245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1974 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  99.07 
 
 		 215 aa  436  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 		 215 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  89.3 
 
 		 215 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  67.76 
 
 		 216 aa  304  8.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  65.57 
 
 		 216 aa  289  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  64.15 
 
 		 218 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  64.15 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  64.65 
 
 		 218 aa  279  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  64.15 
 
 		 218 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  64.15 
 
 		 218 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  64.15 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  64.15 
 
 		 218 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  64.45 
 
 		 259 aa  278  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  63.68 
 
 		 256 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  64.65 
 
 		 218 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  64.65 
 
 		 218 aa  275  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  64.19 
 
 		 218 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  62.79 
 
 		 217 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  63.72 
 
 		 218 aa  271  7e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  63.72 
 
 		 218 aa  271  7e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  63.72 
 
 		 218 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  62.09 
 
 		 215 aa  265  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  60.47 
 
 		 217 aa  255  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  62.79 
 
 		 217 aa  254  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  57.21 
 
 		 218 aa  249  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  56.8 
 
 		 218 aa  242  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  56.59 
 
 		 218 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1115  hypothetical protein  55.61 
 
 		 218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000190238  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1167  allophanate hydrolase subunit 1  55.61 
 
 		 218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000046539  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  54.55 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  55.29 
 
 		 218 aa  228  5e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0025  allophanate hydrolase, subunit 1  53.77 
 
 		 215 aa  228  5e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  54.33 
 
 		 218 aa  228  7e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  52.4 
 
 		 218 aa  224  6e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  52.4 
 
 		 218 aa  224  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  52.4 
 
 		 218 aa  224  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  52.4 
 
 		 218 aa  224  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  52.4 
 
 		 218 aa  224  6e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  52.4 
 
 		 218 aa  224  7e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  53.17 
 
 		 218 aa  224  9e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  51.92 
 
 		 218 aa  223  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  53.37 
 
 		 218 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  53.37 
 
 		 218 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  53.37 
 
 		 218 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  53.37 
 
 		 218 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  52.4 
 
 		 218 aa  223  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  52.88 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0010  allophanate hydrolase subunit 1  50.7 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0012  hypothetical protein  48.57 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_003296  RS05394  hypothetical protein  46.7 
 
 		 222 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.493142 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0008  allophanate hydrolase subunit 1  46.51 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  46.98 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2920  conserved hypothetical protein TIGR00370  47.62 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00938953  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  50.98 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0023  hypothetical protein  48.21 
 
 		 220 aa  188  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309648 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6364  Allophanate hydrolase subunit 1  45.45 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1100  allophanate hydrolase subunit 1  46.3 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.724491  normal  0.149569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0899  Allophanate hydrolase subunit 1  48.31 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  43.41 
 
 		 246 aa  172  5e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  52.05 
 
 		 218 aa  167  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  40.87 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  48.85 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7657  hypothetical protein  38.86 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  43.87 
 
 		 230 aa  161  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  47.4 
 
 		 238 aa  161  7e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4554  Allophanate hydrolase subunit 1  37.62 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2594  Allophanate hydrolase subunit 1  38.97 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  36.41 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  37.38 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  47.65 
 
 		 242 aa  155  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  37.67 
 
 		 237 aa  155  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  45.03 
 
 		 242 aa  154  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6365  Allophanate hydrolase subunit 1  37.14 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.297553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  40.21 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  45.33 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  41.24 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  41.24 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  39.8 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  36.41 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  38.78 
 
 		 237 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  35.94 
 
 		 237 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  38.78 
 
 		 237 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  38.78 
 
 		 237 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  38.78 
 
 		 237 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  39.3 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  45 
 
 		 243 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1498  allophanate hydrolase subunit 1  40.76 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2813  hypothetical protein  47.67 
 
 		 257 aa  148  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.893374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  39.88 
 
 		 229 aa  145  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2977  allophanate hydrolase subunit 1  44.98 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358004  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1534  allophanate hydrolase subunit 1  46.67 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1814  Allophanate hydrolase subunit 1  47.22 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21016  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  45.81 
 
 		 253 aa  142  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2062  allophanate hydrolase subunit 1  37.24 
 
 		 233 aa  141  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.206067  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  49.11 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  42.72 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  48.6 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  41.12 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  43.62 
 
 		 539 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  44.08 
 
 		 235 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>