122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1413 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 
224 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  97.77 
 
 
224 aa  427  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  81.7 
 
 
213 aa  360  8e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  56.25 
 
 
198 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  68.71 
 
 
187 aa  199  2e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  66.67 
 
 
193 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  66.22 
 
 
232 aa  198  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  65.97 
 
 
182 aa  190  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  54.05 
 
 
197 aa  162  4e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.55 
 
 
202 aa  158  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.45 
 
 
216 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50 
 
 
147 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.34 
 
 
243 aa  148  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.44 
 
 
204 aa  147  1e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.66 
 
 
154 aa  145  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.44 
 
 
156 aa  144  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.58 
 
 
213 aa  140  1e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.32 
 
 
154 aa  140  1e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.32 
 
 
155 aa  137  9e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  52.86 
 
 
176 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  48.28 
 
 
148 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50 
 
 
176 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  49.32 
 
 
161 aa  135  3e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.34 
 
 
158 aa  136  3e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.4 
 
 
178 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.58 
 
 
151 aa  133  2e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.21 
 
 
154 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.58 
 
 
153 aa  132  4e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.95 
 
 
155 aa  131  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.28 
 
 
148 aa  129  4e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.33 
 
 
157 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.23 
 
 
148 aa  123  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48 
 
 
158 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48 
 
 
158 aa  123  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.14 
 
 
152 aa  120  1e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  42.76 
 
 
150 aa  119  4e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  42.76 
 
 
150 aa  119  5e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0368  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.97 
 
 
152 aa  118  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.73 
 
 
151 aa  114  2e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.52 
 
 
151 aa  109  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.36 
 
 
151 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  46.2 
 
 
176 aa  108  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1814  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.38 
 
 
208 aa  105  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96745  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.9 
 
 
246 aa  101  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0971  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.88 
 
 
269 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301105  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2526  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.15 
 
 
181 aa  91.3  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.65 
 
 
241 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.89 
 
 
249 aa  88.2  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1874  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.01 
 
 
223 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  39.57 
 
 
983 aa  84  2e-15  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  35.92 
 
 
997 aa  83.2  3e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2073  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  38.69 
 
 
980 aa  81.6  8e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576081  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.81 
 
 
220 aa  81.3  1e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6673  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  37.04 
 
 
1019 aa  79.7  3e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.581747  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1301  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  42.4 
 
 
988 aa  79.7  4e-14  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.648743 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2185  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  37.04 
 
 
1012 aa  79.7  4e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3296  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  39.71 
 
 
987 aa  78.6  6e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0204451  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1492  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 
216 aa  79  6e-14  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.619524  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5890  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  33.58 
 
 
1012 aa  77.8  1e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614012  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0474  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.73 
 
 
248 aa  77  2e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0413426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3262  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.21 
 
 
253 aa  77  2e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234433  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0704  hypothetical protein  27.84 
 
 
253 aa  76.3  4e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.1 
 
 
152 aa  76.3  4e-13  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  6.88113e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20930  hypothetical protein  36.81 
 
 
221 aa  75.1  8e-13  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451934  normal  0.0186523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2052  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  33.57 
 
 
1011 aa  74.7  9e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2227  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.62 
 
 
229 aa  74.3  1e-12  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1744  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  33.57 
 
 
1011 aa  74.7  1e-12  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.919932 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4723  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  37.09 
 
 
991 aa  72.4  5e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102833  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0678  hypothetical protein  30.38 
 
 
242 aa  70.9  1e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2442  carbon monoxide dehydrogenase family protein  31.45 
 
 
242 aa  70.5  2e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0856  carbon monoxide dehydrogenase family protein  31.45 
 
 
242 aa  70.5  2e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1016  hypothetical protein  31.45 
 
 
242 aa  70.5  2e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0608  carbon monoxide dehydrogenase family protein  31.45 
 
 
242 aa  70.5  2e-11  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.802203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0851  carbon monoxide dehydrogenase family protein  31.45 
 
 
242 aa  70.5  2e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0056  carbon monoxide dehydrogenase family protein  31.45 
 
 
242 aa  70.5  2e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  29.25 
 
 
1027 aa  70.1  3e-11  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2003  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.46 
 
 
235 aa  68.6  7e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2613  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.46 
 
 
235 aa  68.6  7e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6656  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.75 
 
 
222 aa  68.6  8e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5354  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.42 
 
 
204 aa  68.2  1e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0644  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.33 
 
 
141 aa  67.4  2e-10  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0290775  normal  0.389247 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.8 
 
 
235 aa  67  2e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0668  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  34.51 
 
 
988 aa  64.7  1e-09  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295598  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2660  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.48 
 
 
235 aa  63.5  2e-09  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.73 
 
 
185 aa  63.9  2e-09  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2533  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.48 
 
 
235 aa  63.5  2e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5944  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.15 
 
 
235 aa  61.2  1e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.163492 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2694  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.97 
 
 
153 aa  61.2  1e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0998879  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0685  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.14 
 
 
235 aa  60.8  1e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.31708 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1231  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 
150 aa  60.5  2e-08  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99571  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.14 
 
 
254 aa  59.3  5e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.57 
 
 
237 aa  58.2  1e-07  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0505  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.41 
 
 
222 aa  55.5  6e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0483  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.41 
 
 
222 aa  55.5  6e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0494  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.41 
 
 
222 aa  55.5  6e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462994  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  29.02 
 
 
200 aa  54.7  1e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0875  hypothetical protein  56.25 
 
 
87 aa  54.3  1e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0407732  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2945  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.33 
 
 
182 aa  54.3  2e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0435616  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0213  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.41 
 
 
154 aa  52.8  5e-06  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1217  hypothetical protein  28.48 
 
 
289 aa  51.6  9e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0793988 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>