More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0344 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0778  FAD linked oxidase domain-containing protein  70.51 
 
 		 1265 aa  1884    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.756982 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1918  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.9 
 
 		 1282 aa  1359    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1263  FAD linked oxidase domain protein  37.1 
 
 		 1202 aa  774    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018481 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1757  oxidoreductase, putative  68.94 
 
 		 1308 aa  1817    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0454  putative oxidoreductase protein  94.57 
 
 		 1345 aa  2603    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.306454 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0690  FAD linked oxidase domain protein  64.78 
 
 		 1292 aa  1731    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0329  FAD linked oxidase domain protein  99.63 
 
 		 1345 aa  2774    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0344  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 1345 aa  2780    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0646  FAD linked oxidase domain protein  79.67 
 
 		 1364 aa  2242    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.801662  normal  0.70972 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0183  oxidoreductase, FAD-binding  80.81 
 
 		 1342 aa  2234    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0664  oxidoreductase, FAD-binding  80.89 
 
 		 1342 aa  2238    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1445  FAD linked oxidase domain protein  56.35 
 
 		 1277 aa  1441    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1605  FAD linked oxidase domain protein  36.83 
 
 		 1218 aa  744    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2762  FAD linked oxidase domain-containing protein  81.02 
 
 		 1341 aa  2224    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4121  hypothetical protein  66.82 
 
 		 1291 aa  1789    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0427  hypothetical protein  86.1 
 
 		 1324 aa  2381    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2653  FAD linked oxidase domain-containing protein  80.64 
 
 		 1340 aa  2212    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0564  FAD linked oxidase domain-containing protein  81.13 
 
 		 1344 aa  2231    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0219  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  65.34 
 
 		 1259 aa  1713    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.524228  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1652  FAD linked oxidase domain protein  37.16 
 
 		 1210 aa  742    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154476  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0842  oxidoreductase, FAD-binding  80.89 
 
 		 1342 aa  2238    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2315  oxidoreductase, FAD-binding  80.81 
 
 		 1342 aa  2234    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401308  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3648  FAD linked oxidase domain-containing protein  69.86 
 
 		 1304 aa  1909    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6062  hypothetical protein  80.43 
 
 		 1341 aa  2224    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0799  oxidoreductase, FAD-binding  36.84 
 
 		 1214 aa  769    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.549534  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2778  FAD linked oxidase domain-containing protein  59.22 
 
 		 1289 aa  1543    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.826538  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0750  FAD linked oxidase domain-containing protein  71.91 
 
 		 1309 aa  1961    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.886785 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1899  FAD linked oxidase domain-containing protein  71.6 
 
 		 1279 aa  1973    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1604  FAD linked oxidase domain protein  70.93 
 
 		 1279 aa  1950    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0954  FAD linked oxidase domain protein  37.06 
 
 		 1221 aa  773    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.798871 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5464  FAD linked oxidase domain-containing protein  69.11 
 
 		 1304 aa  1895    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3218  FAD linked oxidase domain protein  35.65 
 
 		 1212 aa  744    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0550  oxidoreductase, FAD-binding  80.59 
 
 		 1359 aa  2217    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2738  putative oxidoreductase protein  71.59 
 
 		 1308 aa  1912    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0789331 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0371  FAD linked oxidase domain-containing protein  79.54 
 
 		 1371 aa  2209    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.717387 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3018  FAD linked oxidase-like  36.56 
 
 		 1213 aa  764    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1511  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.03 
 
 		 1218 aa  771    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2395  oxidoreductase, FAD-binding  80.81 
 
 		 1342 aa  2234    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1288  FAD linked oxidase-like  68.52 
 
 		 1307 aa  1893    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0053  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.2 
 
 		 1286 aa  1427    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0476  FAD linked oxidase-like protein  64.41 
 
 		 1271 aa  1723    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0858  FAD linked oxidase-like  71.03 
 
 		 1300 aa  1950    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4053  putative oxidoreductase  80.38 
 
