More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0564 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  62.34 
 
 
1956 aa  1255  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  93.41 
 
 
2009 aa  3563  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 
2026 aa  727  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  46.81 
 
 
2070 aa  667  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  43.85 
 
 
1907 aa  671  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  40.34 
 
 
1643 aa  650  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
2012 aa  3969  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  35.01 
 
 
1866 aa  827  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  42.89 
 
 
2137 aa  665  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 
2022 aa  711  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  64.14 
 
 
1989 aa  1232  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.3 
 
 
1960 aa  751  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  41.36 
 
 
1888 aa  788  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  41.8 
 
 
2026 aa  727  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  78.93 
 
 
2048 aa  2968  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  33.71 
 
 
1970 aa  840  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  41.91 
 
 
2092 aa  737  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  48.28 
 
 
1983 aa  653  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  43.88 
 
 
2164 aa  725  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 
2414 aa  632  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  41.14 
 
 
2212 aa  544  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  40.36 
 
 
2301 aa  540  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
1832 aa  535  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 
1758 aa  520  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.91 
 
 
1971 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  39.68 
 
 
2458 aa  513  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 
1725 aa  511  1e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 
1725 aa  511  1e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  37.38 
 
 
2336 aa  506  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
2175 aa  500  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 
2423 aa  500  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
2539 aa  488  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  42.65 
 
 
2476 aa  483  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  32.81 
 
 
2301 aa  477  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  34.95 
 
 
1992 aa  478  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  37.82 
 
 
1834 aa  466  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
1609 aa  461  1e-128  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  32.65 
 
 
2284 aa  459  1e-127  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  37.21 
 
 
1987 aa  461  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 
1629 aa  454  1e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 
1646 aa  447  1e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
1647 aa  450  1e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 
1646 aa  447  1e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
1127 aa  330  2e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
1065 aa  316  3e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  1.40381e-06 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
934 aa  313  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.13 
 
 
2325 aa  310  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  30.76 
 
 
952 aa  308  9e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  30.71 
 
 
734 aa  303  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
740 aa  299  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
1155 aa  299  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.33 
 
 
974 aa  298  7e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
1736 aa  297  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
928 aa  296  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
1125 aa  291  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
1137 aa  290  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
1616 aa  290  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.24 
 
 
1180 aa  289  3e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 
741 aa  286  2e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
742 aa  286  2e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 
1078 aa  286  3e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
1098 aa  285  7e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
1012 aa  284  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
1098 aa  284  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
977 aa  284  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
675 aa  282  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  30.26 
 
 
1029 aa  279  5e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  34.07 
 
 
803 aa  278  8e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
783 aa  276  4e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  33.39 
 
 
911 aa  275  5e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
770 aa  275  9e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 
784 aa  273  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 
974 aa  271  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  29.76 
 
 
1197 aa  270  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
762 aa  270  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
781 aa  269  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
865 aa  268  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
865 aa  268  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  31.67 
 
 
878 aa  262  4e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0714  CheA signal transduction histidine kinases  29.13 
 
 
1020 aa  262  5e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
941 aa  262  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  1.59984e-05 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
756 aa  261  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  32.74 
 
 
785 aa  260  1e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  33.67 
 
 
774 aa  260  2e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  32.93 
 
 
769 aa  260  2e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  29.58 
 
 
764 aa  257  1e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  32.93 
 
 
769 aa  257  1e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  32.73 
 
 
769 aa  257  2e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  33.27 
 
 
770 aa  256  4e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 
911 aa  254  8e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 
911 aa  254  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  33.13 
 
 
770 aa  253  2e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  32.53 
 
 
783 aa  253  4e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
679 aa  251  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  37.06 
 
 
839 aa  250  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.33 
 
 
764 aa  250  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 
666 aa  249  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 
760 aa  248  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
679 aa  248  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 
989 aa  246  2e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>