More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2188 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  93.37 
 
 		 362 aa  687    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  98.9 
 
 		 363 aa  731    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  100 
 
 		 363 aa  738    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  83.7 
 
 		 362 aa  624  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  82.32 
 
 		 362 aa  618  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  75.41 
 
 		 362 aa  570  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  75.14 
 
 		 362 aa  566  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  73.2 
 
 		 362 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  71.07 
 
 		 363 aa  544  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  74.28 
 
 		 365 aa  545  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  75.94 
 
 		 362 aa  542  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.73 
 
 		 363 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  75.07 
 
 		 362 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.45 
 
 		 363 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  70.72 
 
 		 363 aa  534  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  70.52 
 
 		 363 aa  533  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.73 
 
 		 363 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  72.45 
 
 		 363 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  72.73 
 
 		 363 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  72.73 
 
 		 363 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  68.87 
 
 		 363 aa  526  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  70.33 
 
 		 364 aa  525  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  69.15 
 
 		 363 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  68.32 
 
 		 363 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  68.32 
 
 		 363 aa  519  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5766  hypothetical protein  72.18 
 
 		 363 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  67.13 
 
 		 362 aa  508  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0858  ParA family protein  73.91 
 
 		 362 aa  511  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  68.51 
 
 		 362 aa  510  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  68.51 
 
 		 362 aa  510  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2301  ParA family protein  73.33 
 
 		 362 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0712  ParA family protein  73.33 
 
 		 362 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2985  ParA family protein  73.33 
 
 		 362 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206576  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1213  putative ATP-binding protein  73.33 
 
 		 362 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  66.85 
 
 		 363 aa  501  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0822  hypothetical protein  68.6 
 
 		 363 aa  501  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1614  ParA family protein  73.33 
 
 		 362 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124069  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1061  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  73.33 
 
 		 362 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1055  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  73.33 
 
 		 362 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  66.3 
 
 		 363 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  63.91 
 
 		 363 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  66.76 
 
 		 363 aa  483  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1966  hypothetical protein  66.85 
 
 		 362 aa  478  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  62.53 
 
 		 363 aa  475  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  60.28 
 
 		 365 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  60.22 
 
 		 361 aa  442  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  60.71 
 
 		 358 aa  441  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  60.71 
 
 		 358 aa  441  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  59.17 
 
 		 365 aa  437  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  61.24 
 
 		 362 aa  436  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  58.06 
 
 		 374 aa  415  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  55.37 
 
 		 388 aa  396  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  56.43 
 
 		 364 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  56.73 
 
 		 364 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19290  small P-loop ATPase  54.85 
 
 		 364 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1406  hypothetical protein  56.11 
 
 		 362 aa  378  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.295791  normal  0.937662 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1098  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  57.1 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1127  hypothetical protein  56.73 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1138  hypothetical protein  57.1 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192644  normal  0.84977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4314  hypothetical protein  57.1 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1645  hypothetical protein  56.25 
 
 		 364 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19065  hypothetical protein  56.25 
 
 		 364 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0441543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4506  ParA family protein  56.52 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000372356 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  51.15 
 
 		 371 aa  368  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2048  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  53.69 
 
 		 370 aa  364  1e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.912388  normal  0.694942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2464  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  54.55 
 
 		 371 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00489956  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1887  Mrp protein  54.55 
 
 		 371 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.0176835 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2577  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  54.55 
 
 		 371 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252936  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2457  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  54.25 
 
 		 371 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000583453  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2219  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  53.56 
 
 		 373 aa  363  3e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0695756  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1978  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  55.02 
 
 		 371 aa  363  4e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000194849  hitchhiker  0.00590431 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1656  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  53.28 
 
 		 371 aa  360  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0291919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1731  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  53.28 
 
 		 371 aa  360  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1761  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  53.28 
 
 		 371 aa  360  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  66.8 
 
 		 285 aa  359  3e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  55.32 
 
 		 371 aa  359  4e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.240141 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0423  ATPase-like, ParA/MinD  53.11 
 
 		 376 aa  358  9.999999999999999e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2618  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  52.99 
 
 		 371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2115  ParA family protein  61.05 
 
 		 286 aa  351  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2392  putative ATPase  51.23 
 
 		 369 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1547  ParA family protein  49.58 
 
 		 356 aa  345  6e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.97129  hitchhiker  0.000107443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1288  putative ATPase  50.87 
 
 		 369 aa  344  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3043  putative ATPase  50.58 
 
 		 369 aa  344  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02043  antiporter inner membrane protein  51.47 
 
 		 369 aa  342  7e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1544  Mrp protein  51.47 
 
 		 369 aa  342  7e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.575104  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0855  putative ATPase  51.47 
 
 		 369 aa  342  7e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854635  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2248  putative ATPase  51.47 
 
 		 369 aa  342  7e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.958524  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1534  putative ATPase  51.47 
 
 		 369 aa  342  7e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2403  putative ATPase  51.47 
 
 		 369 aa  342  7e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02001  hypothetical protein  51.47 
 
 		 369 aa  342  7e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.758943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0930  putative ATPase  51.47 
 
 		 369 aa  342  7e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3096  putative ATPase  51.47 
 
 		 369 aa  342  7e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  47.93 
 
 		 357 aa  341  9e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  46.6 
 
 		 382 aa  341  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1878  NifH/FrxC domain-containing protein  58.42 
 
 		 306 aa  340  2e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  48.19 
 
 		 376 aa  340  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  47.19 
 
 		 375 aa  339  5e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3196  putative ATPase  49.55 
 
 		 370 aa  338  9e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  decreased coverage  0.00111363 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2454  putative ATPase  49.55 
 
 		 370 aa  338  9e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2553  putative ATPase  49.55 
 
 		 370 aa  338  9e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>