297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0412 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  100 
 
 		 292 aa  590  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  98.63 
 
 		 292 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  90.16 
 
 		 288 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  67.11 
 
 		 292 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  66.21 
 
 		 286 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  59.41 
 
 		 300 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  60.2 
 
 		 300 aa  349  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  69.33 
 
 		 295 aa  349  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  68.27 
 
 		 295 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  68.91 
 
 		 292 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  68.91 
 
 		 292 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  68.91 
 
 		 292 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  68.91 
 
 		 292 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  68.91 
 
 		 292 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  68.91 
 
 		 292 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  70.46 
 
 		 285 aa  345  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  59.93 
 
 		 285 aa  345  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  68.49 
 
 		 292 aa  345  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  70.46 
 
 		 303 aa  345  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  67.87 
 
 		 295 aa  344  8e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  67.87 
 
 		 295 aa  344  8e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  69.62 
 
 		 316 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  67.74 
 
 		 301 aa  339  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  50.61 
 
 		 320 aa  245  8e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  48.95 
 
 		 318 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  43.11 
 
 		 340 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  46.64 
 
 		 321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  48.95 
 
 		 310 aa  218  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  47.06 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  44.4 
 
 		 306 aa  209  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  44.03 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  39.53 
 
 		 314 aa  205  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  40.79 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  42.92 
 
 		 239 aa  175  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  40.34 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  41.2 
 
 		 236 aa  159  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  36.8 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  39.45 
 
 		 218 aa  155  9e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  36.44 
 
 		 240 aa  147  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  35.77 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  30.65 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  39.32 
 
 		 242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  27.43 
 
 		 241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  30.38 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  38.76 
 
 		 217 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  30.47 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  29.03 
 
 		 251 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  29.91 
 
 		 227 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  27.85 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  29.44 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  27.6 
 
 		 237 aa  116  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  30.2 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  31.9 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  32 
 
 		 240 aa  114  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  30.23 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  29.06 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  27.97 
 
 		 238 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  27.8 
 
 		 244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  30.45 
 
 		 226 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  29.55 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  34.83 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  27.52 
 
 		 235 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  28.82 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  28.82 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  33.63 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  31.02 
 
 		 223 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  28.51 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  30.77 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  31.34 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  33.83 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  30.41 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  30.73 
 
 		 224 aa  106  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  30.94 
 
 		 227 aa  106  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  29.96 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  42.31 
 
 		 241 aa  106  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  29.82 
 
 		 251 aa  106  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  30 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  29.82 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  32.41 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  30.14 
 
 		 223 aa  104  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  27.35 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  29.49 
 
 		 245 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  31.88 
 
 		 244 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  30.73 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  30.77 
 
 		 481 aa  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  34.08 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  32.03 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  28.82 
 
 		 243 aa  99.8  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  32.07 
 
 		 266 aa  99.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  27.56 
 
 		 234 aa  99.4  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  30.08 
 
 		 254 aa  99.4  7e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  28.99 
 
 		 245 aa  99  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  28.02 
 
 		 231 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  29.03 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  34.09 
 
 		 254 aa  97.8  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  28.77 
 
 		 237 aa  97.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  31.28 
 
 		 236 aa  96.7  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  31.17 
 
 		 242 aa  96.7  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  22.75 
 
 		 238 aa  96.3  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  32.18 
 
 		 249 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>