa  898    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0949  cytochrome c oxidase subunit I  78.12 
 
 
657 aa  1066    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.979391  normal  0.982005 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5609  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  67.13 
 
 
667 aa  884    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5792  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  70.23 
 
 
658 aa  942    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  0.112215 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0268  ubiquinol oxidase, polypeptide I  65.6 
 
 
665 aa  907    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.764734  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2285  cytochrome-c oxidase  62.17 
 
 
678 aa  806    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1507  cytochrome-c oxidase  63.73 
 
 
672 aa  856    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.944776  normal  0.265264 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3061  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit I  71.84 
 
 
663 aa  990    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000288206  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6007  cytochrome-c oxidase  70.73 
 
 
668 aa  951    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.46766  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0850  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  69.56 
 
 
672 aa  951    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4336  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  65.71 
 
 
667 aa  886    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.632813  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1291  cytochrome-c oxidase  68.04 
 
 
664 aa  953    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3535  cytochrome c oxidase, subunit I  62.58 
 
 
676 aa  851    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3824  cytochrome-c oxidase  67.69 
 
 
659 aa  933    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3915  cytochrome-c oxidase  67.69 
 
 
659 aa  934    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2571  ubiquinol oxidase, subunit I  68.87 
 
 
670 aa  937    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0223  cytochrome-c oxidase  67.74 
 
 
660 aa  945    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2106  cytochrome-c oxidase  71.58 
 
 
668 aa  951    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.416073  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2878  ubiquinol oxidase, subunit I  70.48 
 
 
560 aa  798    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1274  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  57.71 
 
 
672 aa  770    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000601159  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47190  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  73.56 
 
 
658 aa  1030    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000419377  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1732  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  66.46 
 
 
666 aa  879    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2070  cytochrome-c oxidase  70.73 
 
 
668 aa  951    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976192  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2715  ubiquinol oxidase, subunit I  69.28 
 
 
668 aa  939    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0985139  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4032  cytochrome c oxidase, subunit I  67.99 
 
 
659 aa  937    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0617  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  53.46 
 
 
644 aa  669    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1002  cytochrome c oxidase polypeptide I  62.29 
 
 
668 aa  838    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5107  cytochrome-c oxidase  62.22 
 
 
668 aa  819    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00931124  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3099  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  71.84 
 
 
663 aa  990    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.284302  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4058  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  64.61 
 
 
645 aa  837    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.197273  normal  0.152019 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0590  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  52.99 
 
 
644 aa  665    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3242  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  71.84 
 
 
663 aa  990    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1210  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  70.81 
 
 
668 aa  948    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.432825  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4072  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  73.71 
 
 
658 aa  1032    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190323  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0900  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  62.29 
 
 
668 aa  838    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>