More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1845 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
259 aa  528  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2169  enoyl-CoA hydratase  98.46 
 
 
259 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.086116  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2014  enoyl-CoA hydratase  88.8 
 
 
259 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.49745  normal  0.0415975 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0973  enoyl-CoA hydratase  69.5 
 
 
259 aa  364  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1009  enoyl-CoA hydratase  70.27 
 
 
259 aa  349  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1370  enoyl-CoA hydratase  59.16 
 
 
262 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57851  hitchhiker  0.00300055 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1984  enoyl-CoA hydratase  58.78 
 
 
262 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1086  enoyl-CoA hydratase  59.54 
 
 
355 aa  277  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.695016  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3185  enoyl-CoA hydratase  58.02 
 
 
262 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2958  enoyl-CoA hydratase  55.6 
 
 
259 aa  272  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1615  enoyl-CoA hydratase  59.16 
 
 
263 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2227  enoyl-CoA hydratase  59.16 
 
 
263 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0439  enoyl-CoA hydratase  59.54 
 
 
263 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1803  enoyl-CoA hydratase  59.54 
 
 
263 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1156  enoyl-CoA hydratase  59.54 
 
 
263 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0739971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1463  enoyl-CoA hydratase  59.54 
 
 
263 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1325  enoyl-CoA hydratase  59.54 
 
 
263 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0712  enoyl-CoA hydratase  59.54 
 
 
263 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.518843  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1316  enoyl-CoA hydratase  59.54 
 
 
263 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2251  enoyl-CoA hydratase  59.16 
 
 
263 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2265  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 
263 aa  258  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2144  enoyl-CoA hydratase  59.16 
 
 
263 aa  254  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309295  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1914  enoyl-CoA hydratase  55.98 
 
 
259 aa  251  8.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.483428  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1050  enoyl-CoA hydratase  57.25 
 
 
263 aa  244  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00724493  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5555  enoyl-CoA hydratase  59.16 
 
 
263 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3074  enoyl-CoA hydratase  50.97 
 
 
259 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.438206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2631  enoyl-CoA hydratase  51.94 
 
 
259 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0399422  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.46 
 
 
255 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.540838  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1942  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.46 
 
 
255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2240  enoyl-CoA hydratase  45.35 
 
 
272 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1949  enoyl-CoA hydratase  45 
 
 
257 aa  199  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.94 
 
 
261 aa  193  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0840  enoyl-CoA hydratase  44.88 
 
 
273 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0193834  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2591  enoyl-CoA hydratase  41.86 
 
 
268 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156463  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4311  enoyl-CoA hydratase  44.75 
 
 
269 aa  168  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.96 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3016  enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1397  enoyl-CoA hydratase  43.7 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3735  enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 
276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
262 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 
260 aa  158  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.66 
 
 
265 aa  156  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
260 aa  155  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 
256 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.43 
 
 
266 aa  154  9e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  39 
 
 
266 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  34.15 
 
 
263 aa  153  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.59 
 
 
262 aa  152  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39 
 
 
259 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  35.08 
 
 
263 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
265 aa  150  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 
267 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  33.59 
 
 
261 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.44 
 
 
256 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 
264 aa  149  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 
263 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.48 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 
275 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.66 
 
 
260 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0026  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.82 
 
 
262 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0655  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
261 aa  144  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  35.09 
 
 
266 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  34.41 
 
 
263 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  33.7 
 
 
268 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
263 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
261 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 
255 aa  142  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  33.07 
 
 
255 aa  142  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  32.68 
 
 
255 aa  142  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
280 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.53 
 
 
264 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 
264 aa  142  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.84 
 
 
264 aa  142  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 
273 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.15 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.77 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4083  enoyl-CoA hydratase  35.39 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543803  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  32.3 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  34.01 
 
 
263 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.03 
 
 
259 aa  140  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 
275 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 
263 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.64 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.57 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 
267 aa  139  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  35.37 
 
 
262 aa  139  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 
263 aa  138  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 
269 aa  138  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 
269 aa  138  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
258 aa  138  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  36.73 
 
 
263 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 
287 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
265 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0598  enoyl-CoA hydratase  32.79 
 
 
258 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 
262 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 
269 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>