234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1943 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2126  fructose-1,6-bisphosphatase  95.27 
 
 
338 aa  677    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2266  fructose-1,6-bisphosphatase  97.92 
 
 
338 aa  690    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.014374  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1943  fructose-1,6-bisphosphatase  100 
 
 
338 aa  702    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.713905  normal  0.0350228 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2444  fructose-1,6-bisphosphatase  88.32 
 
 
339 aa  621  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0875  fructose-1,6-bisphosphatase  87.09 
 
 
338 aa  613  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0821253  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1586  fructose-1,6-bisphosphatase  80 
 
 
335 aa  558  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3263  fructose-1,6-bisphosphatase  78.08 
 
 
335 aa  557  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0139597  hitchhiker  0.00000000837949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1843  fructose-1,6-bisphosphatase  79.09 
 
 
335 aa  557  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0532341  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2775  fructose-1,6-bisphosphatase  77.48 
 
 
336 aa  555  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3795  fructose-1,6-bisphosphatase  77.41 
 
 
337 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2250  fructose-1,6-bisphosphatase  78.44 
 
 
339 aa  551  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.523394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2760  fructose-1,6-bisphosphatase  78.14 
 
 
339 aa  549  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1763  fructose-1,6-bisphosphatase  75.07 
 
 
341 aa  541  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106936 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1067  fructose-1,6-bisphosphatase  76.29 
 
 
335 aa  537  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.641395  normal  0.908963 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2704  fructose-1,6-bisphosphatase  75.68 
 
 
334 aa  537  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3071  fructose-1,6-bisphosphatase  75.82 
 
 
338 aa  531  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137108  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0920  fructose-1,6-bisphosphatase  75.52 
 
 
338 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.701252  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1149  fructose-1,6-bisphosphatase  74.7 
 
 
335 aa  529  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.191646  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0685  fructose-1,6-bisphosphatase  74.85 
 
 
338 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3283  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  71.43 
 
 
343 aa  518  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0469  fructose-1,6-bisphosphatase  72.24 
 
 
338 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3031  fructose-1,6-bisphosphatase  72.24 
 
 
338 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1604  fructose-1,6-bisphosphatase  72.24 
 
 
338 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45640  fructose-1,6-bisphosphatase  73.08 
 
 
337 aa  516  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191472  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2618  fructose-1,6-bisphosphatase  72.24 
 
 
338 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.36  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0990  fructose-1,6-bisphosphatase  72.24 
 
 
338 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2925  fructose-1,6-bisphosphatase  72.24 
 
 
338 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2987  fructose-1,6-bisphosphatase  72.24 
 
 
338 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0157  fructose-1,6-bisphosphatase  72.24 
 
 
338 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4125  fructose-1,6-bisphosphatase  71.56 
 
 
337 aa  511  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00362057  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2381  fructose-1,6-bisphosphatase  72.16 
 
 
337 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.881144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0535  fructose-1,6-bisphosphatase  72.46 
 
 
337 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0973  fructose-1,6-bisphosphatase  72.46 
 
 
337 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798772  normal  0.126092 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1014  fructose-1,6-bisphosphatase  72.46 
 
 
337 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32393  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0889  fructose-1,6-bisphosphatase  71.86 
 
 
339 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.138169  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0877  fructose-1,6-bisphosphatase  71.86 
 
 
339 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0798323  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67490  fructose-1,6-bisphosphatase  72.11 
 
 
336 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309201  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5843  fructose-1,6-bisphosphatase  72.11 
 
 
336 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0423  fructose-1,6-bisphosphatase  70.62 
 
 
336 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5040  fructose-1,6-bisphosphatase  70.62 
 
 
336 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5168  fructose-1,6-bisphosphatase  70.62 
 
 
336 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0370  fructose-1,6-bisphosphatase  70.75 
 
 
336 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0352  fructose-1,6-bisphosphatase  70.62 
 
 
336 aa  497  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5090  fructose-1,6-bisphosphatase  70.33 
 
 
336 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4914  fructose-1,6-bisphosphatase  70.33 
 
 
336 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0508  fructose-1,6-bisphosphatase  71.26 
 
 
335 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03469  fructose-1,6-bisphosphatase  67.26 
 
 
336 aa  476  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1409  fructose-1,6-bisphosphatase  69.97 
 
 
333 aa  477  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2577  fructose-1,6-bisphosphatase  67.48 
 
 
337 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.157967 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0020  fructose-1,6-bisphosphatase  67.98 
 
 
338 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000687853 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3589  D-fructose 1,6-bisphosphatase  69.79 
 
