More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0940 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0940  aromatic amino acid aminotransferase  100 
 
 
398 aa  821  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1050  aromatic amino acid aminotransferase  87.94 
 
 
398 aa  706  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0875  aromatic amino acid aminotransferase  98.49 
 
 
398 aa  811  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1018  aromatic amino acid aminotransferase  87.91 
 
 
398 aa  700  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.039027  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1010  aromatic amino acid aminotransferase  92.96 
 
 
398 aa  744  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126314  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1395  aromatic amino acid aminotransferase  79.15 
 
 
399 aa  643  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268417  hitchhiker  0.0082547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3154  aromatic amino acid aminotransferase  80.9 
 
 
399 aa  634  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.4038 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1959  aromatic amino acid aminotransferase  79.64 
 
 
399 aa  627  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1066  aromatic amino acid aminotransferase  77.84 
 
 
399 aa  614  1e-174  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0961353  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0916  aromatic amino acid aminotransferase  77.64 
 
 
399 aa  605  1e-172  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.106367  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1919  aromatic amino acid aminotransferase  77.64 
 
 
399 aa  605  1e-172  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0879  aromatic amino acid aminotransferase  77.64 
 
 
399 aa  605  1e-172  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0016  aromatic amino acid aminotransferase  77.64 
 
 
399 aa  605  1e-172  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.815383  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0603  aromatic amino acid aminotransferase  77.64 
 
 
399 aa  605  1e-172  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48132  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0506  aromatic amino acid aminotransferase  77.64 
 
 
399 aa  605  1e-172  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1738  aromatic amino acid aminotransferase  77.64 
 
 
399 aa  605  1e-172  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1989  aromatic amino acid aminotransferase  74.62 
 
 
398 aa  604  1e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.447695  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2037  aromatic amino acid aminotransferase  77.39 
 
 
399 aa  603  1e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2249  aromatic amino acid aminotransferase  78.35 
 
 
399 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2128  aromatic amino acid aminotransferase  78.35 
 
 
399 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455577  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20090  aromatic amino acid aminotransferase  74.62 
 
 
398 aa  600  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5539  aromatic amino acid aminotransferase  77.84 
 
 
399 aa  596  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2738  aromatic amino acid aminotransferase  74.87 
 
 
398 aa  595  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187643  normal  0.404838 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5866  aromatic amino acid aminotransferase  77.58 
 
 
399 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2211  aromatic amino acid aminotransferase  77.58 
 
 
399 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2235  aromatic amino acid aminotransferase  77.32 
 
 
399 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2002  aromatic amino acid aminotransferase  69.95 
 
 
402 aa  585  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166981  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23500  aromatic amino acid aminotransferase  74.37 
 
 
398 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283341  hitchhiker  0.00416688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2163  aspartate aminotransferase  73.62 
 
 
398 aa  585  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1973  aromatic amino acid aminotransferase  73.37 
 
 
398 aa  585  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1874  aromatic amino acid aminotransferase  72.86 
 
 
398 aa  575  1e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3787  aromatic amino acid aminotransferase  73.62 
 
 
398 aa  571  1e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972413  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1538  aromatic amino acid aminotransferase  73.62 
 
 
398 aa  573  1e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2175  aromatic amino acid aminotransferase  67.59 
 
 
398 aa  569  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1496  aromatic amino acid aminotransferase  70.1 
 
 
399 aa  571  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1972  aromatic amino acid aminotransferase  73.62 
 
 
398 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  hitchhiker  0.0035626 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1504  aromatic amino acid aminotransferase  72.61 
 
 
398 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0466  aromatic amino acid aminotransferase  70.1 
 
 
399 aa  566  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00128744  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2174  aromatic amino acid aminotransferase  66.08 
 
 
398 aa  558  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00875667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2440  aromatic amino acid aminotransferase  66.33 
 
 
398 aa  560  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2439  aromatic amino acid aminotransferase  71.03 
 
 
402 aa  560  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2151  aromatic amino acid aminotransferase  66.08 
 
 
398 aa  556  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266369 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1635  aromatic amino acid aminotransferase  66.08 
 
 
398 aa  555  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1051  aromatic amino acid aminotransferase  66.33 
 
 
398 aa  553  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2139  aromatic amino acid aminotransferase  65.58 
 
 
398 aa  553  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4002  aromatic amino acid aminotransferase  65.83 
 
 
398 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0358212 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1562  aromatic amino acid aminotransferase  65.83 
 
 
398 aa  550  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031141  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2293  aromatic amino acid aminotransferase  65.98 
 
 
396 aa  542  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.673394  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2370  aromatic amino acid aminotransferase  64.07 
 
