96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0430 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0430  MaoC domain protein dehydratase  100 
 
 
306 aa  617  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183193  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0415  MaoC domain protein dehydratase  93.14 
 
 
306 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134356 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2776  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  46.62 
 
 
311 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272996  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1674  MaoC domain protein dehydratase  48.99 
 
 
314 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1258  dehydratase  48.04 
 
 
280 aa  225  6e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196595  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1702  dehydratase  45.65 
 
 
305 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00665806  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38940  acyl dehydratase  41.61 
 
 
286 aa  188  8e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0308  MaoC domain protein dehydratase  43.11 
 
 
284 aa  188  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2849  dehydratase  40 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6974  MaoC domain protein dehydratase  42.7 
 
 
267 aa  172  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5510  hypothetical protein  39.78 
 
 
285 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2077  dehydratase  42.02 
 
 
291 aa  169  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2939  MaoC domain protein dehydratase  38.67 
 
 
300 aa  165  9e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0643  MaoC-like dehydratase  38.74 
 
 
286 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0654  MaoC-like dehydratase  39.48 
 
 
284 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63290  hypothetical protein  39.78 
 
 
285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230888  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1070  MaoC-like dehydratase  35.07 
 
 
305 aa  159  7e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000325805  normal  0.560447 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0742  dehydratase  38.95 
 
 
285 aa  159  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.780848  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1308  hypothetical protein  35.45 
 
 
305 aa  159  8e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000275009  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0441  dehydratase  33.09 
 
 
279 aa  158  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000513118  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4026  MaoC domain protein dehydratase  40.28 
 
 
292 aa  157  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.123863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0742  MaoC-like domain protein  38.08 
 
 
285 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81902  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0140  dehydratase  39.43 
 
 
297 aa  155  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0146  dehydratase  40.07 
 
 
306 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861571  decreased coverage  0.0000240434 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1689  MaoC domain protein dehydratase  38.38 
 
 
284 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0315419  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4341  dehydratase  32.98 
 
 
294 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.18708  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1760  MaoC domain protein dehydratase  38.19 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3721  dehydratase  31.58 
 
 
288 aa  153  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000101981  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0535  putative signal peptide protein  65.15 
 
 
152 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.186468 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21230  acyl dehydratase  38.49 
 
 
335 aa  151  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0611  dehydratase  32.75 
 
 
288 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000129975  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2189  MaoC-like dehydratase  40.25 
 
 
284 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0580  MaoC domain-containing protein  38.04 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1388  dehydratase  33.97 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000424588  unclonable  0.000000000439784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0619  dehydratase  36.26 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965685  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3017  MaoC domain-containing protein dehydratase  35.79 
 
 
285 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176864  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0197  MaoC domain protein dehydratase  35.56 
 
 
297 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3750  MaoC domain protein dehydratase  33.09 
 
 
287 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0600605  normal  0.381685 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3932  dehydratase  33.21 
 
 
276 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.212138  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0518  dehydratase  33.21 
 
 
276 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177397  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0524  MaoC-like dehydratase  30.99 
 
 
289 aa  143  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449112  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3806  dehydratase  33.21 
 
 
276 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000417553  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23460  acyl dehydratase  35.59 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.260821  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3522  dehydratase  32.04 
 
 
288 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0625  dehydratase  37.4 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406567 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0558  dehydratase  32.62 
 
 
287 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2380  MaoC domain protein dehydratase  37.71 
 
 
317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.087809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3471  dehydratase  32.86 
 
 
287 aa  139  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0559  dehydratase  32.86 
 
 
287 aa  139  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3315  dehydratase  32.13 
 
 
276 aa  139  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000241426  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0559  MaoC domain-containing protein  33.69 
 
 
276 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3148  MaoC domain-containing protein  32.29 
 
 
287 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113837  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3587  MaoC domain protein dehydratase  38.36 
 
 
311 aa  135  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3157  MaoC-like dehydratase  33.22 
 
 
320 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00547969  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4584  dehydratase  34.88 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34970  acyl dehydratase  35.69 
 
 
339 aa  132  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0239  MaoC-like dehydratase  33.46 
 
 
281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0249  dehydratase  33.46 
 
 
281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0229  dehydratase  33.46 
 
 
281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10244  hypothetical protein  35.43 
 
 
280 aa  126  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0093701  normal  0.943124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0413  dehydratase  34.23 
 
 
282 aa  122  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0697277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2146  dehydratase  31.27 
 
 
307 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3115  MaoC domain protein dehydratase  35.43 
 
 
333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03008  MaoC domain protein dehydratase  31.14 
 
 
291 aa  119  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104203  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0258  dehydratase  32.32 
 
 
284 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.115215 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1893  MaoC domain protein dehydratase  32.23 
 
 
335 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0426  MaoC domain protein dehydratase  33.21 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.252327  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11740  MaoC-like protein  31.29 
 
 
297 aa  110  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0694748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4455  MaoC domain protein dehydratase  30 
 
 
296 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00945579  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3954  dehydratase  24.41 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3316  hypothetical protein  25.08 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2103  hypothetical protein  26.05 
 
 
294 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0785743  normal  0.016568 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1633  (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase  59.46 
 
 
3172 aa  50.1  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21390  acyl dehydratase  41.67 
 
 
157 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000515647  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1994  MaoC domain protein dehydratase  56.76 
 
 
3083 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1594  dehydratase  35.05 
 
 
161 aa  47  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.691822  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1315  MaoC domain protein dehydratase  56.76 
 
 
3102 aa  46.2  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  34.44 
 
 
142 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
710 aa  46.2  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0563  MaoC domain protein dehydratase  34.58 
 
 
144 aa  45.4  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.127994  normal  0.0650042 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04370  fatty-acid synthase complex protein, putative  40.28 
 
 
2513 aa  45.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0195236  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1197  MaoC-like protein  51.35 
 
 
3192 aa  44.3  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0407928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  48.65 
 
 
137 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  60.53 
 
 
141 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2497  MaoC domain protein dehydratase  44.07 
 
 
134 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  43.08 
 
 
133 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  39.71 
 
 
127 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4332  dehydratase  55.1 
 
 
130 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3797  dehydratase  31.91 
 
 
132 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  44.78 
 
 
130 aa  43.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3721  fatty acid synthase  53.85 
 
 
3077 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.875058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12545  fatty acid synthase fas  53.85 
 
 
3069 aa  42.7  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.696473  decreased coverage  0.00343939 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3661  fatty acid synthase  53.85 
 
 
3075 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.23097 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  40.91 
 
 
144 aa  42.7  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3648  fatty acid synthase  53.85 
 
 
3077 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  48.84 
 
 
142 aa  42.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>