More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0418 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  86.69 
 
 		 523 aa  854    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 		 503 aa  1008    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  98.21 
 
 		 503 aa  992    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0510  apolipoprotein N-acyltransferase  67.36 
 
 		 524 aa  631  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511831  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  66.46 
 
 		 510 aa  621  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2726  apolipoprotein N-acyltransferase  52.1 
 
 		 567 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0407  apolipoprotein N-acyltransferase  51.08 
 
 		 564 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78277  normal  0.233372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6026  apolipoprotein N-acyltransferase  50.19 
 
 		 562 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2751  apolipoprotein N-acyltransferase  52.07 
 
 		 562 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444108  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2616  apolipoprotein N-acyltransferase  52.47 
 
 		 562 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0586  apolipoprotein N-acyltransferase  50 
 
 		 571 aa  481  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2087  apolipoprotein N-acyltransferase  51.05 
 
 		 567 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187747  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2699  apolipoprotein N-acyltransferase  51.05 
 
 		 567 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000283733  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0625  apolipoprotein N-acyltransferase  49.61 
 
 		 567 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0600  apolipoprotein N-acyltransferase  50.69 
 
 		 553 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3334  apolipoprotein N-acyltransferase  47.48 
 
 		 582 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.499479  normal  0.16189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  42.94 
 
 		 532 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000838838  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3531  apolipoprotein N-acyltransferase  43.35 
 
 		 487 aa  359  8e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  46.11 
 
 		 520 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  42.44 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0703  apolipoprotein N-acyltransferase  60.36 
 
 		 568 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0883  apolipoprotein N-acyltransferase  60.36 
 
 		 568 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0718  apolipoprotein N-acyltransferase  60.36 
 
 		 568 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428564  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4762  apolipoprotein N-acyltransferase  45.92 
 
 		 529 aa  351  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219906  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1862  apolipoprotein N-acyltransferase  41.33 
 
 		 503 aa  350  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.480638  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2352  apolipoprotein N-acyltransferase  60 
 
 		 568 aa  350  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0220  apolipoprotein N-acyltransferase  60 
 
 		 568 aa  350  5e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2432  apolipoprotein N-acyltransferase  60 
 
 		 568 aa  350  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.959301  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2726  apolipoprotein N-acyltransferase  60 
 
 		 568 aa  350  5e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1272  apolipoprotein N-acyltransferase  47.13 
 
 		 550 aa  344  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  41.49 
 
 		 497 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0540  apolipoprotein N-acyltransferase  45.34 
 
 		 532 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0524  apolipoprotein N-acyltransferase  45.34 
 
 		 532 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0553952 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0440  apolipoprotein N-acyltransferase  44.51 
 
 		 516 aa  336  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3832  apolipoprotein N-acyltransferase  46.61 
 
 		 552 aa  335  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.826992 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0869  apolipoprotein N-acyltransferase  43.79 
 
 		 509 aa  331  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3384  putative apolipoprotein N-acyltransferase transmembrane  44 
 
 		 526 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.466672 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1566  apolipoprotein N-acyltransferase  37.4 
 
 		 500 aa  328  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.910854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4208  apolipoprotein N-acyltransferase  44.92 
 
 		 548 aa  315  8e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  37.48 
 
 		 509 aa  293  5e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2158  apolipoprotein N-acyltransferase  46.17 
 
 		 536 aa  291  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  36.06 
 
 		 529 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  36.72 
 
 		 512 aa  290  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  37.33 
 
 		 509 aa  290  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  36.72 
 
 		 512 aa  290  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  37.28 
 
 		 512 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  36.06 
 
 		 529 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  36.06 
 
 		 529 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  38.52 
 
 		 509 aa  289  7e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  36.06 
 
 		 529 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  36.89 
 
 		 512 aa  288  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4184  apolipoprotein N-acyltransferase  45.16 
 
 		 534 aa  289  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39031 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  37.09 
 
 		 512 aa  289  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  36.06 
 
 		 529 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  36.52 
 
 		 512 aa  288  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  36.52 
 
 		 512 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  36.13 
 
 		 506 aa  286  8e-76  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  36.42 
 
 		 512 aa  281  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  36.71 
 
 		 521 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  39.32 
 
 		 504 aa  278  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  39.8 
 
 		 507 aa  277  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3697  apolipoprotein N-acyltransferase  40.13 
 
 		 574 aa  274  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  36.84 
 
 		 512 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  33.13 
 
 		 524 aa  271  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  36.4 
 
 		 508 aa  270  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  36.82 
 
 		 511 aa  269  7e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  35.81 
 
 		 515 aa  266  8.999999999999999e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  35.81 
 
 		 515 aa  266  8.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  35.81 
 
 		 515 aa  266  8.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  33.74 
 
 		 510 aa  259  6e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  35.56 
 
 		 505 aa  258  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  34.06 
 
 		 514 aa  257  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  39.04 
 
 		 505 aa  257  4e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  33.86 
 
 		 492 aa  254  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  37.83 
 
 		 479 aa  253  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  36.77 
 
 		 489 aa  252  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  33.99 
 
 		 506 aa  250  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  35.16 
 
 		 518 aa  249  6e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1180  apolipoprotein N-acyltransferase  36.69 
 
 		 509 aa  249  6e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  37.34 
 
 		 505 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  36.29 
 
 		 505 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  36.5 
 
 		 505 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  36.14 
 
 		 509 aa  248  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0477  apolipoprotein N-acyltransferase  34.04 
 
 		 488 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  36.55 
 
 		 507 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  32.79 
 
 		 518 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  31.93 
 
 		 501 aa  243  6e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0630  apolipoprotein N-acyltransferase  37 
 
 		 505 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.112466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  34.26 
 
 		 516 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  34.19 
 
 		 519 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  34.67 
 
 		 507 aa  239  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  34 
 
 		 516 aa  239  9e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  34.63 
 
 		 523 aa  238  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  33.59 
 
 		 511 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  35.73 
 
 		 500 aa  236  9e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0889  apolipoprotein N-acyltransferase  38.49 
 
 		 510 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.623273  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  32.17 
 
 		 520 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0811  apolipoprotein N-acyltransferase  31.46 
 
 		 541 aa  232  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  35.01 
 
 		 506 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  34.8 
 
 		 506 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>