More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1498 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 		 128 aa  272  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  99.22 
 
 		 128 aa  271  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  90.62 
 
 		 128 aa  253  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  87.2 
 
 		 140 aa  239  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  86.4 
 
 		 140 aa  237  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  83.59 
 
 		 135 aa  234  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  81.25 
 
 		 136 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  70.97 
 
 		 134 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  69.35 
 
 		 138 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  66.13 
 
 		 132 aa  185  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  66.13 
 
 		 133 aa  184  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6170  protein-methionine-S-oxide reductase  68.55 
 
 		 143 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1909  methionine-R-sulfoxide reductase  68.55 
 
 		 143 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1897  methionine-R-sulfoxide reductase  67.74 
 
 		 143 aa  183  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1932  methionine-R-sulfoxide reductase  67.74 
 
 		 143 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0939518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5210  protein-methionine-S-oxide reductase  67.74 
 
 		 143 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304973 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1365  methionine-R-sulfoxide reductase  67.74 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  64 
 
 		 141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1827  methionine-R-sulfoxide reductase  66.94 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186679  normal  0.561809 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  66.13 
 
 		 130 aa  179  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1205  methionine-R-sulfoxide reductase  67.48 
 
 		 151 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1441  methionine-R-sulfoxide reductase  67.48 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3373  methionine-R-sulfoxide reductase  67.48 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2873  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1932  methionine-R-sulfoxide reductase  67.48 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2298  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 		 161 aa  176  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.52536  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2337  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 		 151 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2458  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2139  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.142771  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  59.69 
 
 		 136 aa  173  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  62.1 
 
 		 132 aa  171  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  61.29 
 
 		 134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  58.91 
 
 		 136 aa  170  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2948  methionine-R-sulfoxide reductase  63.57 
 
 		 137 aa  170  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  59.02 
 
 		 132 aa  170  5.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  61.9 
 
 		 131 aa  168  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  59.02 
 
 		 141 aa  168  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2936  methionine-R-sulfoxide reductase  61.24 
 
 		 136 aa  167  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.509394  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  59.68 
 
 		 135 aa  167  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  60.48 
 
 		 159 aa  167  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1801  methionine-R-sulfoxide reductase  62.02 
 
 		 137 aa  167  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  57.26 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  61.48 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  57.26 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  62.9 
 
 		 138 aa  166  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  57.26 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  58.06 
 
 		 134 aa  165  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2342  methionine-R-sulfoxide reductase  58.2 
 
 		 125 aa  164  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929654  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  60.48 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  61.29 
 
 		 183 aa  164  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  61.6 
 
 		 133 aa  164  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  60.48 
 
 		 136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  61.29 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  58.73 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  58.73 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  60.48 
 
 		 137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  58.2 
 
 		 137 aa  161  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  58.06 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  58.68 
 
 		 137 aa  161  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  56.45 
 
 		 136 aa  161  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1676  methionine-R-sulfoxide reductase  59.69 
 
 		 137 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2028  methionine-R-sulfoxide reductase  59.69 
 
 		 137 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  60.48 
 
 		 137 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  60.48 
 
 		 137 aa  159  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  58.06 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  60.33 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2396  protein-methionine-S-oxide reductase  55.04 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121368  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  54.84 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  55.56 
 
 		 144 aa  158  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  56.45 
 
 		 134 aa  157  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  57.26 
 
 		 133 aa  157  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  57.26 
 
 		 131 aa  157  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  60.66 
 
 		 140 aa  157  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  57.26 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  57.26 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  56.45 
 
 		 148 aa  157  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  56.8 
 
 		 166 aa  157  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3301  methionine-R-sulfoxide reductase  57.36 
 
 		 137 aa  156  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298432 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 131 aa  156  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  55.65 
 
 		 131 aa  156  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  55.65 
 
 		 131 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  58.87 
 
 		 137 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  56.45 
 
 		 131 aa  155  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  57.26 
 
 		 127 aa  155  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  54.84 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  54.84 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  54.84 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  56.2 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  56.45 
 
 		 132 aa  154  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  54.84 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1418  methionine sulfoxide reductase B  53.12 
 
 		 137 aa  154  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.445758 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2065  methionine sulfoxide reductase B  53.12 
 
 		 137 aa  154  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.717826  hitchhiker  0.00120288 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  55.2 
 
 		 136 aa  154  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1402  methionine sulfoxide reductase B  53.12 
 
 		 137 aa  154  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  hitchhiker  0.0051199 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1385  methionine sulfoxide reductase B  53.12 
 
 		 137 aa  154  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0497198  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  54.03 
 
 		 177 aa  153  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  54.84 
 
 		 131 aa  153  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2975  protein-methionine-S-oxide reductase  57.03 
 
 		 135 aa  153  9e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0725689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>