More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1577 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
285 aa  582  1e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  98.95 
 
 
310 aa  574  1e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  92.96 
 
 
285 aa  521  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  68.31 
 
 
284 aa  387  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  66.67 
 
 
307 aa  371  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  63.12 
 
 
279 aa  347  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  62.24 
 
 
279 aa  345  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  63.12 
 
 
279 aa  341  8e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  62.14 
 
 
316 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  61.79 
 
 
281 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  62.14 
 
 
316 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  60.36 
 
 
281 aa  329  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  60.36 
 
 
281 aa  329  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  60.36 
 
 
281 aa  329  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  60.36 
 
 
281 aa  329  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  60.36 
 
 
281 aa  329  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  61.07 
 
 
316 aa  329  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  61.07 
 
 
281 aa  329  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  60.36 
 
 
454 aa  328  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  61.79 
 
 
281 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  62.5 
 
 
281 aa  328  8e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  60.36 
 
 
568 aa  327  2e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  59.64 
 
 
281 aa  323  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0913  phosphoserine phosphatase SerB  57.14 
 
 
296 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.697374  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  56.02 
 
 
296 aa  256  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  50.88 
 
 
279 aa  254  1e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  48.59 
 
 
302 aa  254  2e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  58.8 
 
 
235 aa  248  8e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  52.99 
 
 
276 aa  246  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  54.59 
 
 
281 aa  243  2e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  57.28 
 
 
241 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  55.71 
 
 
236 aa  233  2e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  47.35 
 
 
275 aa  230  3e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  58.33 
 
 
237 aa  228  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  54.93 
 
 
236 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  54.17 
 
 
237 aa  226  5e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  52.56 
 
 
237 aa  215  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  49.32 
 
 
264 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  47.3 
 
 
278 aa  209  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  7.07909e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  46.84 
 
 
405 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  52.09 
 
 
237 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  49.36 
 
 
410 aa  208  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  48.73 
 
 
438 aa  206  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  49.79 
 
 
412 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  48.48 
 
 
280 aa  202  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  47.81 
 
 
408 aa  203  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  42.28 
 
 
410 aa  201  9e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  48.94 
 
 
405 aa  199  4e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  46.22 
 
 
418 aa  199  4e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  46.22 
 
 
418 aa  198  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  44.28 
 
 
411 aa  198  1e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2506  phosphoserine phosphatase SerB  53.52 
 
 
238 aa  197  2e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  46.22 
 
 
415 aa  197  2e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3159  phosphoserine phosphatase  53.52 
 
 
238 aa  197  2e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  46.22 
 
 
404 aa  197  2e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  45.61 
 
 
410 aa  197  2e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  46.22 
 
 
404 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  46.06 
 
 
404 aa  196  5e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  48.09 
 
 
405 aa  196  5e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  48.51 
 
 
405 aa  195  7e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  45.8 
 
 
429 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  52.45 
 
 
411 aa  193  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  44.35 
 
 
326 aa  192  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  51.94 
 
 
432 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  43.39 
 
 
369 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  45.33 
 
 
413 aa  190  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  47.9 
 
 
406 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  44.96 
 
 
404 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  44.96 
 
 
429 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  44.54 
 
 
404 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  43.93 
 
 
326 aa  189  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  46.05 
 
 
404 aa  188  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  44.73 
 
 
406 aa  187  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  45.8 
 
 
404 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  49.27 
 
 
400 aa  187  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  47.83 
 
 
419 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  49.02 
 
 
400 aa  186  4e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  43.33 
 
 
398 aa  186  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  51.69 
 
 
372 aa  184  1e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  1.17789e-07  unclonable  3.04475e-11 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  51.69 
 
 
327 aa  184  2e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  44.21 
 
 
328 aa  184  2e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  39.78 
 
 
289 aa  182  5e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  47.55 
 
 
292 aa  182  8e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  43.51 
 
 
298 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  46.03 
 
 
407 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  40.5 
 
 
291 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  47.28 
 
 
429 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  43.13 
 
 
298 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  48.77 
 
 
325 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  45.57 
 
 
420 aa  179  6e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  40.37 
 
 
322 aa  179  6e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  44.21 
 
 
398 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  7.52134e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  46.64 
 
 
403 aa  176  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  40.74 
 
 
409 aa  176  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  48.04 
 
 
306 aa  176  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  40.34 
 
 
400 aa  175  7e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  42.15 
 
 
325 aa  175  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  40.5 
 
 
291 aa  174  1e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  49.51 
 
 
406 aa  174  1e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  46.34 
 
 
435 aa  174  2e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>