74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2394 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2394  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 180 aa  360  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2801  protein of unknown function DUF1486  94.48 
 
 		 181 aa  303  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  63.25 
 
 		 182 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  60.98 
 
 		 187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  58.18 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  60.26 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  54.55 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0474  hypothetical protein  61.19 
 
 		 212 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  61.33 
 
 		 185 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  60.93 
 
 		 186 aa  174  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  61.33 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  61.33 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0455  hypothetical protein  58.96 
 
 		 212 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1703  hypothetical protein  59.06 
 
 		 185 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1729  hypothetical protein  59.06 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0373687  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0209  hypothetical protein  59.06 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0131745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1546  hypothetical protein  59.06 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0955  hypothetical protein  59.06 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949837  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1882  hypothetical protein  59.06 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0563369  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1104  hypothetical protein  59.06 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0489751  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4152  hypothetical protein  57.14 
 
 		 214 aa  164  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3693  hypothetical protein  57.14 
 
 		 214 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  43.61 
 
 		 179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  44.03 
 
 		 182 aa  117  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0930  putative lipoprotein  43.61 
 
 		 179 aa  117  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  41.35 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  41.35 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  42.11 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  43.28 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  42.11 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  41.79 
 
 		 182 aa  111  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  41.79 
 
 		 179 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  37.14 
 
 		 142 aa  87.4  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  36.8 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  35.66 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  28.35 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  28.33 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  32.03 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  31.93 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  30.47 
 
 		 140 aa  60.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  32.29 
 
 		 140 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  34.19 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6186  protein of unknown function DUF1486  35.11 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  25.58 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  32.65 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  30.53 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3560  protein of unknown function DUF1486  30.83 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  29.63 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  32.93 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  32.53 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  30.21 
 
 		 131 aa  52  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  25.45 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  35.8 
 
 		 149 aa  51.6  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2990  hypothetical protein  34.85 
 
 		 132 aa  51.2  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  34.18 
 
 		 123 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  26.67 
 
 		 137 aa  49.3  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1283  protein of unknown function DUF1486  27.73 
 
 		 132 aa  48.5  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7231  protein of unknown function DUF1486  21.8 
 
 		 149 aa  48.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.390995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0996  protein of unknown function DUF1486  26.95 
 
 		 173 aa  47.8  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  25.44 
 
 		 138 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  26.6 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0723  hypothetical protein  24.79 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2307  protein of unknown function DUF1486  27.66 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  25.22 
 
 		 144 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2718  protein of unknown function DUF1486  31.91 
 
 		 119 aa  44.7  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000849743  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  28.18 
 
 		 148 aa  44.7  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3104  hypothetical protein  31.25 
 
 		 85 aa  43.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0633963  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  26.74 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  25.4 
 
 		 284 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  25.58 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  30.43 
 
 		 126 aa  42.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  25.58 
 
 		 152 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.88 
 
 		 316 aa  41.2  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>