More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0999 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0999  elongation factor P  100 
 
 		 191 aa  390  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.692451  normal  0.398098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0934  elongation factor P  99.48 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal  0.0465306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1069  elongation factor P  77.37 
 
 		 188 aa  290  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0510953  normal  0.169109 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0849  elongation factor P  72.34 
 
 		 185 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0141003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2412  elongation factor P  71.81 
 
 		 186 aa  269  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2891  elongation factor P  71.28 
 
 		 185 aa  266  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.665386  normal  0.0670504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1093  elongation factor P  70.74 
 
 		 185 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2246  elongation factor P  71.28 
 
 		 186 aa  264  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1737  elongation factor P  69.68 
 
 		 185 aa  259  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.862842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2833  elongation factor P  69.15 
 
 		 185 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2771  elongation factor P  69.15 
 
 		 185 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0550  elongation factor P  69.15 
 
 		 185 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2459  elongation factor P  69.15 
 
 		 185 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2886  elongation factor P  69.15 
 
 		 185 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2822  elongation factor P  69.15 
 
 		 185 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0858558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1782  elongation factor P  69.15 
 
 		 185 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0461395  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1021  elongation factor P  68.09 
 
 		 185 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2163  elongation factor P  68.09 
 
 		 185 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54677 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1017  elongation factor P  68.09 
 
 		 185 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4253  elongation factor P  67.02 
 
 		 185 aa  251  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0661  elongation factor P  66.49 
 
 		 185 aa  248  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.551616  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1099  elongation factor P  66.49 
 
 		 185 aa  248  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1141  elongation factor P  66.49 
 
 		 185 aa  248  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0413  elongation factor P  67.55 
 
 		 186 aa  247  6e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.154549  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0421  elongation factor P  66.49 
 
 		 186 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1755  elongation factor P  66.14 
 
 		 185 aa  239  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1962  elongation factor P  64.02 
 
 		 199 aa  236  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0767927  normal  0.96183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0132  elongation factor P  63.49 
 
 		 185 aa  234  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1934  elongation factor P  63.1 
 
 		 184 aa  232  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.204738 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1648  elongation factor P  64.71 
 
 		 184 aa  228  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2035  elongation factor P  61.9 
 
 		 185 aa  228  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.373197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1779  elongation factor P  64.17 
 
 		 184 aa  227  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2362  elongation factor P  63.1 
 
 		 184 aa  227  8e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.681402  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2875  elongation factor P  63.1 
 
 		 184 aa  227  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.220624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0857  elongation factor P  63.83 
 
 		 186 aa  226  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.479626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2871  elongation factor P  62.57 
 
 		 184 aa  224  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3074  elongation factor P  63.1 
 
 		 184 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3233  elongation factor P  62.57 
 
 		 184 aa  221  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.475124  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2242  elongation factor P  60.43 
 
 		 184 aa  220  9e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208447  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1625  elongation factor P  62.03 
 
 		 184 aa  219  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.531949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0565  translation elongation factor P  59.47 
 
 		 189 aa  218  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15280  elongation factor P  56.54 
 
 		 188 aa  207  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00757913  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27210  elongation factor P  55.5 
 
 		 188 aa  206  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.791467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2304  elongation factor P  55.5 
 
 		 188 aa  206  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0302862  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1992  elongation factor P  51.05 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000014351  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1699  elongation factor P  51.32 
 
 		 188 aa  184  9e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000109401  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1915  elongation factor P  52.11 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120633  unclonable  0.00000167912 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1908  elongation factor P  50.79 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000484999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2268  elongation factor P  51.32 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.04773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2339  elongation factor P  51.58 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0127708  hitchhiker  0.0000774708 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2049  elongation factor P  51.32 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000851493  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2328  elongation factor P  51.85 
 
 		 186 aa  171  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2038  elongation factor P  51.85 
 
 		 186 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000835391  hitchhiker  0.00115399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1937  elongation factor P  51.85 
 
 		 186 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000886645  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2141  elongation factor P  51.85 
 
 		 186 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000141842  hitchhiker  0.000269097 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4518  elongation factor P  50.26 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2189  elongation factor P  50.26 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000173  unclonable  0.00000474923 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1875  elongation factor P  50.26 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000405635  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2139  elongation factor P  50.26 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000480024  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2245  elongation factor P  50.26 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000454991  decreased coverage  0.0000000000324957 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2232  elongation factor P  50.26 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000315255  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1898  Elongation factor P  46.35 
 
 		 189 aa  167  8e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.185446  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2130  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  46.07 
 
 		 190 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0576423  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1468  elongation factor P  44.5 
 
 		 189 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1433  elongation factor P  44.5 
 
 		 189 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1858  elongation factor P  44.5 
 
 		 189 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.453569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3856  elongation factor P  44.5 
 
 		 189 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198418  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1765  translation elongation factor P  44.79 
 
 		 189 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3999  elongation factor P  44.79 
 
 		 189 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000867749  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3628  elongation factor P  44.27 
 
 		 189 aa  157  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000158679  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0996  translation elongation factor P  42.71 
 
 		 190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  41.21 
 
 		 186 aa  141  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  36.96 
 
 		 185 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  36.96 
 
 		 185 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  38.59 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  38.3 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  37.5 
 
 		 187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  37.3 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  37.91 
 
 		 186 aa  130  7.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  37.5 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  36.96 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  37.57 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  37.5 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  36.76 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  39.13 
 
 		 185 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  36.36 
 
 		 186 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14700  translation elongation factor P (EF-P)  36.07 
 
 		 185 aa  127  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.948878  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  36.96 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  35.87 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  36.76 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  36.96 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  41.07 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  35.87 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  37.5 
 
 		 185 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  36.96 
 
 		 185 aa  124  7e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  36.81 
 
 		 211 aa  124  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  37.63 
 
 		 187 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  35.71 
 
 		 187 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  36.81 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0468  elongation factor P  36.61 
 
 		 185 aa  124  9e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0449395  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>