219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0284 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  100 
 
 		 217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  97.24 
 
 		 217 aa  390  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  86.64 
 
 		 216 aa  349  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  58.85 
 
 		 220 aa  263  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  61.5 
 
 		 217 aa  252  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  53.69 
 
 		 211 aa  237  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  53.69 
 
 		 210 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  51.43 
 
 		 211 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  52.22 
 
 		 211 aa  218  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  49.52 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  49.52 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  49.52 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  49.52 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  49.52 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  49.52 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  49.52 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  51.23 
 
 		 211 aa  211  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  51.23 
 
 		 211 aa  211  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  48.34 
 
 		 210 aa  210  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  50.74 
 
 		 211 aa  208  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  50.74 
 
 		 211 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  50.74 
 
 		 211 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  50.74 
 
 		 211 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  45.41 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  42.93 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  38.81 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  44.28 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  41.63 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  42.86 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.1 
 
 		 222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  37.95 
 
 		 194 aa  144  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.5 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  39.9 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.42 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.27 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.35 
 
 		 190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.5 
 
 		 209 aa  132  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.2 
 
 		 196 aa  131  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  40.31 
 
 		 196 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.96 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.24 
 
 		 191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.97 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  35.9 
 
 		 194 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  36.59 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  35.38 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  36.32 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.35 
 
 		 196 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  35.86 
 
 		 196 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  37.31 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  33 
 
 		 196 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.84 
 
 		 196 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.8 
 
 		 183 aa  95.5  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  33.16 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 197 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.33 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  32.32 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  34.15 
 
 		 196 aa  89.4  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.46 
 
 		 193 aa  88.6  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.93 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.89 
 
 		 213 aa  84.7  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.33 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  45.1 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.64 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  28.35 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.84 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.84 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.84 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0170  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.1 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  30.77 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.8 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.8 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.14 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.8 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0737  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.43 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  30.39 
 
 		 184 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  43.48 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10439  hypothetical protein  43.88 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.292057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.85 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  33.16 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  45.74 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  45.74 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  47.19 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  30.85 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.61 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.63 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  30.33 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  23.74 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  31.52 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  31.07 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  40 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3194  peptidase S16 lon domain protein  24.9 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  45.26 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  27.64 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.52 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  30.96 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  37.27 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  38.94 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  31 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  30.05 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.64 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>