More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1033 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1033  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 		 458 aa  941    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.611975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2610  aldehyde dehydrogenase  39.73 
 
 		 458 aa  365  1e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.514086  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2358  aldehyde Dehydrogenase  41.65 
 
 		 461 aa  363  4e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3615  aldehyde dehydrogenase  42.19 
 
 		 460 aa  360  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.30982  normal  0.838762 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2512  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  39.21 
 
 		 457 aa  357  1.9999999999999998e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00297812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2296  aldehyde dehydrogenase  38.62 
 
 		 458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.69034  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1456  aldehyde dehydrogenase  41.22 
 
 		 459 aa  356  5e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.133276  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1977  aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 		 459 aa  355  6.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.205682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2010  aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 		 459 aa  355  6.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2181  Aldehyde Dehydrogenase  38.62 
 
 		 456 aa  348  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0165  Aldehyde Dehydrogenase  41.27 
 
 		 459 aa  345  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0486514 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14840  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 		 481 aa  338  1.9999999999999998e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0170872  normal  0.129561 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0334  Aldehyde Dehydrogenase  40.14 
 
 		 465 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1200  aldehyde dehydrogenase  40.14 
 
 		 455 aa  329  7e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.625274  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21711  putative aldehyde dehydrogenase  39.95 
 
 		 459 aa  329  7e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0450332 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4008  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.44 
 
 		 455 aa  328  8e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.148119  hitchhiker  0.00000000000192548 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1336  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.2 
 
 		 455 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4713  aldehyde dehydrogenase  40.41 
 
 		 442 aa  325  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1438  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.58 
 
 		 455 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00047952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3041  aldehyde dehydrogenase  38 
 
 		 461 aa  324  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1198  aldehyde dehydrogenase  38.73 
 
 		 455 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.869515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1296  aldehyde dehydrogenase  38.73 
 
 		 455 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1374  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.73 
 
 		 455 aa  324  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209358 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1178  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.97 
 
 		 455 aa  323  5e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.198851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1397  aldehyde dehydrogenase  39.34 
 
 		 455 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1176  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.5 
 
 		 455 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0821  Aldehyde Dehydrogenase  42 
 
 		 475 aa  320  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0672695  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00587  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  40 
 
 		 468 aa  320  3e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2652  aldehyde dehydrogenase  38.35 
 
 		 459 aa  319  7e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08936  aldehyde dehydrogenase  38.59 
 
 		 457 aa  317  3e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.539716  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0489  aldehyde dehydrogenase  41.97 
 
 		 459 aa  311  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0498787 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0497  putative aldehyde dehydrogenase  37.79 
 
 		 459 aa  310  2.9999999999999997e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0365666 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03681  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  37.95 
 
 		 449 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.975414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04241  putative aldehyde dehydrogenase  37.38 
 
 		 459 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.844488 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1742  Aldehyde Dehydrogenase  39.16 
 
 		 476 aa  307  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1709  putative aldehyde dehydrogenase  37.62 
 
 		 459 aa  306  7e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0791372  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0449  Aldehyde Dehydrogenase  36.32 
 
 		 456 aa  305  8.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2489  Aldehyde Dehydrogenase  38.67 
 
 		 463 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1918  Aldehyde Dehydrogenase  39.51 
 
 		 475 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1838  putative aldehyde dehydrogenase  37.7 
 
 		 459 aa  299  5e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2479  Aldehyde Dehydrogenase  39.91 
 
 		 469 aa  299  8e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.410895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  38.41 
 
 		 481 aa  298  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2158  aldehyde dehydrogenase  38.34 
 
 		 462 aa  296  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.734921  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2121  Aldehyde Dehydrogenase  39.51 
 
 		 469 aa  295  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.604526  decreased coverage  0.00230582 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5303  aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 		 485 aa  295  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1254  aldehyde dehydrogenase  39.37 
 
 		 471 aa  295  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38059  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1965  Aldehyde Dehydrogenase  36.69 
 
 		 468 aa  293  3e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0607  aldehyde dehydrogenase  38.55 
 
 		 484 aa  292  7e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549994  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0105  aldehyde dehydrogenase  37.04 
 
