59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2664 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  59.38 
 
 		 180 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  39.6 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  38.52 
 
 		 272 aa  142  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  37.55 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  47.29 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000441366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  48.84 
 
 		 313 aa  121  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  33.73 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  42.64 
 
 		 345 aa  112  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  41.22 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4893  hypothetical protein  40.94 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4706  hypothetical protein  42.65 
 
 		 311 aa  101  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0127144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3983  hypothetical protein  45.11 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.612254 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  40.8 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  43.85 
 
 		 279 aa  99  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  41.13 
 
 		 304 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1267  hypothetical protein  40 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  43.75 
 
 		 375 aa  96.3  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  38.58 
 
 		 314 aa  95.9  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4521  hypothetical protein  38.17 
 
 		 328 aa  94.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  37.32 
 
 		 298 aa  94.7  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2246  hypothetical protein  39.13 
 
 		 323 aa  94  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0209  hypothetical protein  39.69 
 
 		 315 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  hitchhiker  0.00000108217 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6007  putative restriction endonuclease  38.73 
 
 		 334 aa  89  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  36.13 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  34.84 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0625  hypothetical protein  33.86 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  36.25 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  37.41 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  30.77 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  39.26 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  32.14 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  32.76 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  38.66 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  34.88 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  34.02 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  40.96 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  40.43 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0090  hypothetical protein  59.52 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  38.64 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  40.96 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  35.63 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  36.17 
 
 		 315 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  35.16 
 
 		 303 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  35.09 
 
 		 313 aa  52.8  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 424 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  34.35 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  34.35 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  32.77 
 
 		 358 aa  48.5  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  37.63 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0273  hypothetical protein  28.97 
 
 		 416 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3387  hypothetical protein  30.77 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  33.63 
 
 		 319 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  25.61 
 
 		 299 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  24.22 
 
 		 318 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6652  hypothetical protein  37.33 
 
 		 307 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.9585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  30.3 
 
 		 326 aa  42.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5446  hypothetical protein  34.18 
 
 		 108 aa  42  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  43.4 
 
 		 231 aa  42  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>