123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0188 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0188  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  202  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0239865  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0182  hypothetical protein  98.99 
 
 		 99 aa  200  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0326  hypothetical protein  72.73 
 
 		 97 aa  148  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0224  hypothetical protein  69 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0281  hypothetical protein  68.32 
 
 		 101 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0500  protein of unknown function DUF493  67.06 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0729827 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0413  hypothetical protein  61.63 
 
 		 102 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327313  normal  0.0225093 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0213  hypothetical protein  64.37 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0382  hypothetical protein  60.47 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6234  hypothetical protein  60 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2276  hypothetical protein  60 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2891  hypothetical protein  60 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2901  hypothetical protein  60 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.968413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2941  hypothetical protein  60 
 
 		 102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2803  hypothetical protein  60 
 
 		 102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0056  hypothetical protein  59.3 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0622  hypothetical protein  59.3 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.534048  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0222  hypothetical protein  59.3 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1371  hypothetical protein  59.3 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0440  hypothetical protein  59.3 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0460  hypothetical protein  59.3 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.824675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3190  hypothetical protein  59.3 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4239  hypothetical protein  64.77 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0295  protein of unknown function DUF493  59.78 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.883661  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0300  hypothetical protein  56.57 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414202 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0364  hypothetical protein  62.07 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4879  protein of unknown function DUF493  58.62 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0243  protein of unknown function DUF493  59.52 
 
 		 94 aa  107  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0268  hypothetical protein  55.29 
 
 		 88 aa  105  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0412  hypothetical protein  61.18 
 
 		 105 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0472  hypothetical protein  50.94 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.439852  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1963  hypothetical protein  54.12 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1670  protein of unknown function DUF493  54.12 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0316  hypothetical protein  56.47 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.802626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3936  hypothetical protein  57.47 
 
 		 89 aa  97.1  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.224066  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2499  hypothetical protein  52.75 
 
 		 97 aa  97.1  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0289  hypothetical protein  48.24 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.68869 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0245  hypothetical protein  50.98 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4216  hypothetical protein  67.14 
 
 		 70 aa  94.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1989  hypothetical protein  45.54 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1265  protein of unknown function DUF493  47.62 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0383916  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0107  hypothetical protein  43.37 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1968  protein of unknown function DUF493  41.67 
 
 		 89 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2705  hypothetical protein  42.35 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1468  hypothetical protein  42.17 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1515  hypothetical protein  42.17 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3336  hypothetical protein  39.02 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000115113  normal  0.014798 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1346  hypothetical protein  37.35 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000528768  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1409  hypothetical protein  37.35 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623159  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1550  hypothetical protein  34.57 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3793  hypothetical protein  36 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0981  hypothetical protein  34.48 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35106  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0469  hypothetical protein  36.9 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000304752  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2953  hypothetical protein  37.8 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000897518  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1853  hypothetical protein  37.8 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000034763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3025  hypothetical protein  37.8 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00091395  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2409  hypothetical protein  36.05 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1637  hypothetical protein  28.09 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00057154  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1166  hypothetical protein  37.8 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.332478  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08440  hypothetical protein  37.8 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127353  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0678  hypothetical protein  36.9 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000567812  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0738  hypothetical protein  36.9 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00130336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0692  hypothetical protein  36.9 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0108716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0752  hypothetical protein  36.9 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0969467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0796  hypothetical protein  36.9 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00125939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1111  hypothetical protein  35.79 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1197  hypothetical protein  36.59 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00600  hypothetical protein  36.9 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0652819  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2995  protein of unknown function DUF493  36.9 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000919555  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0719  hypothetical protein  36.9 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal  0.764617 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0683  hypothetical protein  36.9 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.58222e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0656  hypothetical protein  36.9 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000367197  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3014  hypothetical protein  36.9 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00679596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0651  hypothetical protein  36.9 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000004684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0620  hypothetical protein  36.9 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00589  hypothetical protein  36.9 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.067474  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01651  hypothetical protein  31.71 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000575262  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12110  hypothetical protein  34.74 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004226  UPF0250 protein  33.33 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000561053  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01213  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3028  hypothetical protein  30.12 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0178  hypothetical protein  34.57 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2593  hypothetical protein  35.8 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00140819  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1163  hypothetical protein  34.15 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2940  hypothetical protein  39.02 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000039404  normal  0.0192635 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3490  hypothetical protein  37.8 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000408093 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04287  hypothetical protein  32.1 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0986  hypothetical protein  34.15 
 
 		 88 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105204  normal  0.0165558 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1051  hypothetical protein  34.15 
 
 		 88 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000671726  hitchhiker  0.00478592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0990  hypothetical protein  34.15 
 
 		 88 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000075069  normal  0.687839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4820  hypothetical protein  36.59 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2874  hypothetical protein  32.93 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000389579  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0556  hypothetical protein  30.86 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1711  hypothetical protein  30.49 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.654442  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3280  hypothetical protein  32.93 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000870695  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3322  hypothetical protein  32.93 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000559481  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3458  hypothetical protein  32.93 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00375963  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1087  hypothetical protein  32.93 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000786654  hitchhiker  0.0000064685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3713  hypothetical protein  36.59 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000213543  hitchhiker  0.00129495 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1088  hypothetical protein  37.8 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0973473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>