 		 470 aa  290  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0438  aldehyde dehydrogenase  39.02 
 
 		 484 aa  290  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0433999  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0099  aldehyde dehydrogenase  38.04 
 
 		 470 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0090  aldehyde dehydrogenase  38.04 
 
 		 470 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1930  Aldehyde Dehydrogenase  41.94 
 
 		 480 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0080  aldehyde dehydrogenase  37.83 
 
 		 470 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1006  aldehyde dehydrogenase  38.97 
 
 		 454 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2085  Aldehyde Dehydrogenase_  38.7 
 
 		 454 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0742  aldehyde dehydrogenase  37.17 
 
 		 468 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0503  Aldehyde Dehydrogenase  37.22 
 
 		 456 aa  285  8e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.958957  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5442  aldehyde dehydrogenase  37.56 
 
 		 486 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0440  aldehyde dehydrogenase  38.34 
 
 		 483 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01050  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  38.79 
 
 		 504 aa  280  4e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.958772  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0337  putative aldehyde dehydrogenase  32 
 
 		 463 aa  279  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.704736  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03581  putative aldehyde dehydrogenase  33.57 
 
 		 463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.995721  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03571  putative aldehyde dehydrogenase  33.57 
 
 		 463 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0388  hypothetical protein  34.75 
 
 		 447 aa  273  6e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0861429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03631  putative aldehyde dehydrogenase  33.93 
 
 		 463 aa  272  7e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1085  aldehyde dehydrogenase  35.5 
 
 		 490 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.327666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4268  Aldehyde Dehydrogenase  35.1 
 
 		 462 aa  270  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0661  aldehyde dehydrogenase  36.65 
 
 		 465 aa  270  5e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1294  aldehyde dehydrogenase  35.62 
 
 		 511 aa  268  2e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1503  aldehyde dehydrogenase  35.87 
 
 		 477 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2238  aldehyde dehydrogenase  35.12 
 
 		 472 aa  266  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1754  aldehyde dehydrogenase  37.67 
 
 		 480 aa  265  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0078  aldehyde dehydrogenase  38.24 
 
 		 474 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0460  putative aldehyde dehydrogenase  35.95 
 
 		 476 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1830  aldehyde dehydrogenase  34.47 
 
 		 441 aa  260  4e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0238  aldehyde dehydrogenase  38.46 
 
 		 474 aa  260  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851453  decreased coverage  0.000681524 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2855  coniferyl aldehyde dehydrogenase  36.17 
 
 		 479 aa  259  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4187  aldehyde dehydrogenase  35.57 
 
 		 476 aa  259  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3971  Aldehyde Dehydrogenase  39.45 
 
 		 469 aa  259  7e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4336  aldehyde dehydrogenase  36.96 
 
 		 494 aa  259  9e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10148  aldehyde dehydrogenase  35.64 
 
 		 506 aa  258  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04810  putative aldehyde dehydrogenase  35.51 
 
 		 476 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0300  aldehyde dehydrogenase  36.38 
 
 		 458 aa  256  4e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0223565  hitchhiker  0.0000134902 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5345  aldehyde dehydrogenase  34.78 
 
 		 476 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5226  aldehyde dehydrogenase  34.27 
 
 		 479 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0988  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  33.11 
 
 		 475 aa  254  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1058  aldehyde dehydrogenase family protein  36.5 
 
 		 466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0226  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  36.36 
 
 		 472 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3273  coniferyl aldehyde dehydrogenase  36.36 
 
 		 472 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  36.36 
 
 		 472 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2938  coniferyl aldehyde dehydrogenase  36.36 
 
 		 472 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0214  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  36.36 
 
 		 472 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  36.36 
 
 		 472 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2151  coniferyl aldehyde dehydrogenase  36.36 
 
 		 472 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1028  Aldehyde Dehydrogenase  33.85 
 
 		 474 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.889075 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1007  aldehyde dehydrogenase  33.85 
 
 		 474 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2364  aldehyde dehydrogenase  38.26 
 
 		 475 aa  252  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0648683  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13873  predicted protein  35.87 
 
 		 471 aa  251  2e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1325  aldehyde dehydrogenase  36.95 
 
 		 465 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>