79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1839 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2008  hypothetical protein  89.76 
 
 		 381 aa  702    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0949497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1839  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 		 381 aa  789    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419157  normal  0.0171769 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2163  peptidase M14 carboxypeptidase A  97.9 
 
 		 381 aa  776    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304741  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0979  peptidase M14, carboxypeptidase A  72.53 
 
 		 380 aa  588  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1015  peptidase M14, carboxypeptidase A  71.73 
 
 		 380 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1978  peptidase M14 carboxypeptidase A  66.84 
 
 		 388 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3179  zinc carboxypeptidase  67.02 
 
 		 384 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129073  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1322  zinc carboxypeptidase family protein  66.76 
 
 		 384 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111007  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1376  peptidase M14 carboxypeptidase A  67.29 
 
 		 384 aa  537  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0445  zinc carboxypeptidase family protein  66.49 
 
 		 384 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1331  zinc carboxypeptidase family protein  66.49 
 
 		 384 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1798  hypothetical protein  66.22 
 
 		 384 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117776  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1468  peptidase  66.49 
 
 		 384 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000305268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0707  zinc carboxypeptidase family protein  66.49 
 
 		 384 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1162  zinc carboxypeptidase family protein  66.22 
 
 		 384 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000370841  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1055  peptidase M14 carboxypeptidase A  67.59 
 
 		 384 aa  522  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387993  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2260  peptidase M14, carboxypeptidase A  67.04 
 
 		 384 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2139  peptidase M14 carboxypeptidase A  67.04 
 
 		 384 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  normal  0.791166 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1091  zinc carboxypeptidase family protein  66.49 
 
 		 384 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175299  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5550  peptidase M14, carboxypeptidase A  66.76 
 
 		 384 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400192  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2222  peptidase M14, carboxypeptidase A  66.48 
 
 		 384 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2246  peptidase M14 carboxypeptidase A  66.2 
 
 		 384 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1610  peptidase M14, carboxypeptidase A  66.48 
 
 		 384 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2160  peptidase M14 carboxypeptidase A  59.09 
 
 		 379 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.746604  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3575  peptidase M14, carboxypeptidase A  54.09 
 
 		 383 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.577581  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2558  zinc carboxypeptidase family protein  52 
 
 		 380 aa  411  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2073  peptidase M14 carboxypeptidase A  53.39 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2257  peptidase M14 carboxypeptidase A  52.3 
 
 		 375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328738  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1465  peptidase M14, carboxypeptidase A  52.83 
 
 		 376 aa  404  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000868597  normal  0.0173526 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1942  peptidase M14, carboxypeptidase A  52.16 
 
 		 375 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2149  peptidase M14, carboxypeptidase A  51.35 
 
 		 374 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.385121  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2415  peptidase M14 carboxypeptidase A  51.62 
 
 		 375 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  52.03 
 
 		 376 aa  394  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11613  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1960  peptidase M14, carboxypeptidase A  51.62 
 
 		 375 aa  391  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240759  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2424  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  51.89 
 
 		 375 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2047  peptidase M14 carboxypeptidase A  51.62 
 
 		 375 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  hitchhiker  0.0000000000723635 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2073  peptidase M14, carboxypeptidase A  51.35 
 
 		 375 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0474309  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2051  peptidase M14 carboxypeptidase A  51.35 
 
 		 375 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.888658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2300  peptidase M14 carboxypeptidase A  51.35 
 
 		 375 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000207192  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0268  peptidase M14, carboxypeptidase A  50 
 
 		 375 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  50.67 
 
 		 375 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1231  peptidase M14, carboxypeptidase A  51.87 
 
 		 378 aa  386  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601484 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  51.08 
 
 		 375 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00901911  hitchhiker  0.0000123678 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01259  predicted carboxypeptidase, Zn dependent  49.46 
 
 		 379 aa  384  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04891  zinc-carboxypeptidase  48.11 
 
 		 400 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2315  peptidase M14, carboxypeptidase A  49.46 
 
 		 375 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000568724  hitchhiker  0.00110139 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1641  peptidase M14, carboxypeptidase A  50.41 
 
 		 375 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000756  zinc carboxypeptidase domain protein  48.65 
 
 		 374 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000314112  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3113  peptidase M14, carboxypeptidase A  52.28 
 
 		 380 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  51.48 
 
 		 375 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  49.19 
 
 		 375 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0079  zinc carboxypeptidase  48.4 
 
 		 374 aa  373  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1240  peptidase M14, carboxypeptidase A  47.61 
 
 		 379 aa  359  6e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.398831  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1804  peptidase M14 carboxypeptidase A  44.85 
 
 		 382 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0544452  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2324  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  48.38 
 
 		 375 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1964  peptidase M14 carboxypeptidase A  43.98 
 
 		 382 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0593717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  45.67 
 
 		 378 aa  346  4e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2364  hypothetical protein  43.98 
 
 		 382 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0816102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3278  peptidase M14, carboxypeptidase A  47.77 
 
 		 376 aa  342  5e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.546138  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3331  peptidase M14, carboxypeptidase A  43.46 
 
 		 382 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27470  putative zinc carboxypeptidase  47.57 
 
 		 375 aa  338  9e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152383  normal  0.163866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2832  peptidase M14, carboxypeptidase A  48.24 
 
 		 369 aa  338  9e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1338  peptidase M14, carboxypeptidase A  44.27 
 
 		 375 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.412426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3662  peptidase M14, carboxypeptidase A  44.05 
 
 		 383 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000173445  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49091  predicted protein  40.2 
 
 		 459 aa  259  8e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1582  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.83 
 
 		 405 aa  90.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00197244  normal  0.432396 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2784  hypothetical protein  28.93 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.5 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0741  hypothetical protein  28.74 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.849095  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.7 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  26.11 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.67 
 
 		 497 aa  52.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  25 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.74 
 
 		 453 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5276  hypothetical protein  28.95 
 
 		 437 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  26.53 
 
 		 351 aa  45.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.76 
 
 		 609 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1725  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.12 
 
 		 355 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  26.64 
 
 		 490 aa  43.5  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217728 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>