228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2420 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2420  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 		 161 aa  318  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  98.76 
 
 		 161 aa  315  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2549  putative nucleotide-binding protein  90.06 
 
 		 161 aa  293  6e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  85.09 
 
 		 161 aa  279  9e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  84.47 
 
 		 161 aa  278  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  83.85 
 
 		 161 aa  275  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  83.85 
 
 		 161 aa  274  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  83.23 
 
 		 161 aa  273  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  83.23 
 
 		 161 aa  273  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  83.23 
 
 		 161 aa  273  5e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  83.23 
 
 		 161 aa  273  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  83.23 
 
 		 161 aa  273  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  83.23 
 
 		 161 aa  273  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  83.23 
 
 		 161 aa  273  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  84.47 
 
 		 161 aa  273  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  82.61 
 
 		 161 aa  267  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0754  putative nucleotide-binding protein  83.85 
 
 		 161 aa  263  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3208  putative nucleotide-binding protein  83.23 
 
 		 161 aa  261  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0527  putative nucleotide-binding protein  85.09 
 
 		 161 aa  257  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.487699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0741  putative nucleotide-binding protein  83.85 
 
 		 161 aa  253  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2579  putative nucleotide-binding protein  83.23 
 
 		 161 aa  253  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1944  putative nucleotide-binding protein  83.23 
 
 		 161 aa  253  9e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.478874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2555  putative nucleotide-binding protein  83.23 
 
 		 161 aa  253  9e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.354154  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0290  hypothetical protein  70.81 
 
 		 161 aa  238  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0318  protein of unknown function DUF520  69.57 
 
 		 161 aa  235  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4781  putative nucleotide-binding protein  67.08 
 
 		 161 aa  227  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0520927  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1854  putative nucleotide-binding protein  66.46 
 
 		 161 aa  224  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2240  putative nucleotide-binding protein  67.7 
 
 		 161 aa  223  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.065474  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1242  hypothetical protein  65.43 
 
 		 168 aa  222  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.1131 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2750  putative nucleotide-binding protein  67.08 
 
 		 161 aa  222  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3769  putative nucleotide-binding protein  64.6 
 
 		 161 aa  216  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3039  hypothetical protein  65.43 
 
 		 162 aa  216  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2692  putative nucleotide-binding protein  61.49 
 
 		 161 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3464  putative nucleotide-binding protein  60.87 
 
 		 161 aa  209  9e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  61.49 
 
 		 161 aa  201  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  60.25 
 
 		 161 aa  198  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1596  putative nucleotide-binding protein  59.63 
 
 		 161 aa  192  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2671  putative nucleotide-binding protein  55.28 
 
 		 161 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1080  putative nucleotide-binding protein  56.44 
 
 		 163 aa  181  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  55.9 
 
 		 160 aa  177  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1706  putative nucleotide-binding protein  53.66 
 
 		 164 aa  174  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.280602  hitchhiker  0.00217335 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  52.8 
 
 		 161 aa  173  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1115  putative nucleotide-binding protein  54.04 
 
 		 160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 161 aa  167  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3156  putative nucleotide-binding protein  50.93 
 
 		 161 aa  167  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0811  putative nucleotide-binding protein  50.93 
 
 		 161 aa  167  8e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0782  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 161 aa  166  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  52.8 
 
 		 160 aa  164  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3815  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 161 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3028  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.208181  normal  0.91414 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  52.17 
 
 		 160 aa  162  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 		 161 aa  160  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4311  putative nucleotide-binding protein  51.55 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3646  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.507653  normal  0.0694826 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1902  putative nucleotide-binding protein  50.92 
 
 		 161 aa  158  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1993  putative nucleotide-binding protein  50.93 
 
 		 160 aa  157  4e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0973999  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0203  putative nucleotide-binding protein  50.93 
 
 		 160 aa  157  4e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  51.9 
 
 		 164 aa  157  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2893  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 		 161 aa  157  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003420  protein yajQ  48.45 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3443  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 		 161 aa  157  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000233798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3114  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 		 161 aa  156  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0770  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000279998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3724  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 		 161 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3532  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 		 161 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000707458 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0710  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 		 161 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3601  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 		 161 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  51.88 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2557  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.317915 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2254  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 		 160 aa  153  9e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000945037  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  46.58 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  46.58 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  52.2 
 
 		 163 aa  150  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  49.38 
 
 		 162 aa  150  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  52.17 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  51.23 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  51.23 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  51.23 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4497  putative nucleotide-binding protein  51.23 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  51.23 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1169  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1175  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  47.24 
 
 		 163 aa  147  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04099  nucleotide-binding protein  44.72 
 
 		 160 aa  147  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0101  putative nucleotide-binding protein  50.62 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1098  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157658  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1728  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 		 160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.499513  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0112  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609186  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 		 159 aa  144  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  46.63 
 
 		 163 aa  142  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4087  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.568883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3487  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660179  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57130  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 159 aa  141  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0095  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 		 162 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.615818  normal  0.24721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4966  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4421  putative nucleotide-binding protein  50.92 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425503  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>