More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1448 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 403 aa  756    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  99.26 
 
 		 403 aa  752    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  90.32 
 
 		 403 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  90.32 
 
 		 403 aa  632  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  90.2 
 
 		 400 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  89.95 
 
 		 400 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  90.95 
 
 		 399 aa  618  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  90.24 
 
 		 379 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  58.84 
 
 		 395 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  64.43 
 
 		 401 aa  418  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  57.07 
 
 		 413 aa  401  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  54.96 
 
 		 400 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  54.16 
 
 		 408 aa  371  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  50.28 
 
 		 401 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  47.59 
 
 		 451 aa  323  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  47.59 
 
 		 451 aa  323  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  47.31 
 
 		 451 aa  323  3e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  47.31 
 
 		 451 aa  323  3e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  47.31 
 
 		 451 aa  323  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  47.31 
 
 		 394 aa  323  4e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  47.31 
 
 		 412 aa  323  5e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  47.28 
 
 		 402 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  47.03 
 
 		 396 aa  316  4e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  47.98 
 
 		 420 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  46.94 
 
 		 404 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  43.43 
 
 		 403 aa  298  1e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  46.78 
 
 		 404 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  48.12 
 
 		 403 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  48.12 
 
 		 403 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  44.24 
 
 		 407 aa  292  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  44.27 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  45.33 
 
 		 402 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  45.05 
 
 		 402 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 404 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  47.08 
 
 		 408 aa  288  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  43.11 
 
 		 396 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  49.73 
 
 		 408 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  46.54 
 
 		 376 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1579  major facilitator family transporter  46.47 
 
 		 402 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  44.38 
 
 		 400 aa  280  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  44.78 
 
 		 411 aa  278  9e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  43.21 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  42.62 
 
 		 410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  46.11 
 
 		 402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  44 
 
 		 409 aa  273  5.000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  42.5 
 
 		 410 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  43.32 
 
 		 401 aa  270  4e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  41.28 
 
 		 416 aa  265  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  43.55 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  43.24 
 
 		 433 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 398 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 398 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  43.02 
 
 		 397 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  42.02 
 
 		 400 aa  253  6e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0782  major facilitator superfamily MFS_1  43.01 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  40.97 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  42.49 
 
 		 402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  38.04 
 
 		 412 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  43.28 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  38.25 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 418 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  41.69 
 
 		 402 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  38.82 
 
 		 415 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 415 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 408 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  37.15 
 
 		 402 aa  202  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  36.63 
 
 		 408 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 408 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 		 402 aa  193  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  36.1 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 		 398 aa  189  9e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 399 aa  189  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  36.87 
 
 		 410 aa  187  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  37.23 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 		 422 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 397 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  34 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 		 735 aa  166  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 404 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1543  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329427  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 404 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  30.05 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  29.2 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  35.33 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  30.99 
 
 		 391 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 		 404 aa  139  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  29.97 
 
 		 451 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2718  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 		 403 aa  139  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00439118  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  30.75 
 
 		 404 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3686  carbohydrate transporter, putative  32.62 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  30.75 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  30.99 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  28.93 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>