 
401 aa  533  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0021  aromatic amino acid aminotransferase  61.56 
 
 
400 aa  522  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17324e-08 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03468  aromatic amino acid aminotransferase  60.8 
 
 
400 aa  513  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0030  aromatic amino acid aminotransferase  55.53 
 
 
400 aa  476  1e-133  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0026  aromatic amino acid aminotransferase  55.53 
 
 
400 aa  476  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4927  aromatic amino acid aminotransferase  55.56 
 
 
398 aa  461  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177363  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4503  aromatic amino acid aminotransferase  53.79 
 
 
399 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382986  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3404  aromatic amino acid aminotransferase  55.16 
 
 
401 aa  463  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297741 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3682  aromatic amino acid aminotransferase  53.54 
 
 
398 aa  448  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1222  aromatic amino acid aminotransferase  52.53 
 
 
399 aa  448  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.309647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5384  aromatic amino acid aminotransferase  51.77 
 
 
399 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261503  normal  0.0944664 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1593  aromatic amino acid aminotransferase  52.02 
 
 
400 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2395  aromatic amino acid aminotransferase  51.77 
 
 
400 aa  440  1e-122  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.441327  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5444  aromatic amino acid aminotransferase  51.65 
 
 
402 aa  439  1e-122  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.0293497 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0667  aromatic amino acid aminotransferase  51.77 
 
 
400 aa  440  1e-122  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.588804  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1111  aromatic amino acid aminotransferase  51.77 
 
 
400 aa  440  1e-122  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.698434  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0798  aromatic amino acid aminotransferase  51.77 
 
 
400 aa  440  1e-122  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1187  aromatic amino acid aminotransferase  51.77 
 
 
400 aa  440  1e-122  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1762  aromatic amino acid aminotransferase  51.77 
 
 
400 aa  440  1e-122  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4350  aromatic amino acid aminotransferase  51.77 
 
 
400 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461114  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4017  aromatic amino acid aminotransferase  51.77 
 
 
400 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4233  aromatic amino acid aminotransferase  52.9 
 
 
400 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6004  aromatic amino acid aminotransferase  51.77 
 
 
400 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.443783  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3759  aromatic amino acid aminotransferase  52.02 
 
 
400 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3600  aromatic amino acid aminotransferase  55.16 
 
 
407 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4268  aromatic amino acid aminotransferase  51.77 
 
 
400 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0463663  normal  0.625536 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1668  aromatic amino acid aminotransferase  52.02 
 
 
397 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0301688  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1805  aromatic amino acid aminotransferase  50.76 
 
 
397 aa  432  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0271034  normal  0.497498 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4606  aromatic amino acid aminotransferase  51.63 
 
 
397 aa  431  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4294  aromatic amino acid aminotransferase  51.63 
 
 
397 aa  431  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.820451  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1670  aromatic amino acid aminotransferase  51.26 
 
 
400 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0668347  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03886  hypothetical protein  51.63 
 
 
397 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0274153  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2171  aromatic amino acid aminotransferase  50.88 
 
 
401 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.611147  normal  0.836675 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4515  aromatic amino acid aminotransferase  51.63 
 
 
397 aa  431  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5339  aromatic-amino-acid aminotransferase  51.76 
 
 
399 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5556  aromatic amino acid aminotransferase  51.63 
 
 
411 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3974  aromatic amino acid aminotransferase  51.63 
 
 
397 aa  431  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.270802 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3939  Aromatic-amino-acid transaminase  51.63 
 
 
397 aa  430  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03926  tyrosine aminotransferase, tyrosine-repressible, PLP-dependent  51.63 
 
 
397 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0286494  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2182  aromatic amino acid aminotransferase  51.39 
 
 
398 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4541  aromatic amino acid aminotransferase  51.13 
 
 
397 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0924  aromatic amino acid aminotransferase  51.52 
 
 
398 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2326  aromatic amino acid aminotransferase  51.13 
 
 
398 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.88203  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2805  aromatic amino acid aminotransferase  51.39 
 
 
398 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3590  aromatic amino acid aminotransferase  51.39 
 
 
398 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.511002  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2024  aromatic amino acid aminotransferase  50.76 
 
 
397 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4505  aromatic amino acid aminotransferase  51.13 
 
 
397 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2121  aromatic amino acid aminotransferase  50.51 
 
 
397 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0183717  normal  0.0291877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4898  aromatic amino acid aminotransferase  52.01 
 
 
399 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4497  aromatic amino acid aminotransferase  50.88 
 
 
397 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2228  aromatic amino acid aminotransferase  50.25 
 
 
397 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.56913e-06  normal  0.0325247 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4591  aromatic amino acid aminotransferase  50.88 
 
 
397 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>