More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1227 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  89.41 
 
 
387 aa  696    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  85.53 
 
 
387 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
387 aa  776    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  84.5 
 
 
387 aa  640    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  40.24 
 
 
255 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  34.38 
 
 
425 aa  110  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0758  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 
253 aa  106  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.294799  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
309 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
273 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  31.02 
 
 
510 aa  96.7  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 
350 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.03 
 
 
262 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 
268 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 
268 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 
352 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.59 
 
 
265 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 
284 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 
271 aa  93.2  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 
254 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
265 aa  92.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.14 
 
 
320 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  31.84 
 
 
290 aa  91.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  32.42 
 
 
285 aa  90.5  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
275 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  26.59 
 
 
315 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  26.59 
 
 
315 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  31.17 
 
 
279 aa  89.7  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  41.96 
 
 
285 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  30.8 
 
 
263 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
280 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.67 
 
 
380 aa  89.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 
273 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  27.44 
 
 
264 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
279 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  31.64 
 
 
266 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
271 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22440  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.06 
 
 
254 aa  87.4  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 
260 aa  87  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  32.82 
 
 
262 aa  86.7  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
296 aa  86.7  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.78 
 
 
248 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
270 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
262 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  26.53 
 
 
267 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 
265 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.2 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
263 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  30.35 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  31.17 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  29.23 
 
 
282 aa  84  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 
290 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  24.74 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  29.37 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  28.47 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  29.12 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  28.79 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  30.2 
 
 
279 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  27.98 
 
 
275 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  25.55 
 
 
278 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  29.22 
 
 
262 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 
267 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.71 
 
 
562 aa  82.4  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 
291 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  27.07 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  31.25 
 
 
397 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  29.22 
 
 
262 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  26.12 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  31.9 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2245  3-oxoadipate enol-lactonase  28.63 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  27.55 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.55 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
273 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 
278 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>