 		 1349 aa  2238    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1309  FAD linked oxidase domain-containing protein  68.07 
 
 		 1292 aa  1832    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0367  FAD linked oxidase-like protein  84.98 
 
 		 1324 aa  2353    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4132  FAD linked oxidase domain protein  71.84 
 
 		 1292 aa  1948    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3117  FAD linked oxidase domain protein  35.65 
 
 		 1212 aa  744    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2763  oxidoreductase, FAD-binding  80.81 
 
 		 1342 aa  2234    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0680  oxidoreductase, FAD-binding  80.74 
 
 		 1342 aa  2233    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.837218  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2123  FAD linked oxidase-like  81.02 
 
 		 1341 aa  2224    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1769  oxidoreductase, FAD-binding, putative  56.35 
 
 		 1277 aa  1441    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0793  FAD linked oxidase domain protein  68.52 
 
 		 1307 aa  1865    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.147444  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0545  FAD linked oxidase domain protein  57.39 
 
 		 1280 aa  1555    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.650585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1638  FAD linked oxidase domain-containing protein  59.18 
 
 		 1288 aa  1556    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0864  FAD linked oxidase domain-containing protein  68.52 
 
 		 1307 aa  1866    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411484 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2786  FAD linked oxidase domain-containing protein  80.56 
 
 		 1340 aa  2212    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616835  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  81.02 
 
 		 1341 aa  2224    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.330233  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1789  FAD linked oxidase domain protein  31.58 
 
 		 1183 aa  499  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0377487  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1131  FAD linked oxidase domain protein  30.26 
 
 		 1197 aa  489  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1235  oxidoreductase, FAD-binding  37.38 
 
 		 1217 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2999  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.57 
 
 		 1227 aa  399  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2353  FAD linked oxidase domain protein  39.46 
 
 		 1204 aa  261  8e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0044  FAD linked oxidase domain protein  33.73 
 
 		 1183 aa  258  5e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.559839  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0312  oxidoreductase  36.61 
 
 		 1188 aa  252  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0306  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.05 
 
 		 1187 aa  249  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  26.15 
 
 		 456 aa  110  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25 
 
 		 459 aa  108  7e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.3 
 
 		 459 aa  108  7e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.57 
 
 		 460 aa  107  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.2 
 
 		 460 aa  107  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.2 
 
 		 460 aa  107  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  26.38 
 
 		 472 aa  105  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.06 
 
 		 469 aa  105  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.82 
 
 		 460 aa  105  6e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1012  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  23.95 
 
 		 430 aa  105  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  26.38 
 
 		 472 aa  104  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.14 
 
 		 411 aa  101  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  25.12 
 
 		 461 aa  99  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1372  hypothetical protein  23.09 
 
 		 423 aa  98.6  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000298572  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  23.11 
 
 		 461 aa  98.2  9e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2260  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.63 
 
 		 485 aa  97.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.034873 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0843  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  21.81 
 
 		 418 aa  97.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000303103  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  25.36 
 
 		 473 aa  96.3  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.4 
 
 		 434 aa  96.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  25.81 
 
 		 473 aa  96.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.58 
 
 		 456 aa  95.9  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  25.45 
 
 		 457 aa  95.9  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.63 
 
 		 475 aa  94.7  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  25.54 
 
 		 473 aa  94.7  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.54 
 
 		 473 aa  94.7  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1664  glycolate oxidase subunit GlcD  27.25 
 
 		 489 aa  94  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.922134  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1047  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.42 
 
 		 429 aa  94  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  26.07 
 
 		 473 aa  93.2  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  26.07 
 
 		 473 aa  93.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  26.07 
 
 		 473 aa  93.2  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  26.07 
 
 		 524 aa  93.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  26.07 
 
 		 473 aa  93.2  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  24.89 
 
 		 481 aa  93.2  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  26.07 
 
 		 473 aa  93.2  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.62 
 
 		 472 aa  93.2  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>