More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0409 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 281 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  96.09 
 
 		 281 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  90.75 
 
 		 281 aa  513  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  74.64 
 
 		 278 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  72.76 
 
 		 278 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2735  dimethyladenosine transferase  68.48 
 
 		 275 aa  347  9e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.486994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2096  dimethyladenosine transferase  68.48 
 
 		 275 aa  347  9e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249721  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2708  dimethyladenosine transferase  68.48 
 
 		 275 aa  347  9e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6035  dimethyladenosine transferase  68.48 
 
 		 275 aa  347  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0678  dimethyladenosine transferase  66.79 
 
 		 276 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0399  dimethyladenosine transferase  68.3 
 
 		 276 aa  343  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136903 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4021  dimethyladenosine transferase  65.82 
 
 		 277 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00888486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2760  dimethyladenosine transferase  66.79 
 
 		 276 aa  340  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0591  dimethyladenosine transferase  67.27 
 
 		 275 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2626  dimethyladenosine transferase  67.77 
 
 		 273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0696362  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0211  dimethyladenosine transferase  65.58 
 
 		 275 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2344  dimethyladenosine transferase  65.58 
 
 		 275 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0874  dimethyladenosine transferase  65.58 
 
 		 275 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2424  dimethyladenosine transferase  65.58 
 
 		 275 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.304895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2734  dimethyladenosine transferase  65.58 
 
 		 275 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0709  dimethyladenosine transferase  64.87 
 
 		 275 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.589315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0695  dimethyladenosine transferase  64.87 
 
 		 275 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0578  dimethyladenosine transferase  67.18 
 
 		 275 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  59.69 
 
 		 255 aa  302  5.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  53.64 
 
 		 270 aa  285  5.999999999999999e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  58.82 
 
 		 269 aa  285  8e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  54.44 
 
 		 269 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  56.87 
 
 		 272 aa  281  9e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  59.77 
 
 		 255 aa  281  9e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  56.82 
 
 		 272 aa  280  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  54.89 
 
 		 268 aa  278  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  53.82 
 
 		 267 aa  276  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  55.68 
 
 		 272 aa  276  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  53.93 
 
 		 273 aa  276  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0101  dimethyladenosine transferase  53.56 
 
 		 273 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.610999 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00055  dimethyladenosine transferase  53.93 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  53.93 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  53.93 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0045  dimethyladenosine transferase  53.93 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0201107  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0094  dimethyladenosine transferase  53.56 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.479208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  53.56 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0055  dimethyladenosine transferase  53.93 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.361541  normal  0.68578 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  53.93 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00054  hypothetical protein  53.93 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0997652  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0099  dimethyladenosine transferase  53.56 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321347  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  53.93 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  52.96 
 
 		 267 aa  276  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6033  dimethyladenosine transferase  61.02 
 
 		 268 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  54.58 
 
 		 268 aa  275  6e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  54.68 
 
 		 272 aa  275  6e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  54.58 
 
 		 268 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  53.44 
 
 		 267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  52.24 
 
 		 268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  54.14 
 
 		 267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  54.58 
 
 		 268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  55.68 
 
 		 272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  53.18 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5273  dimethyladenosine transferase  59.69 
 
 		 255 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  54.58 
 
 		 268 aa  273  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  53.79 
 
 		 268 aa  271  6e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  54.96 
 
 		 259 aa  271  8.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  54.65 
 
 		 255 aa  271  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  53.05 
 
 		 268 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  53.05 
 
 		 268 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  53.05 
 
 		 268 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  53.05 
 
 		 268 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0724  dimethyladenosine transferase  52.81 
 
 		 272 aa  267  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682335  normal  0.907502 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  52.29 
 
 		 267 aa  267  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0600  dimethyladenosine transferase  51.11 
 
 		 273 aa  266  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0096  dimethyladenosine transferase  56.6 
 
 		 261 aa  266  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  53.38 
 
 		 272 aa  264  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  53.38 
 
 		 272 aa  264  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  52.63 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  53.01 
 
 		 272 aa  263  3e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  52.26 
 
 		 269 aa  263  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  53.1 
 
 		 266 aa  262  4.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3468  dimethyladenosine transferase  58.04 
 
 		 253 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659211  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4526  dimethyladenosine transferase  51.16 
 
 		 301 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0368  dimethyladenosine transferase  50.55 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4110  dimethyladenosine transferase  57.25 
 
 		 253 aa  259  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  51.33 
 
 		 267 aa  255  5e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  50.57 
 
 		 271 aa  254  8e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1559  dimethyladenosine transferase  49.64 
 
 		 281 aa  252  4.0000000000000004e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  52.53 
 
 		 268 aa  248  6e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  52.51 
 
 		 272 aa  248  9e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  50.57 
 
 		 268 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0204  dimethyladenosine transferase  60.64 
 
 		 256 aa  247  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.919741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  52.53 
 
 		 266 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  51.75 
 
 		 268 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4074  dimethyladenosine transferase  52.04 
 
 		 279 aa  246  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  48.73 
 
 		 276 aa  245  4.9999999999999997e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4810  dimethyladenosine transferase  53.64 
 
 		 284 aa  245  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.482961  normal  0.0271814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  52.14 
 
 		 267 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  51.88 
 
 		 266 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4762  dimethyladenosine transferase  57.59 
 
 		 253 aa  244  8e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  51.75 
 
 		 268 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  53.26 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  51.14 
 
 		 268 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  51.75 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  50.19 
 
 		 272 aa  242  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>