106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1980 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  100 
 
 		 98 aa  187  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  95.92 
 
 		 98 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2183  hypothetical protein  88.78 
 
 		 98 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  58.51 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  55.81 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  53.33 
 
 		 97 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  52.58 
 
 		 97 aa  94.4  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  53.49 
 
 		 97 aa  94  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  58.7 
 
 		 91 aa  93.2  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  45.68 
 
 		 386 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  43.88 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  40 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  43.59 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  46.15 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  43.02 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  38.37 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  40.7 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  38.37 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  38.89 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  41.49 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  39.36 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  40.85 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  37.5 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  40.66 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  35.71 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  38.37 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  39.36 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  35 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  35.71 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  39.77 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  38.1 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  34.15 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  31.25 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  36.67 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  32.35 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  35.63 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  27.27 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  32.26 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  54.76 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  41.43 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0560  hypothetical protein  43.18 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  43.1 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1034  hypothetical protein  31.88 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.383392  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  31.34 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  38.89 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  44.23 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  34.25 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  31.34 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  31.34 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  44.64 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  32.43 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  26.32 
 
 		 87 aa  48.1  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  30.77 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  30.77 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  30.77 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  30.77 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  32 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  32.1 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  30.77 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0801  hypothetical protein  36.23 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  34.55 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3301  hypothetical protein  46.43 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0901  hypothetical protein  47.83 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0772  hypothetical protein  47.83 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000133286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0720  hypothetical protein  47.83 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0244927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0707  hypothetical protein  47.83 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000547065  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  36.92 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0809  hypothetical protein  47.83 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909763  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  31.34 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0721  hypothetical protein  47.83 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000923081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0974  hypothetical protein  47.83 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0864  hypothetical protein  47.83 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4472  hypothetical protein  47.83 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.200573 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0905  hypothetical protein  47.83 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6700199999999999e-43 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2654  protein of unknown function DUF1232  46.43 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140494  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  35.59 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  42.55 
 
 		 105 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  29.49 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1449  hypothetical protein  44.29 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.808576  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1813  protein of unknown function DUF1232  37.04 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0842  protein of unknown function DUF1232  36.92 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1839  protein of unknown function DUF1232  37.04 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  32.69 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  45.21 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  29.49 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  33.78 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  33.78 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  32.43 
 
 		 121 aa  43.5  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1826  hypothetical protein  42.31 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  28.21 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1437  hypothetical protein  45.71 
 
 		 323 aa  42.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.973186  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1704  hypothetical protein  45.71 
 
 		 323 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0800873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4217  hypothetical protein  29.73 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  44.83 
 
 		 249 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  43.75 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  24.74 
 
 		 126 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  26.47 
 
 		 126 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  23.71 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  46.51 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  37.1 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>