53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0620 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  394  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  99.01 
 
 		 203 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  91.63 
 
 		 203 aa  370  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  61.45 
 
 		 204 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  61.11 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  52.6 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  39.39 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  37.93 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  37.93 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  40.76 
 
 		 208 aa  111  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  38.5 
 
 		 186 aa  108  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  37.25 
 
 		 207 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5386  hypothetical protein  37.5 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  34.8 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  40.68 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  37.23 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  35.45 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  35.2 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3980  hypothetical protein  38.33 
 
 		 186 aa  95.5  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  39.34 
 
 		 220 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  34.92 
 
 		 186 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  32.42 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  35.75 
 
 		 179 aa  90.9  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  34.85 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  35.16 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  32.97 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1519  hypothetical protein  34.08 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  34.08 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  30.17 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  29.32 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  33.52 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  35.14 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  29.65 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  25.37 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  23.33 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  30.61 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  30.65 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  29.35 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  26.32 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  25.84 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  25.63 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  27.85 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0749  hypothetical protein  24.03 
 
 		 182 aa  45.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0440  hypothetical protein  28.24 
 
 		 180 aa  45.1  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0507632  normal  0.460019 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  22.22 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32866  predicted protein  34.41 
 
 		 224 aa  42.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.861678  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  22.51 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  25.36 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  32.46 
 
 		 197 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  30.17 
 
 		 196 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7759  hypothetical protein  30.25 
 
 		 171 aa  41.6  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00223773  normal  0.120642 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  24.47 
 
 		 187 aa  41.6  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>