More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0537 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 364 aa  730    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  92.31 
 
 		 361 aa  644    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  79.5 
 
 		 358 aa  548  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  56.29 
 
 		 341 aa  371  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  55.71 
 
 		 347 aa  351  8.999999999999999e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  38.35 
 
 		 347 aa  193  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  38.7 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  34.78 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  37.93 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  33.62 
 
 		 363 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  34.29 
 
 		 336 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  34.78 
 
 		 398 aa  163  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  33.8 
 
 		 343 aa  160  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  35.14 
 
 		 383 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  35.43 
 
 		 383 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  32.87 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  35.85 
 
 		 327 aa  155  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  36.23 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  34.87 
 
 		 383 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  34.4 
 
 		 374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  32.96 
 
 		 349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  34.59 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  30.28 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  29.46 
 
 		 335 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  36.24 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  33.44 
 
 		 352 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  33.24 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  28.61 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  37.62 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  30.09 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  30.3 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  30.83 
 
 		 348 aa  122  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  30.83 
 
 		 348 aa  122  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  30.83 
 
 		 348 aa  122  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  33.43 
 
 		 378 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  33.24 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  35.74 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  31.73 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  27.75 
 
 		 383 aa  92.8  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  27.17 
 
 		 358 aa  92.8  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  28.51 
 
 		 264 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  29.23 
 
 		 359 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  28.81 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  29.82 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  27.27 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3510  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  24.59 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  34.59 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  28.62 
 
 		 483 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  25.64 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  34.93 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  32.04 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  31.32 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0608  peptidase M48, Ste24p  29.61 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.485097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  32.76 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  33.86 
 
 		 493 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  29.95 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  33.53 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  29.26 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  28.45 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  29.53 
 
 		 479 aa  70.1  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  32.12 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  27.33 
 
 		 632 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  32.95 
 
 		 479 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  27.33 
 
 		 632 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  27.5 
 
 		 445 aa  69.7  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  28.22 
 
 		 260 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  32.62 
 
 		 513 aa  69.3  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  28.22 
 
 		 260 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  30.12 
 
 		 604 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  32 
 
 		 514 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  30.81 
 
 		 474 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  26.36 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  32.39 
 
 		 549 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  25.41 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  31.76 
 
 		 541 aa  66.2  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  31.31 
 
 		 503 aa  66.2  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  27 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  25.51 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  29.02 
 
 		 565 aa  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  32.61 
 
 		 553 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  32.53 
 
 		 548 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  32.75 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  28.69 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  32.16 
 
 		 504 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  30.08 
 
 		 479 aa  64.3  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  26.96 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  32.3 
 
 		 528 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  29.19 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  28.25 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  28.35 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  32.58 
 
 		 589 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  30.33 
 
 		 482 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  32.16 
 
 		 605 aa  63.5  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  30.33 
 
 		 513 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  30.53 
 
 		 493 aa  63.2  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0829  peptidase M48 Ste24p  27.51 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  30.53 
 
 		 475 aa  62.8  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  29.59 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  25.83 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  31.76 
 
 		 521 aa  62.8  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>