More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1415 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 
298 aa  594  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 
298 aa  594  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  95.02 
 
 
301 aa  565  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  86.6 
 
 
296 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  84.19 
 
 
295 aa  494  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  83.85 
 
 
295 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  78.2 
 
 
305 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  78.01 
 
 
298 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1290  ATPase  57.3 
 
 
309 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0290732  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  57.34 
 
 
302 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  58.62 
 
 
302 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2605  ATPase  57.82 
 
 
303 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58.02 
 
 
300 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0471  ATPase  60.78 
 
 
300 aa  334  9e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  58.64 
 
 
314 aa  334  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  59.43 
 
 
303 aa  333  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1784  ATPase  57 
 
 
302 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2203  AAA ATPase  58.16 
 
 
314 aa  331  8e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.55218  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5316  ATPase  57.24 
 
 
302 aa  329  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.397847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  56.12 
 
 
301 aa  328  9e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  57.24 
 
 
304 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1931  AAA family ATPase  58.62 
 
 
304 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1485  ATPase  56.36 
 
 
309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.0145294 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1142  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.44 
 
 
300 aa  326  3e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0327  ATPase  58.62 
 
 
304 aa  326  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  58.36 
 
 
300 aa  323  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58.63 
 
 
300 aa  322  6e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0582  ATPase  57.24 
 
 
304 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407257  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2166  ATPase  56.12 
 
 
296 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.52 
 
 
302 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.52 
 
 
299 aa  317  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2699  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.21 
 
 
314 aa  315  6e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.6 
 
 
305 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2356  hypothetical protein  56.9 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1452  ATPase  54.76 
 
 
296 aa  309  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2980  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.95 
 
 
304 aa  301  7.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0114  ATPase  55.25 
 
 
314 aa  300  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0575  ATPase  52.24 
 
 
328 aa  297  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  52.13 
 
 
312 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2768  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.33 
 
 
297 aa  296  4e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4712  AAA ATPase central domain protein  56.73 
 
 
324 aa  295  5e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0992582  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  53.45 
 
 
305 aa  294  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3030  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.44 
 
 
308 aa  293  3e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13080  MoxR-like ATPase  54.77 
 
 
316 aa  290  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.31 
 
 
328 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  53.45 
 
 
294 aa  290  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  54.28 
 
 
291 aa  289  4e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4954  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.87 
 
 
305 aa  277  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0632  ATPase  54.55 
 
 
280 aa  276  4e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  54.48 
 
 
318 aa  275  5e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2036  ATPase  51.44 
 
 
307 aa  275  9e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0580414  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1955  ATPase  50.17 
 
 
315 aa  275  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1375  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.82 
 
 
298 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.842047  normal  0.382396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6198  ATPase  52.99 
 
 
292 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0346062  normal  0.0544047 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2094  AAA_5 ATPase  51.61 
 
 
291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0033  putative ATPase  50 
 
 
297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.273348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4108  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.74 
 
 
294 aa  273  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2148  putative MoxR-like ATPase, CoxD  49.34 
 
 
297 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344546  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.54 
 
 
323 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4807  ATPase  52.23 
 
 
293 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1565  ATPase  53.87 
 
 
293 aa  269  4e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0536  ATPase  48.98 
 
 
326 aa  268  7e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.996373  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0654  ATPase  48.98 
 
 
326 aa  266  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  50 
 
 
310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0719  AAA_5 ATPase  47.47 
 
 
315 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0102  ATPase  48.33 
 
 
311 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  51.19 
 
 
299 aa  265  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0615  ATPase  46.13 
 
 
315 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.376805  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  47.9 
 
 
334 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5289  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.65 
 
 
298 aa  264  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  48.29 
 
 
306 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.07 
 
 
319 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0812  AAA ATPase  44.84 
 
 
315 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  53.9 
 
 
288 aa  258  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.6 
 
 
306 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  50.18 
 
 
288 aa  258  9e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.95 
 
 
306 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3131  ATPase  45.28 
 
 
303 aa  256  5e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1584  ATPase  48.38 
 
 
284 aa  255  6e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000201568  normal  0.651039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4313  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.61 
 
 
296 aa  255  6e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2759  AAA ATPase central domain protein  48.34 
 
 
292 aa  255  7e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0232984  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0291  ATPase  50 
 
 
299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  48.68 
 
 
300 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2693  putative ATPase  46.64 
 
 
319 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164702 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.52 
 
 
291 aa  249  3e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1646  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.31 
 
 
302 aa  249  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  47.75 
 
 
302 aa  249  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1567  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.77 
 
 
322 aa  249  5e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24742  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  48.21 
 
 
297 aa  248  8e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.81 
 
 
302 aa  248  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.1 
 
 
321 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577187  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10375  oxidoreductase  47.4 
 
 
298 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136286  normal  0.912822 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3567  ATPase  42.86 
 
 
316 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110663  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2810  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.98 
 
 
299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366113  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2645  ATPase  47.25 
 
 
291 aa  243  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.43 
 
 
295 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3933  ATPase  47.27 
 
 
294 aa  241  9e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3537  ATPase  46.59 
 
 
295 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3542  ATPase  46.59 
 
 
295 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3610  ATPase  46.59 
 
 
295 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0405029  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>