 
338 aa  460  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0270544 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0021  fructose-1,6-bisphosphatase  61.4 
 
 
335 aa  442  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193201  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0281  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  64.44 
 
 
336 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320713  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0084  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  62.84 
 
 
337 aa  438  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3755  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  61 
 
 
365 aa  431  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1859  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  61.16 
 
 
334 aa  426  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000101477  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1393  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  60 
 
 
364 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.834199  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0669  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  63.3 
 
 
335 aa  425  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1511  D-fructose 1,6-bisphosphatase  60.7 
 
 
365 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422669  decreased coverage  0.0000800022 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1982  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  57.97 
 
 
364 aa  423  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1187  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  61.89 
 
 
339 aa  419  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.146962 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2319  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  60.24 
 
 
338 aa  420  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.514677  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0368  fructose-1,6-bisphosphatase  59.82 
 
 
339 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.244889  normal  0.233864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3628  fructose-1,6-bisphosphatase  61.03 
 
 
357 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0189  fructose-1,6-bisphosphatase  59.82 
 
 
339 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0209227  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3026  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  59.04 
 
 
358 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00242569  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2788  D-fructose 1,6-bisphosphatase  57.01 
 
 
357 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450037  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3013  fructose-1,6-bisphosphatase  63.73 
 
 
322 aa  385  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514687  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2450  fructose-1,6-bisphosphatase  56.7 
 
 
378 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709501  normal  0.535256 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2636  D-fructose 1,6-bisphosphatase  56.5 
 
 
333 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0412723  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0586  D-fructose 1,6-bisphosphatase  52.84 
 
 
331 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000325166  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00214  fructose-1,6-bisphosphatase  53.43 
 
 
325 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2403  D-fructose 1,6-bisphosphatase  53.29 
 
 
369 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96213  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0599  fructose-1,6-bisphosphatase  57.63 
 
 
320 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000176806  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1495  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  54.65 
 
 
337 aa  364  1e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000616027  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4138  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  57.56 
 
 
319 aa  362  6e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000256898  unclonable  0.00000000000522982 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0242  fructose-1,6-bisphosphatase  53.47 
 
 
323 aa  360  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0389611  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3991  fructose-1,6-bisphosphatase  58.44 
 
 
325 aa  360  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0676  fructose-1,6-bisphosphatase  57.47 
 
 
330 aa  359  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000449089  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0648  fructose-1,6-bisphosphatase  57.79 
 
 
330 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000605795  hitchhiker  0.00000605277 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3770  fructose-1,6-bisphosphatase  56.73 
 
 
329 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000161659  hitchhiker  0.001107 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0813  fructose-1,6-bisphosphatase  56.73 
 
 
329 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  hitchhiker  0.000279081 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0784  fructose-1,6-bisphosphatase  58.12 
 
 
342 aa  355  5e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0298171  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0649  fructose-1,6-bisphosphatase  58.12 
 
 
330 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000012106  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3373  fructose-1,6-bisphosphatase  58.12 
 
 
330 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000187487  hitchhiker  0.00208925 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3721  fructose-1,6-bisphosphatase  57.79 
 
 
330 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.10391  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0773  fructose-1,6-bisphosphatase  56.41 
 
 
329 aa  353  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  normal  0.0106002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3663  fructose-1,6-bisphosphatase  57.47 
 
 
325 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0199188  hitchhiker  0.00000825139 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3844  fructose-1,6-bisphosphatase  57.47 
 
 
325 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0810382  unclonable  0.00000976669 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0731  fructose-1,6-bisphosphatase  56.07 
 
 
329 aa  351  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000293174  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0531  fructose-1,6-bisphosphatase  57.37 
 
 
330 aa  349  5e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.012262  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2986  fructose-1,6-bisphosphatase  56.41 
 
 
330 aa  344  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1857  fructose-1,6-bisphosphatase  51.03 
 
 
334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000262461  hitchhiker  0.000253993 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4614  fructose-1,6-bisphosphatase  50.94 
 
 
322 aa  334  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0541  fructose-1,6-bisphosphatase  53.33 
 
 
327 aa  328  6e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0530  fructose-1,6-bisphosphatase  53.82 
 
 
327 aa  328  6e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.059521  normal  0.0102388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1481  D-fructose 1,6-bisphosphatase  56.06 
 
 
351 aa  323  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3920  fructose-1,6-bisphosphatase  47.01 
 
 
349 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1278  D-fructose 1,6-bisphosphatase  48.29 
 
 
322 aa  306  4.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438051  normal  0.25369 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1136  fructose-1,6-bisphosphatase  46.02 
 
 
338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.510745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>