More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0951 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0951  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  100 
 
 
106 aa  219  1e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.031021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0886  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  100 
 
 
106 aa  219  1e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62045  normal  0.0717209 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1021  hypothetical protein  95.28 
 
 
106 aa  211  4e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31629  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1027  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  85.85 
 
 
113 aa  198  2e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00699408  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1456  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  86.67 
 
 
118 aa  196  8e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726926  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5430  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  86.67 
 
 
107 aa  195  2e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  86.67 
 
 
122 aa  195  2e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2034  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  86.67 
 
 
107 aa  195  2e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1555  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  86.67 
 
 
111 aa  194  2e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0428449  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1146  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  85.71 
 
 
107 aa  194  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140642  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5953  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  85.71 
 
 
107 aa  194  4e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2141  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  85.71 
 
 
115 aa  194  5e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.629588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1060  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  85.85 
 
 
106 aa  193  5e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2124  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  85.71 
 
 
115 aa  194  5e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2577  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  86.67 
 
 
107 aa  193  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271604  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2597  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  84.76 
 
 
107 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388808  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1487  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  84.76 
 
 
107 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28627  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1706  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  84.76 
 
 
107 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.463089  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3105  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  84.76 
 
 
107 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172201  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1877  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  84.76 
 
 
107 aa  192  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2215  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  84.76 
 
 
107 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2731  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  84.76 
 
 
107 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2653  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  84.76 
 
 
107 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54259  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0471  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  80.95 
 
 
107 aa  182  2e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0506099  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1491  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  80.95 
 
 
107 aa  181  2e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1045  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  79.05 
 
 
110 aa  181  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2288  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  79.05 
 
 
107 aa  180  5e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0828937  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1640  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  80 
 
 
107 aa  179  9e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2142  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  80 
 
 
107 aa  179  9e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782593 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1952  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  74.29 
 
 
107 aa  179  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000360593  normal  0.334037 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2180  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  78.1 
 
 
107 aa  179  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000819662  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2260  hypothetical protein  76.19 
 
 
107 aa  176  9e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2445  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  77.14 
 
 
107 aa  176  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.300922  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2375  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  77.14 
 
 
107 aa  176  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3997  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  75.24 
 
 
107 aa  175  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914293  normal  0.0156155 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0806  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  77.14 
 
 
107 aa  174  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00435641  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1166  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  73.33 
 
 
107 aa  173  9e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0148248  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2144  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  75.24 
 
 
107 aa  171  2e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.253252  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2203  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  68.57 
 
 
107 aa  169  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0120838  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2179  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  72.38 
 
 
107 aa  168  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00700081  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40380  Iron-sulfur biogenesis protein  71.43 
 
 
107 aa  167  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3509  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  72.38 
 
 
107 aa  167  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.684527  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1301  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  72.38 
 
 
107 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0512057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14750  putative iron-binding protein IscA  72.38 
 
 
107 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0250  HesB/YadR/YfhF family protein  72.38 
 
 
107 aa  164  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0844  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  70.48 
 
 
107 aa  163  6e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0887  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  70.48 
 
 
107 aa  163  6e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553032  hitchhiker  0.000153818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0874  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  70.48 
 
 
107 aa  163  6e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.301762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4610  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  69.52 
 
 
107 aa  162  1e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0799177  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4334  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  70.48 
 
 
107 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  hitchhiker  1.35167e-09 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2749  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  68.57 
 
 
107 aa  160  5e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1239  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  70.48 
 
 
107 aa  159  8e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0719  iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  66.67 
 
 
107 aa  159  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669917  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  68.57 
 
 
107 aa  158  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1425  iron-binding protein IscA  70.48 
 
 
107 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1106  iron-sulfur cluster assembly protein  67.62 
 
 
107 aa  159  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0886041  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0279  HesB/YadR/YfhF family protein  67.62 
 
 
107 aa  158  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00587382  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2057  iron-sulfur cluster assembly protein  69.52 
 
 
107 aa  157  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0583672  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0433  iron-sulfur cluster assembly protein  66.67 
 
 
107 aa  157  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260481 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1170  iron-sulfur cluster assembly protein  66.67 
 
 
107 aa  157  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.806091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1278  iron-sulfur cluster assembly protein  66.67 
 
 
107 aa  157  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.402601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3025  iron-sulfur cluster assembly protein  67.62 
 
 
107 aa  157  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.116903  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  67.62 
 
 
107 aa  155  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01057  hypothetical protein  66.67 
 
 
107 aa  155  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1240  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  66.67 
 
 
107 aa  155  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2803  iron-sulfur cluster assembly protein  66.67 
 
 
107 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3625  iron-sulfur cluster assembly protein  64.76 
 
 
107 aa  154  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.655244  normal  0.813193 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2781  iron-sulfur cluster assembly protein  66.67 
 
 
107 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2915  iron-sulfur cluster assembly protein  66.67 
 
 
107 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2696  iron-sulfur cluster assembly protein  66.67 
 
 
107 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2740  iron-sulfur cluster assembly protein  66.67 
 
 
107 aa  154  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2813  iron-sulfur cluster assembly protein  66.67 
 
 
109 aa  153  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0693876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2679  iron-sulfur cluster assembly protein  66.67 
 
 
109 aa  153  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2903  iron-sulfur cluster assembly protein  66.67 
 
 
109 aa  153  8e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.193347  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3760  iron-sulfur cluster assembly protein  66.67 
 
 
109 aa  153  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02384  hypothetical protein  66.67 
 
 
107 aa  152  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1149  iron-sulfur cluster assembly protein  66.67 
 
 
107 aa  152  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0396578  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1140  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  66.67 
 
 
107 aa  152  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.960309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2681  iron-sulfur cluster assembly protein  66.67 
 
 
107 aa  152  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02420  iron-sulfur cluster assembly protein  66.67 
 
 
107 aa  152  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1246  iron-sulfur cluster assembly protein  64.76 
 
 
107 aa  151  3e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434488  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1566  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  60.95 
 
 
107 aa  150  6e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0832  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  62.86 
 
 
107 aa  150  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479879  normal  0.474138 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3029  iron-sulfur cluster assembly protein  63.81 
 
 
107 aa  149  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1441  HesB/YadR/YfhF, Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  62.86 
 
 
107 aa  147  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0666522  hitchhiker  0.00534365 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0675  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  63.11 
 
 
107 aa  145  2e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0824  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  63.11 
 
 
107 aa  145  2e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0263078  normal  0.761008 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  60.95 
 
 
107 aa  145  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  63.81 
 
 
108 aa  144  4e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1778  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  58.1 
 
 
107 aa  143  9e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  3.35505e-05 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1134  iron-sulfur cluster assembly protein  59.05 
 
 
107 aa  142  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1363  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  62.86 
 
 
107 aa  142  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1631  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  61.32 
 
 
106 aa  142  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.017999  hitchhiker  1.49537e-05 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2869  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  59.05 
 
 
107 aa  141  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.586009  hitchhiker  1.84682e-08 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2384  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  60 
 
 
107 aa  140  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.45288e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1963  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  60 
 
 
107 aa  140  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00723814  hitchhiker  0.00183278 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2500  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  60 
 
 
107 aa  140  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0332072  hitchhiker  0.00778132 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2395  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  60 
 
 
107 aa  140  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210631  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2278  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  58.1 
 
 
107 aa  140  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00670907  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2266  HesB/YadR/YfhF family protein  58.1 
 
 
107 aa  140  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>