More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2413 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  658    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  79.61 
 
 		 322 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  79 
 
 		 326 aa  498  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  62.26 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  61.39 
 
 		 325 aa  355  5e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  54.58 
 
 		 318 aa  347  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  55.37 
 
 		 320 aa  346  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  53.67 
 
 		 328 aa  341  8e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3459  hypothetical protein  56.44 
 
 		 324 aa  339  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  53.55 
 
 		 332 aa  335  3.9999999999999995e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  55.45 
 
 		 320 aa  335  7.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  54.86 
 
 		 325 aa  334  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  55.37 
 
 		 320 aa  333  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  55.37 
 
 		 320 aa  333  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  55.31 
 
 		 327 aa  330  3e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  53.49 
 
 		 353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  53.49 
 
 		 328 aa  325  9e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  51.26 
 
 		 324 aa  322  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1715  hypothetical protein  52.94 
 
 		 320 aa  322  6e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  51.33 
 
 		 328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  52.6 
 
 		 328 aa  318  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  48.47 
 
 		 321 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  48.47 
 
 		 321 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  48.72 
 
 		 320 aa  310  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  47.65 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  45.11 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  51.16 
 
 		 330 aa  300  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2981  hypothetical protein  50.67 
 
 		 322 aa  298  8e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2409  hypothetical protein  50.67 
 
 		 322 aa  298  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  46.95 
 
 		 326 aa  294  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4634  hypothetical protein  47.81 
 
 		 322 aa  293  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  48.03 
 
 		 322 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0879  hypothetical protein  46.63 
 
 		 322 aa  289  6e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  48.04 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  48.65 
 
 		 334 aa  286  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  47.52 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  45.39 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  48.47 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  45.25 
 
 		 329 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  45.64 
 
 		 330 aa  275  5e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  43.41 
 
 		 322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  45.42 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  45.11 
 
 		 339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  46.82 
 
 		 327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  43.93 
 
 		 328 aa  272  7e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  46.64 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  43.55 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.04 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  43.55 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  47.49 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42.47 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.77 
 
 		 328 aa  269  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  42.62 
 
 		 344 aa  269  5.9999999999999995e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.93 
 
 		 328 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  40.74 
 
 		 356 aa  266  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  43.44 
 
 		 322 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.86 
 
 		 360 aa  263  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.85 
 
 		 325 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  42.19 
 
 		 333 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  42.67 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  42.67 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  46.42 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.86 
 
 		 327 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  41.95 
 
 		 332 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2833  hypothetical protein  43.73 
 
 		 342 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226544  normal  0.225758 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  46.95 
 
 		 330 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  42.72 
 
 		 347 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.67 
 
 		 327 aa  258  7e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  45.91 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  42.68 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  45.64 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  42.62 
 
 		 322 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  42.62 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  39.27 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  42.46 
 
 		 326 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  42.52 
 
 		 335 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.69 
 
 		 349 aa  256  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  42.19 
 
 		 348 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  41.3 
 
 		 334 aa  255  9e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.48 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  41.33 
 
 		 339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  42.47 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.27 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.47 
 
 		 325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  43.1 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39.32 
 
 		 344 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.47 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  42.19 
 
 		 304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  41.95 
 
 		 334 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  41.88 
 
 		 323 aa  252  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  39.47 
 
 		 325 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3088  putative signal peptide protein  42.41 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0784453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  41.28 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  45.82 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.42 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  40.69 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  42.54 
 
 		 331 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  40.63 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  42.28 
 
 		 353 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.22 
 
 		 325 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>