109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0795 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  95.48 
 
 		 221 aa  434  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  82.35 
 
 		 221 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  48.48 
 
 		 207 aa  174  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  44.22 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  39.29 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  41.46 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  40.95 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  43.84 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  43.66 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  44.39 
 
 		 200 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  45.23 
 
 		 210 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  44.62 
 
 		 221 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  36.76 
 
 		 223 aa  141  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  40.1 
 
 		 214 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  41.95 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  45.23 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  41.87 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  41.38 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  42.93 
 
 		 199 aa  128  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  43.46 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  30.58 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  34.1 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  30.58 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  33.66 
 
 		 259 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  29.77 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  29.85 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  28.92 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  29.65 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  28.86 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  29.73 
 
 		 209 aa  95.1  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  29.29 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  31.66 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  28.06 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  30.15 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  27.49 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  32.08 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  26.47 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  32.73 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  29.65 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  25.76 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  26.7 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  26.21 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  31.77 
 
 		 242 aa  72  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  26.21 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  25.51 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  32.18 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  31.94 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  25.81 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  24.43 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  23.96 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  26.87 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  24.51 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  29.1 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  24.34 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  30.69 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  26.9 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  27.5 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  26.7 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  29.17 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  29.21 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  23.58 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  28.72 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  31.37 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0485  DSBA oxidoreductase  26.79 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  25.84 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  26.5 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  25.41 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  25.82 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  25.95 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  26 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  25.37 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  24.5 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  25.67 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  28.22 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  24.32 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  25.5 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  24.35 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  25.73 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  28.03 
 
 		 239 aa  48.5  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3237  DSBA oxidoreductase  22.97 
 
 		 223 aa  48.1  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  23.74 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  27.75 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  27.75 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  27.75 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  27.75 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  27.75 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  27.75 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  27.84 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  23.24 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  27.75 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  29.71 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2368  DSBA oxidoreductase  25.63 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.919583  normal  0.0250813 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0131  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  25.89 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  23.24 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7778  DSBA oxidoreductase  26.15 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8729  putative DsbA-like thioredoxin protein  27.52 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  24.23 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>