More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1068 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  88.29 
 
 		 428 aa  761    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  90.16 
 
 		 427 aa  775    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  90.16 
 
 		 427 aa  775    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  79.21 
 
 		 428 aa  701    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  82.2 
 
 		 427 aa  739    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  99.77 
 
 		 427 aa  868    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  96.25 
 
 		 427 aa  821    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  89.93 
 
 		 427 aa  777    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  90.16 
 
 		 427 aa  775    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  82.71 
 
 		 428 aa  734    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  83.18 
 
 		 428 aa  716    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  82.2 
 
 		 427 aa  733    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  92.31 
 
 		 429 aa  789    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  77.07 
 
 		 427 aa  672    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  90.4 
 
 		 427 aa  780    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  90.16 
 
 		 427 aa  775    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  82.44 
 
 		 427 aa  735    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  90.4 
 
 		 427 aa  780    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  81.06 
 
 		 433 aa  723    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  90.16 
 
 		 427 aa  775    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  87.59 
 
 		 428 aa  759    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  75.41 
 
 		 427 aa  681    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  90.16 
 
 		 427 aa  776    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  90.63 
 
 		 427 aa  782    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  83.14 
 
 		 427 aa  744    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  76.11 
 
 		 427 aa  691    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  85.25 
 
 		 427 aa  735    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  91.1 
 
 		 427 aa  786    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  83.41 
 
 		 428 aa  738    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  91.33 
 
 		 427 aa  788    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  91.84 
 
 		 429 aa  789    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  90.4 
 
 		 427 aa  780    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  83.18 
 
 		 428 aa  712    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  83.88 
 
 		 428 aa  743    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1663  phosphopyruvate hydratase  81.5 
 
 		 427 aa  696    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29135  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  90.63 
 
 		 427 aa  782    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  90.4 
 
 		 427 aa  780    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  90.16 
 
 		 427 aa  775    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 427 aa  870    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  90.16 
 
 		 427 aa  775    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  90.4 
 
 		 427 aa  780    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  71.33 
 
 		 430 aa  631  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  71.1 
 
 		 430 aa  627  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  68.53 
 
 		 430 aa  614  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  68.22 
 
 		 429 aa  615  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  68.76 
 
 		 429 aa  617  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  68.93 
 
 		 428 aa  614  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3266  phosphopyruvate hydratase  70.75 
 
 		 430 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.399871  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  67.52 
 
 		 429 aa  609  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 		 428 aa  609  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  67.44 
 
 		 431 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  67.44 
 
 		 431 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  67.67 
 
 		 431 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  69.09 
 
 		 426 aa  604  9.999999999999999e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  67.44 
 
 		 431 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  67.67 
 
 		 431 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  67.44 
 
 		 431 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4063  phosphopyruvate hydratase  70.26 
 
 		 429 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  69.16 
 
 		 428 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1612  phosphopyruvate hydratase  70.49 
 
 		 429 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1504  phosphopyruvate hydratase  70.49 
 
 		 429 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1166  phosphopyruvate hydratase  70.73 
 
 		 429 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17320  phosphopyruvate hydratase  70.49 
 
 		 429 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4165  phosphopyruvate hydratase  70.49 
 
 		 429 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.654872  normal  0.604317 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  67.7 
 
 		 425 aa  598  1e-170  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1121  phosphopyruvate hydratase  70.02 
 
 		 429 aa  596  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  68.69 
 
 		 429 aa  595  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38790  phosphopyruvate hydratase  69.56 
 
 		 429 aa  597  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  67.67 
 
 		 431 aa  591  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  67.45 
 
 		 427 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1437  phosphopyruvate hydratase  68.63 
 
 		 428 aa  593  1e-168  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  594  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1184  Phosphopyruvate hydratase  69.25 
 
 		 426 aa  593  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  67.67 
 
 		 431 aa  591  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3127  phosphopyruvate hydratase  70.45 
 
 		 431 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172758  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3136  phosphopyruvate hydratase  70.45 
 
 		 431 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00228262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  67.44 
 
 		 431 aa  589  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  67.45 
 
 		 427 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1196  phosphopyruvate hydratase  70.45 
 
 		 431 aa  588  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.061056  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1237  phosphopyruvate hydratase  70.45 
 
 		 431 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00127737  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  66.67 
 
 		 431 aa  588  1e-167  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 		 431 aa  589  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3279  phosphopyruvate hydratase  70.45 
 
 		 431 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  67.76 
 
 		 429 aa  588  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  67.76 
 
 		 426 aa  586  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03083  phosphopyruvate hydratase  72 
 
 		 430 aa  587  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00104366  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 		 425 aa  587  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 		 425 aa  587  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1205  phosphopyruvate hydratase  69.18 
 
 		 431 aa  585  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000056862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  67.37 
 
 		 428 aa  585  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 		 429 aa  586  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  65.01 
 
 		 431 aa  585  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  65.01 
 
 		 431 aa  585  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 		 429 aa  586  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1363  phosphopyruvate hydratase  69.09 
 
 		 428 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 431 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 430 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1185  phosphopyruvate hydratase  69.03 
 
 		 431 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1036  phosphopyruvate hydratase  69.98 
 
 		 431 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0921  phosphopyruvate hydratase  70.59 
 
 		 431 aa  581  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>