22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1409 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1409  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  300  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000519507  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1345  hypothetical protein  94.84 
 
 		 155 aa  228  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337158  normal  0.0274003 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5582  hypothetical protein  46.45 
 
 		 168 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5305  hypothetical protein  52.26 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165868  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1573  putative signal peptide transmembrane protein  32.26 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1774  putative signal peptide transmembrane protein  32.9 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3123  hypothetical protein  32.69 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.862887 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4980  hypothetical protein  32.05 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411596  normal  0.591894 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5314  hypothetical protein  32.69 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1165  hypothetical protein  29.03 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1445  hypothetical protein  29.03 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.280213  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0021  hypothetical protein  29.03 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0019  hypothetical protein  29.03 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0019  hypothetical protein  29.03 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5148  hypothetical protein  29.68 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.426334  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5711  hypothetical protein  29.68 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0707183 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3169  hypothetical protein  31.41 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2910  putative signal peptide transmembrane protein  32.86 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4528  hypothetical protein  29.03 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1522  hypothetical protein  29.2 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0015  hypothetical protein  29.2 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0017  hypothetical protein  26.67 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>