13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2242 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2242  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 		 180 aa  374  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.589503 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  26.42 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3118  esterase  26.56 
 
 		 188 aa  52  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1853  GDSL family lipase  27.4 
 
 		 258 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00368029  hitchhiker  0.00000000000547531 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3443  esterase  22.8 
 
 		 188 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3416  esterase  22.63 
 
 		 188 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0484902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1829  esterase  22.63 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0305538  normal  0.13667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1966  lipolytic protein G-D-S-L family  31.29 
 
 		 245 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3427  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  22.4 
 
 		 188 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2233  hypothetical protein  31.29 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668167  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  25.64 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1070  GDSL family lipase  27.57 
 
 		 259 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1242  lipolytic protein G-D-S-L family  29.57 
 
 		 251 aa  40.8  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0146465  normal  0.0264869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>