More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0624 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4397  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.53 
 
 		 618 aa  734    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  95.18 
 
 		 624 aa  1160    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  65.12 
 
 		 615 aa  757    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 605 aa  1214    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.7 
 
 		 618 aa  735    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.37 
 
 		 623 aa  738    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1428  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.75 
 
 		 633 aa  714    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6007  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.71 
 
 		 645 aa  689    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.851813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1839  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  62.1 
 
 		 618 aa  716    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1231  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.84 
 
 		 617 aa  702    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.901618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3415  FtsH-2 peptidase  95.85 
 
 		 627 aa  1166    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.39 
 
 		 635 aa  763    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2062  vesicle-fusing ATPase  65.16 
 
 		 617 aa  725    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139839  normal  0.716859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  97.01 
 
 		 615 aa  1152    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  63.86 
 
 		 621 aa  735    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  65.83 
 
 		 616 aa  774    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2418  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.59 
 
 		 616 aa  896    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  99.01 
 
 		 605 aa  1204    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0723  FtsH-2 peptidase  73.27 
 
 		 609 aa  882    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0513277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0392  ATP-dependent metalloprotease FtsH  75.17 
 
 		 618 aa  900    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297627 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.16 
 
 		 610 aa  789    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  66.83 
 
 		 630 aa  820    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.28 
 
 		 610 aa  818    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0193  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.89 
 
 		 607 aa  709    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.54 
 
 		 607 aa  679    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  54.84 
 
 		 635 aa  630  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.68 
 
 		 696 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.68 
 
 		 714 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2457  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.84 
 
 		 615 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.39 
 
 		 647 aa  624  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.9 
 
 		 646 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.9 
 
 		 646 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  52.88 
 
 		 646 aa  611  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.21 
 
 		 663 aa  608  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.21 
 
 		 663 aa  608  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.77 
 
 		 645 aa  598  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.65 
 
 		 623 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  55.57 
 
 		 645 aa  592  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 		 697 aa  591  1e-167  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.36 
 
 		 625 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  49.92 
 
 		 694 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.76 
 
 		 694 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.4836  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5195  FtsH-2 peptidase  51.87 
 
 		 627 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  51.22 
 
 		 659 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  53.79 
 
 		 619 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  53.61 
 
 		 625 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  51.06 
 
 		 624 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  52.6 
 
 		 620 aa  568  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3484  FtsH-2 peptidase  50.93 
 
 		 621 aa  565  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4181  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.59 
 
 		 676 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1483  peptidase M41, FtsH  52.4 
 
 		 629 aa  564  1.0000000000000001e-159  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.77 
 
 		 667 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3874  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.68 
 
 		 655 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173142 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.99 
 
 		 687 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14631  cell division protein FtsH3  52.76 
 
 		 620 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336719  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  48.86 
 
 		 706 aa  561  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  53.31 
 
 		 623 aa  558  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.96 
 
 		 686 aa  560  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4334  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.35 
 
 		 655 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  51.26 
 
 		 614 aa  558  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5863  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.59 
 
 		 658 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0798132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14251  cell division protein FtsH3  52.43 
 
 		 620 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.520813  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1520  FtsH-2 peptidase  49.04 
 
 		 692 aa  557  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428329  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  50 
 
 		 699 aa  557  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.6 
 
 		 699 aa  558  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0579  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 		 717 aa  556  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0565  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 		 713 aa  556  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.71 
 
 		 630 aa  557  1e-157  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1196  cell division protein FtsH  50 
 
 		 648 aa  555  1e-156  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  51.25 
 
 		 616 aa  553  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 		 714 aa  553  1e-156  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16831  cell division protein FtsH3  50.73 
 
 		 635 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0851  cell division protein FtsH  53.2 
 
 		 637 aa  549  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00696414  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1112  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 		 653 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0925  FtsH-2 peptidase  50.98 
 
 		 624 aa  550  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610523 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  49.42 
 
 		 608 aa  550  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1358  cell division protein FtsH3  53.26 
 
 		 620 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  51.22 
 
 		 702 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.26 
 
 		 673 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3924  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.84 
 
 		 658 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888764  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.42 
 
 		 706 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1347  putative cell division protein FtsH-like protein  50.09 
 
 		 643 aa  548  1e-155  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.26 
 
 		 673 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4443  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.84 
 
 		 658 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.42 
 
 		 673 aa  549  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.23 
 
 		 705 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1259  cell division protein FtsH  50.79 
 
 		 645 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1134  cell division protein FtsH  50.79 
 
 		 645 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.04 
 
 		 607 aa  545  1e-154  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.67 
 
 		 639 aa  546  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0605  cell division protein FtsH  50.79 
 
 		 645 aa  545  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0489  putative cell division protease FtsH-like protein  49.91 
 
 		 643 aa  547  1e-154  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5877  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.83 
 
 		 635 aa  547  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0326  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.72 
 
 		 681 aa  548  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000432409  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  50.33 
 
 		 617 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  49.92 
 
 		 617 aa  541  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.17 
 
 		 662 aa  541  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.34 
 
 		 697 aa  543  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0074  FtsH-2 protease  50.34 
 
 		 917 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00600041  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.17 
 
 		 612 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>