272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1925 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  94.75 
 
 
345 aa  664    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  98.84 
 
 
345 aa  696    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  100 
 
 
345 aa  702    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  74.64 
 
 
354 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  74.64 
 
 
351 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  69.3 
 
 
341 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  69.3 
 
 
341 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  69.59 
 
 
341 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  69.01 
 
 
341 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  69.01 
 
 
341 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  69.01 
 
 
341 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  69.01 
 
 
341 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  69.01 
 
 
341 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  67.25 
 
 
341 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  68.36 
 
 
350 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  67.35 
 
 
341 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  67.35 
 
 
341 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  68.36 
 
 
350 aa  461  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  67.35 
 
 
682 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  66.08 
 
 
341 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  67.35 
 
 
682 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  65.5 
 
 
341 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  66.76 
 
 
346 aa  454  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  65.79 
 
 
346 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1138  adenosine deaminase  68.6 
 
 
375 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0503551  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1487  adenosine deaminase  65.22 
 
 
360 aa  450  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  67.46 
 
 
357 aa  448  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  66.57 
 
 
365 aa  438  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  67.56 
 
 
350 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  63.02 
 
 
349 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  66.27 
 
 
349 aa  435  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  64.04 
 
 
350 aa  433  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  64.94 
 
 
355 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  62.76 
 
 
345 aa  424  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  64.51 
 
 
343 aa  421  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3742  adenosine deaminase  65.23 
 
 
356 aa  414  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  63.41 
 
 
341 aa  409  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  63.32 
 
 
335 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1236  adenosine deaminase  59.04 
 
 
338 aa  391  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0317068  normal  0.0334679 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  54.52 
 
 
332 aa  388  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  57.1 
 
 
328 aa  383  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2715  adenosine deaminase  57.94 
 
 
339 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  57.35 
 
 
339 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0692  adenosine deaminase  57.74 
 
 
335 aa  381  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2420  adenosine deaminase  56.34 
 
 
338 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  56.35 
 
 
337 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  55.92 
 
 
361 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  59.74 
 
 
315 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  59.05 
 
 
334 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  53.37 
 
 
335 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  57.79 
 
 
315 aa  364  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1359  adenosine deaminase  54.3 
 
 
336 aa  361  9e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  53.92 
 
 
336 aa  361  1e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  57.23 
 
 
318 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  55.8 
 
 
315 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  53.78 
 
 
335 aa  359  3e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  56.74 
 
 
316 aa  359  4e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  56.11 
 
 
316 aa  359  5e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  57.23 
 
 
315 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  56.91 
 
 
317 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  56.91 
 
 
315 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  0.0000731257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2485  adenosine deaminase  57.99 
 
 
339 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  55.83 
 
 
329 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  55.95 
 
 
317 aa  355  5e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  54.49 
 
 
347 aa  354  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  54.49 
 
 
347 aa  354  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1922  adenosine deaminase  51.51 
 
 
335 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0868  adenosine deaminase  54.15 
 
 
343 aa  351  1e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  55.73 
 
 
378 aa  350  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  56.27 
 
 
317 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  54.01 
 
 
353 aa  339  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  51.08 
 
 
330 aa  339  4e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1983  adenosine deaminase  54.15 
 
 
341 aa  333  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  50.75 
 
 
341 aa  332  4e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  55.73 
 
 
328 aa  331  9e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  50.46 
 
 
338 aa  322  6e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2140  Adenosine deaminase  48.5 
 
 
333 aa  315  8e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4345  adenosine deaminase  51.53 
 
 
341 aa  315  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3185  adenosine deaminase  47.6 
 
 
341 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175868  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  46.93 
 
 
343 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12620  adenosine deaminase  49.41 
 
 
342 aa  311  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.341302 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1580  adenosine deaminase  45.98 
 
 
344 aa  308  8e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3173  adenosine deaminase  43.95 
 
 
337 aa  295  7e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523168  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1623  adenosine deaminase  46.63 
 
 
348 aa  293  3e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000946947  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0809  adenosine deaminase  45.43 
 
 
338 aa  290  3e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2390  adenosine deaminase  43.24 
 
 
346 aa  289  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03345  Adenosine deaminase  45.76 
 
 
337 aa  281  9e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06078  Adenosine deaminase (EC 3.5.4.4)(Adenosine aminohydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8X1T6]  41.54 
 
 
364 aa  253  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140027  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59156  adenine aminohydrolase (adenine deaminase)  41.49 
 
 
355 aa  246  3e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0307453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  32.14 
 
 
346 aa  193  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl215  adenosine deaminase  31.94 
 
 
334 aa  192  1e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  34.02 
 
 
346 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5348  adenosine deaminase  39.08 
 
 
352 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  33.85 
 
 
366 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  33.64 
 
 
353 aa  182  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  37.72 
 
 
368 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3344  adenosine deaminase  35.31 
 
 
324 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  31.29 
 
 
354 aa  169  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1597  adenosine deaminase  34.59 
 
 
327 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0278  adenosine deaminase  34.28 
 
 
327 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>