More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1706 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 121 aa  246  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  97.52 
 
 		 121 aa  241  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  84.82 
 
 		 121 aa  192  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  72.22 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  65.05 
 
 		 227 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  55.86 
 
 		 107 aa  123  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  60.44 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  60.44 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  61 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  53.92 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 		 104 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  56.99 
 
 		 105 aa  116  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  55.66 
 
 		 116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 116 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 116 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  55.79 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  56.99 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  59.78 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 116 aa  110  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 		 116 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  51.89 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 96 aa  105  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  51.96 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  51.65 
 
 		 110 aa  103  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  47.57 
 
 		 103 aa  103  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1085  ArsR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 115 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0694077  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  58.14 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  51.65 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0937  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0359  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0445  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1900  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428282  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0202  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 109 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1404  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1814  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  59.74 
 
 		 110 aa  100  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 116 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  43.4 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  50.46 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  45.65 
 
 		 116 aa  92  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  54.08 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  49.47 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  44.83 
 
 		 115 aa  90.1  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  44.66 
 
 		 117 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 127 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  45.71 
 
 		 111 aa  90.1  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  47.19 
 
 		 114 aa  90.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  46.24 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 122 aa  86.7  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  40.95 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  42.06 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  40.86 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  47.92 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1527  regulatory protein ArsR  45.71 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  45.26 
 
 		 98 aa  84  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  43.96 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 113 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3220  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  47.25 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  45.26 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  43.16 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  42.59 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  43.16 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 98 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4378  ArsR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0649635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 98 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2896  regulatory protein ArsR  52.94 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4967  transcriptional regulator, ArsR family  44.14 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  47.25 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  42.11 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4262  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>