More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2363 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  97.49 
 
 		 438 aa  838    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 438 aa  860    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  70.75 
 
 		 454 aa  618  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  70.79 
 
 		 457 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  57.28 
 
 		 425 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  55.04 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  55.37 
 
 		 425 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  55.74 
 
 		 425 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  52.71 
 
 		 425 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  53.1 
 
 		 442 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  51.02 
 
 		 443 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  53.57 
 
 		 425 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  53.57 
 
 		 425 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  53.57 
 
 		 425 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  52.87 
 
 		 425 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  53.54 
 
 		 428 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  54.66 
 
 		 428 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  53.98 
 
 		 428 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  52.63 
 
 		 425 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  54.24 
 
 		 427 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  54.66 
 
 		 428 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  54.41 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  48.94 
 
 		 440 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  53.77 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  53.56 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  51.07 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  52.43 
 
 		 428 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  52.43 
 
 		 428 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  50.85 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  49.89 
 
 		 444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  50.25 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  51.18 
 
 		 461 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  49.65 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  49.77 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  50 
 
 		 435 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  50 
 
 		 435 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  48.92 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  50 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  49.65 
 
 		 435 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  50 
 
 		 435 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  50.62 
 
 		 431 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  51.23 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  50.98 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  50.98 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  48.67 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  50.98 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  50.98 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  50.98 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  50.36 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  50.98 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  50.98 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  47.11 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  48.45 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  49.16 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  47.92 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  47.81 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  48.45 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1342  major facilitator family transporter  46.72 
 
 		 425 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1266  major facilitator family transporter  46.72 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  46.72 
 
 		 452 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  47.64 
 
 		 436 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  46.02 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1004  major facilitator family transporter  45.94 
 
 		 413 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4150  major facilitator transporter  46.26 
 
 		 431 aa  368  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023959  normal  0.746651 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0563  putative integral membrane transport protein  45.94 
 
 		 413 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.827821  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3120  major facilitator superfamily MFS_1  46.94 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  46.68 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  46.06 
 
 		 436 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  47.65 
 
 		 439 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  46.63 
 
 		 425 aa  359  4e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  47.43 
 
 		 439 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  44.6 
 
 		 436 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  45.32 
 
 		 436 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  45.83 
 
 		 440 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  45.85 
 
 		 438 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  46.3 
 
 		 440 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 443 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 443 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  46.88 
 
 		 443 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  45.05 
 
 		 445 aa  349  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  45.05 
 
 		 445 aa  349  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  45.05 
 
 		 445 aa  348  8e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  45.05 
 
 		 445 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  45.16 
 
 		 445 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  47.33 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  43.45 
 
 		 448 aa  347  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  46.42 
 
 		 443 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  46.19 
 
 		 443 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  46.63 
 
 		 420 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  45.96 
 
 		 443 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3414  major facilitator superfamily MFS_1  43.53 
 
 		 438 aa  343  5e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  43.72 
 
 		 433 aa  340  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  46.41 
 
 		 440 aa  339  5e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  44.95 
 
 		 441 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  44.18 
 
 		 437 aa  339  7e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 466 aa  338  9e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  42.23 
 
 		 453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 431 aa  336  5e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  44 
 
 		 437 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  43.35 
 
 		 434 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>