More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2725 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_3090  cell division protein FtsW  99.76 
 
 
413 aa  816    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.812659  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2845  cell division FtsW transmembrane protein  95.64 
 
 
413 aa  783    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2980  cell cycle protein  87.41 
 
 
413 aa  689    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2674  cell division protein FtsW  74.7 
 
 
427 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2725  cell division protein FtsW  100 
 
 
413 aa  819    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.669489  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3129  cell cycle protein  87.41 
 
 
413 aa  716    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2837  cell division protein FtsW  77.23 
 
 
427 aa  628  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202196  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3644  cell cycle protein  76.98 
 
 
427 aa  627  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.951225 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0076  cell division protein FtsW  76.73 
 
 
427 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0558  cell division protein FtsW  76.73 
 
 
427 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0529  cell division protein FtsW  76.98 
 
 
427 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704536  normal  0.739964 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0487  cell division protein FtsW  76.98 
 
 
427 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564923  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0462  cell division protein FtsW  76.98 
 
 
427 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3471  cell division protein FtsW  78.32 
 
 
425 aa  615  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162796  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0485  cell division transmembrane protein, FtsW  78.15 
 
 
426 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302923  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2552  cell division protein FtsW  78.77 
 
 
430 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3551  cell division protein FtsW  78.77 
 
 
430 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0473  cell division protein FtsW  78.77 
 
 
430 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3526  cell division protein FtsW  78.77 
 
 
430 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1332  cell division protein FtsW  78.77 
 
 
430 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3231  cell division protein FtsW  78.77 
 
 
430 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3546  cell division protein FtsW  78.77 
 
 
462 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1117  cell division protein FtsW  78.29 
 
 
462 aa  599  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0166  cell division protein FtsW  69.85 
 
 
423 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.582847  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0180  cell division protein FtsW  68.59 
 
 
423 aa  561  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.598529  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0820  cell division protein FtsW  64.83 
 
 
427 aa  491  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.671328 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3418  cell division protein FtsW  64.3 
 
 
421 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.444821  normal  0.752048 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1074  cell cycle protein  62.21 
 
 
420 aa  479  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.906686  normal  0.836068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0918  cell division protein FtsW  64.27 
 
 
432 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.110532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4569  cell division protein FtsW  63.54 
 
 
418 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0832215  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3426  cell cycle protein  60.49 
 
 
411 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3499  cell cycle protein  58.91 
 
 
387 aa  460  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00851666  normal  0.20091 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0521  cell division protein FtsW  63.24 
 
 
422 aa  461  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0461  cell division protein FtsW  60.71 
 
 
430 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.216313  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2981  cell division protein FtsW  61.32 
 
 
426 aa  455  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00476762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3671  cell division protein FtsW  61.32 
 
 
426 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235088  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1469  cell division protein FtsW  60.94 
 
 
421 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.109861  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3428  cell division protein FtsW  61.5 
 
 
409 aa  423  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2495  cell cycle protein  57.33 
 
 
386 aa  421  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2270  cell cycle protein  55.73 
 
 
392 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.011941 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0118  cell division protein FtsW  57.63 
 
 
385 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0137609 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  50 
 
 
391 aa  328  7e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  50 
 
 
391 aa  328  7e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1980  cell division protein FtsW  44.44 
 
 
398 aa  316  5e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00090  integral membrane protein involved in stabilizing FstZ ring during cell division  45.31 
 
 
414 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3511  cell division protein FtsW  45.31 
 
 
414 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0091  cell division protein FtsW  45.31 
 
 
414 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00890066  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0094  cell division protein FtsW  45.31 
 
 
414 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.251291  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0095  cell division protein FtsW  45.31 
 
 
414 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.747639  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00089  hypothetical protein  45.31 
 
 
414 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3568  cell division protein FtsW  45.31 
 
 
414 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655548 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0097  cell division protein FtsW  45.31 
 
 
414 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.301255  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0144  cell division protein FtsW  44.8 
 
 
414 aa  309  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0378146  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0139  cell division protein FtsW  44.8 
 
 
414 aa  309  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.919378 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0143  cell division protein FtsW  44.8 
 
 
414 aa  309  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.247505 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0082  cell division protein FtsW  45.31 
 
 
414 aa  309  6.999999999999999e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0136  cell division protein FtsW  44.8 
 
 
414 aa  309  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.931456 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0139  cell division protein FtsW  44.8 
 
 
414 aa  309  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.571731  hitchhiker  0.000000336901 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004491  cell division protein FtsW  44.84 
 
 
398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00901  hypothetical protein  45.19 
 
 
398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1974  cell division protein  45.98 
 
 
372 aa  303  4.0000000000000003e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0635  cell division protein FtsW  43.54 
 
 
414 aa  303  5.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.146996  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0222  cell division protein FtsW  45.69 
 
 
372 aa  300  2e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0353  cell division protein FtsW  45.23 
 
 
402 aa  299  7e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000708854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4534  cell division protein FtsW  42.23 
 
 
404 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0357  cell division protein  46.77 
 
 
394 aa  295  1e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.891735  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0760  cell division protein FtsW  43.08 
 
 
400 aa  292  9e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682655  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2645  cell division protein FtsW  44.12 
 
 
400 aa  292  9e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0601  cell division protein FtsW  43.73 
 
 
441 aa  291  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.190924  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3805  cell division protein FtsW  44.02 
 
 
404 aa  290  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2862  cell cycle protein, FtsW  49.86 
 
 
384 aa  290  4e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00502116  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0567  cell cycle protein  45.51 
 
 
389 aa  290  4e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3812  cell division protein FtsW  43.4 
 
 
405 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1970  cell division protein FtsW  46.17 
 
 
423 aa  288  1e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.212582  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1146  cell division protein FtsW  44.96 
 
 
406 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0768  cell division protein FtsW  46.15 
 
 
400 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.626093  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4220  cell division protein FtsW  41.96 
 
 
403 aa  286  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0409  cell division protein FtsW  42.16 
 
 
410 aa  286  5e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146554 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3454  cell division protein FtsW  42.7 
 
 
404 aa  286  5e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00477404 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2049  cell division protein  45.9 
 
 
423 aa  286  7e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0247231  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0385  cell division protein FtsW  41.69 
 
 
403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0110798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3744  cell division protein FtsW  41.69 
 
 
403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000784985 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3571  cell division protein FtsW  41.42 
 
 
403 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0486  cell division protein FtsW  41.14 
 
 
403 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4985  cell division protein FtsW  45.48 
 
 
399 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57360  cell division protein FtsW  45.48 
 
 
399 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0647  cell division protein FtsW  44.89 
 
 
400 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159842  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03259  cell division protein FtsW  42.32 
 
 
470 aa  279  6e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0921  cell division protein FtsW  47.11 
 
 
402 aa  278  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.524737  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4466  cell division protein FtsW  41.42 
 
 
437 aa  278  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0354  phosphopantetheine attachment site  41.82 
 
 
404 aa  278  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3593  cell division protein FtsW  41.24 
 
 
400 aa  275  8e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2919  cell division protein FtsW  41.45 
 
 
400 aa  275  9e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3519  cell division protein FtsW  41.45 
 
 
400 aa  275  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3388  cell division protein FtsW  41.45 
 
 
400 aa  275  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0609  cell division protein FtsW  44.32 
 
 
400 aa  273  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2430  cell division protein FtsW  44.23 
 
 
398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2092  cell division protein FtsW  45.57 
 
 
395 aa  272  7e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3781  cell division protein FtsW  41.62 
 
 
400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2191  cell cycle protein  43.22 
 
 
394 aa  270  5e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.506626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>