More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0891 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0891  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 230 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.927999 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0820  Integral membrane protein TerC  95.65 
 
 		 230 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0949  hypothetical protein  89.57 
 
 		 230 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0295104 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2567  integral membrane protein TerC  71.37 
 
 		 232 aa  301  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0916  integral membrane protein TerC  71.06 
 
 		 237 aa  294  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.968219  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4666  integral membrane protein TerC  59.66 
 
 		 245 aa  234  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3864  integral membrane protein TerC  59.23 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4044  integral membrane protein TerC  60.96 
 
 		 239 aa  231  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3917  integral membrane protein TerC  68.91 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0557397  hitchhiker  0.00349463 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1401  Integral membrane protein TerC  61.33 
 
 		 230 aa  227  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3371  Integral membrane protein TerC  52.04 
 
 		 233 aa  221  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000908977  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2986  hypothetical protein  56.76 
 
 		 223 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000888326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2992  hypothetical protein  60.7 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000237739  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2736  hypothetical protein  60.7 
 
 		 223 aa  215  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00167476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2945  hypothetical protein  60.7 
 
 		 223 aa  215  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.89951e-53 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2665  integral membrane protein  60.7 
 
 		 223 aa  215  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2946  hypothetical protein  60.7 
 
 		 223 aa  215  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000002611  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2687  integral membrane protein  60.7 
 
 		 223 aa  215  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.99686e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2290  hypothetical protein  55.11 
 
 		 223 aa  214  8e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000535786  hitchhiker  1.74959e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2950  hypothetical protein  59.7 
 
 		 224 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000304584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3292  Integral membrane protein TerC  50.23 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000553264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0428  integral membrane protein TerC  57.14 
 
 		 225 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000236492  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1348  hypothetical protein  49.09 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0643228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1310  hypothetical protein  49.09 
 
 		 224 aa  202  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.869179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1243  hypothetical protein  49.08 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4099  hypothetical protein  49.08 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1271  hypothetical protein  49.08 
 
 		 224 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1110  hypothetical protein  48.62 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1092  membrane protein  49.08 
 
 		 224 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1201  hypothetical protein  48.62 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0242206  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1086  membrane protein  48.62 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1098  integral membrane protein TerC  49.08 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0905  integral membrane protein TerC  47.49 
 
 		 224 aa  191  8e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0070  hypothetical protein  44.64 
 
 		 234 aa  175  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.693932  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6290  Integral membrane protein TerC  43.67 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.06689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49290  hypothetical protein  46.58 
 
 		 244 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608351  normal  0.0100371 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2473  integral membrane protein TerC  44.34 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1619  Integral membrane protein TerC  45.5 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4210  hypothetical protein  46.67 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0388  Integral membrane protein TerC  41.2 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.10914  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4682  integral membrane protein TerC  39.57 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0857  integral membrane protein TerC  47.22 
 
 		 246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2326  integral membrane protein TerC  44.96 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3362  integral membrane protein TerC  45.23 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4045  integral membrane protein TerC  39.39 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3951  integral membrane protein TerC  44.4 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0480576 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3390  Integral membrane protein TerC  39.39 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1545  Integral membrane protein TerC  45.7 
 
 		 234 aa  154  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.654667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5173  Integral membrane protein TerC  41.39 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0471  integral membrane protein TerC  45.42 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0532  integral membrane protein TerC  43.7 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0978  TerC family integral membrane protein  42.66 
 
 		 270 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0819  TerC family integral membrane protein  42.66 
 
 		 270 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1266  Integral membrane protein TerC  39.29 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0815  TerC family integral membrane protein  41.23 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0012  TerC family integral membrane protein  40.79 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0277  TerC family integral membrane protein  40.79 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2399  TerC family integral membrane protein  40.79 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363415  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4680  integral membrane protein TerC  40.17 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0926  putative transmembrane protein  42.36 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00232112  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2677  TerC family integral membrane protein  40.79 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.849406  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0194  integral membrane protein TerC  41.32 
 
 		 247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0676  hypothetical protein  44.4 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0805  integral membrane protein TerC  40.6 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0662924  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3512  integral membrane protein TerC  41.7 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0508752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0445  integral membrane protein TerC  41.05 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.620391 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1209  Integral membrane protein TerC  41.94 
 
 		 249 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3290  Integral membrane protein TerC  42.42 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0586627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0648  TerC family integral membrane protein  43.98 
 
 		 237 aa  145  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3943  integral membrane protein TerC  39.22 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0476  Integral membrane protein TerC  45.78 
 
 		 231 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0764  Integral membrane protein TerC  42.79 
 
 		 223 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0655  integral membrane protein TerC  44.34 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.315184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2694  integral membrane protein TerC  41.89 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4030  integral membrane protein TerC  45.93 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.958437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0867  integral membrane protein TerC  41.59 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5190  Integral membrane protein TerC  43.19 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0460  Integral membrane protein TerC  45.33 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3380  Integral membrane protein TerC  45.93 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2676  integral membrane protein TerC  43.24 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4673  integral membrane protein TerC  44.8 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2568  integral membrane protein TerC  41.89 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.831919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2036  integral membrane protein TerC  42.79 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2647  integral membrane protein TerC  42.79 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1829  integral membrane protein TerC  43.62 
 
 		 236 aa  138  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106378  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3022  integral membrane protein TerC  40.74 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5974  integral membrane protein TerC  43.96 
 
 		 234 aa  131  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1506  integral membrane protein TerC  53.53 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.110283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3465  hypothetical protein  39.27 
 
 		 273 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2327  hypothetical protein  43.75 
 
 		 233 aa  121  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3386  hypothetical protein  42.39 
 
 		 346 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2845  Integral membrane protein TerC  36.13 
 
 		 198 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100755 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2319  hypothetical protein  38.74 
 
 		 282 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1600  hypothetical protein  39.47 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3941  normal  0.277358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3839  hypothetical protein  36.73 
 
 		 287 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.562242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0556  hypothetical protein  41.15 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3018  integral membrane protein TerC  40.88 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1799  integral membrane protein TerC  42.11 
 
 		 212 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.916732  decreased coverage  0.000172581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1799  Integral membrane protein TerC  40.74 
 
 		 201 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.099096  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2846  integral membrane protein TerC  36.22 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0648136 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>