More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0226 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0226  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
249 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000578228 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0207  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  93.57 
 
 
249 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.430763  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0351  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  87.15 
 
 
249 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0392139 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2245  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  66.8 
 
 
250 aa  345  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2859  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  66.8 
 
 
250 aa  345  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  67.6 
 
 
252 aa  345  5e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.853411  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3210  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  66.67 
 
 
252 aa  343  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6188  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  66.4 
 
 
271 aa  344  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0476  HesA/MoeB/ThiF family protein  67.21 
 
 
252 aa  343  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1409  HesA/MoeB/ThiF family protein  66.67 
 
 
252 aa  343  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4183  putative molybdopterin biosynthesis protein  66.8 
 
 
252 aa  343  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0495  HesA/MoeB/ThiF family protein  66.67 
 
 
252 aa  343  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2836  HesA/MoeB/ThiF family protein  66.67 
 
 
252 aa  343  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0183  HesA/MoeB/ThiF family protein  66.67 
 
 
252 aa  343  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  66.4 
 
 
252 aa  343  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  66 
 
 
250 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.318137 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0660  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  66.27 
 
 
252 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3860  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  70.04 
 
 
251 aa  341  5.999999999999999e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2830  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  67.2 
 
 
254 aa  338  4e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3507  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  67.2 
 
 
254 aa  338  5.9999999999999996e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0414  HesA/MoeB/ThiF family protein  65.48 
 
 
274 aa  337  9e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665894  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0302  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  70.28 
 
 
249 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2776  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  65.2 
 
 
250 aa  335  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  65.2 
 
 
250 aa  333  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0444  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  66 
 
 
250 aa  331  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441495  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1083  putative molybdopterin biosynthesis protein  65.99 
 
 
254 aa  327  9e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.365488  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2100  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  64 
 
 
251 aa  327  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  62.8 
 
 
250 aa  323  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0034  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  65.04 
 
 
249 aa  315  6e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.439342  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0249  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  68.8 
 
 
250 aa  314  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0606  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  59.92 
 
 
253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  61.94 
 
 
266 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0884  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  59.44 
 
 
259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1811  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  59.44 
 
 
250 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  62.75 
 
 
260 aa  289  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296557  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4105  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  56.63 
 
 
251 aa  285  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1118  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  57.09 
 
 
250 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0085  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  58.7 
 
 
251 aa  275  5e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0519  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding fold protein  53.85 
 
 
245 aa  275  7e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1062  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  55.42 
 
 
253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  54 
 
 
257 aa  270  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1111  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  54.66 
 
 
259 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1950  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  54.4 
 
 
250 aa  266  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61670  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  54 
 
 
252 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0763  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  53.41 
 
 
251 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  53.2 
 
 
254 aa  258  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.61 
 
 
253 aa  257  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1394  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.01 
 
 
278 aa  254  7e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4746  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  55.2 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159527  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2358  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50 
 
 
248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  46.94 
 
 
252 aa  253  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4224  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  46.37 
 
 
255 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41450  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  56 
 
 
252 aa  251  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  46.37 
 
 
255 aa  250  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0134  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  46.37 
 
 
255 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0135  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  46.37 
 
 
255 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0096  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.56 
 
 
256 aa  249  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0047  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.15 
 
 
255 aa  248  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3268  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.39 
 
 
280 aa  248  7e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  51 
 
 
259 aa  248  7e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0387  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold protein  46.4 
 
 
257 aa  247  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4770  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  45.34 
 
 
256 aa  246  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0735  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  53.41 
 
 
251 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1931  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  46.15 
 
 
249 aa  245  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4492  adenylyltransferase ThiF  48.59 
 
 
252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0951  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  54.25 
 
 
259 aa  245  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0421  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.61 
 
 
270 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4494  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  48.59 
 
 
252 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360756  hitchhiker  0.00000302852 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.22 
 
 
480 aa  244  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1265  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.21 
 
 
287 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.6 
 
 
249 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2171  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52 
 
 
255 aa  242  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.500707  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0951  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.2 
 
 
272 aa  240  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00521597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4568  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  48.19 
 
 
252 aa  240  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103081 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2390  adenylyltransferase  53.25 
 
 
251 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.648878  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0127  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.31 
 
 
256 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0282  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.34 
 
 
249 aa  240  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0113  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.72 
 
 
255 aa  241  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4405  adenylyltransferase ThiF  48.59 
 
 
252 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4378  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  45.78 
 
 
261 aa  240  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0776  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  52.61 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1000  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50 
 
 
247 aa  239  4e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2211  HesA/MoeB/ThiF family protein  49.8 
 
 
248 aa  238  5e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4372  adenylyltransferase ThiF  47.79 
 
 
252 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.56 
 
 
253 aa  237  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378887 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2974  molydopterin biosynthesis protein  49.19 
 
 
346 aa  237  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0131  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.56 
 
 
253 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000839209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0125  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.56 
 
 
253 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0188818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3793  molybdopterin biosynthesis protein  51.39 
 
 
271 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0613  adenylyltransferase  52.23 
 
 
248 aa  236  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1945  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50 
 
 
350 aa  235  6e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0410103  decreased coverage  0.00836902 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0362  adenylyl transferase  46.96 
 
 
250 aa  235  6e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0279  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.39 
 
 
273 aa  234  9e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266697  normal  0.0271151 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.22 
 
 
388 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.37 
 
 
389 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0462  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  50 
 
 
358 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.987597  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0513  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.81 
 
 
348 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0795436 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1380  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.22 
 
 
271 aa  233  3e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0137  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.15 
 
 
253 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0597  molybdopterin biosynthesis protein  48.57 
 
 
349 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.348969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>