57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1512 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  100 
 
 		 768 aa  1597    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  43.53 
 
 		 791 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  44.87 
 
 		 733 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  45.51 
 
 		 726 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  38.42 
 
 		 802 aa  213  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  33.49 
 
 		 815 aa  189  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04689  hypothetical protein  31.25 
 
 		 740 aa  185  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21490  hypothetical protein  33.05 
 
 		 882 aa  172  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.680315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02034  hypothetical protein  34.27 
 
 		 720 aa  171  7e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  31.22 
 
 		 530 aa  165  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  34.75 
 
 		 800 aa  151  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  32.92 
 
 		 539 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2701  hypothetical protein  41 
 
 		 802 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1768  hypothetical protein  40.61 
 
 		 802 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1609  hypothetical protein  40.61 
 
 		 769 aa  134  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1584  hypothetical protein  40.61 
 
 		 769 aa  134  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  41.86 
 
 		 308 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  30.14 
 
 		 462 aa  110  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4489  hypothetical protein  31.84 
 
 		 577 aa  104  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5734  hypothetical protein  31.84 
 
 		 577 aa  104  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.363284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5125  hypothetical protein  31.84 
 
 		 577 aa  104  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02032  hypothetical protein  29.9 
 
 		 299 aa  91.3  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  27.78 
 
 		 963 aa  83.2  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0479  hypothetical protein  32.29 
 
 		 753 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2626  hypothetical protein  32.29 
 
 		 753 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18473  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2919  hypothetical protein  23.6 
 
 		 764 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  26.9 
 
 		 960 aa  78.2  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  27.75 
 
 		 969 aa  77  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0415  hypothetical protein  24.22 
 
 		 764 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.762934 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  29.04 
 
 		 453 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3709  hypothetical protein  28.81 
 
 		 436 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  28.74 
 
 		 1118 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1565  hypothetical protein  27.63 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  33.95 
 
 		 675 aa  67  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  31.18 
 
 		 615 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  24.42 
 
 		 522 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3320  hypothetical protein  28.28 
 
 		 670 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  28.48 
 
 		 686 aa  64.3  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  26.87 
 
 		 494 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  25.57 
 
 		 435 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06791  hypothetical protein  25.53 
 
 		 503 aa  58.9  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  24.93 
 
 		 698 aa  58.5  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  23.75 
 
 		 1892 aa  57  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  27.08 
 
 		 514 aa  54.3  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  29.59 
 
 		 341 aa  50.8  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  26.14 
 
 		 1338 aa  50.8  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  27.93 
 
 		 523 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3334  hypothetical protein  27.43 
 
 		 513 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  27.27 
 
 		 424 aa  48.9  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  23.4 
 
 		 721 aa  48.9  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  24.36 
 
 		 406 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  32.37 
 
 		 777 aa  47  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  32.17 
 
 		 427 aa  46.6  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  28.29 
 
 		 347 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  24.92 
 
 		 407 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  26.83 
 
 		 345 aa  44.7  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  24.44 
 
 		 349 aa  45.1  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>