More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0130 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 232 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  99.56 
 
 		 229 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  82.82 
 
 		 229 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  66.2 
 
 		 235 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  57.59 
 
 		 227 aa  248  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4727  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  52.05 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5978  HAD family hydrolase  48.4 
 
 		 230 aa  188  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50.23 
 
 		 226 aa  184  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0330  HAD family hydrolase  49.33 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  46.73 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1631  HAD family hydrolase  50.68 
 
 		 230 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318646  normal  0.223643 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0467  HAD family hydrolase  48.85 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.530029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3773  HAD family hydrolase  48.86 
 
 		 220 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  41.52 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5788  HAD family hydrolase  46.58 
 
 		 227 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.438539 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.75 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5016  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50.23 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704684  normal  0.049198 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  42.59 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  43.12 
 
 		 219 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  39.25 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0996  HAD family hydrolase  40.18 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0106068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.9 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  41.36 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.13 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4360  HAD family hydrolase  51.74 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2077  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.92 
 
 		 231 aa  138  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0155497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  42.2 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2473  HAD family hydrolase  38.07 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0237734  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  40.32 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  37.98 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0442  HAD family hydrolase  36.11 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5021  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.89 
 
 		 223 aa  135  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.11436 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  37.9 
 
 		 242 aa  135  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0902  hydrolase, haloacid dehalogenase-like hydrolase  41.31 
 
 		 214 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  37.85 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0418  HAD family hydrolase  37.27 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0698  HAD-superfamily hydrolase  42.86 
 
 		 232 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0723  HAD family hydrolase  41.38 
 
 		 240 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.12 
 
 		 228 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2561  HAD family hydrolase  41.31 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.467395  normal  0.978444 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  37.73 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3243  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.95 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0124526  normal  0.9958 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.55 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0879  HAD family hydrolase  42.13 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  37.28 
 
 		 260 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2468  HAD-superfamily hydrolase  42.59 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273983  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0336  HAD-superfamily hydrolase  42.59 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438572  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1038  HAD-superfamily hydrolase  42.13 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0634  HAD-superfamily hydrolase  42.59 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.535941  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0082  HAD family hydrolase  42.59 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0196618  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  36.65 
 
 		 244 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  36.65 
 
 		 244 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2716  HAD family hydrolase  36.65 
 
 		 228 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0637  HAD family hydrolase  39.73 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3573  hypothetical protein  37.63 
 
 		 224 aa  128  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  38.12 
 
 		 230 aa  128  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  37.44 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3004  HAD family hydrolase  42.72 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.293742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  36.2 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11460  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.81 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0237278  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.09 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.12 
 
 		 228 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0896  HAD-superfamily hydrolase  38.01 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0875  HAD family hydrolase  42.59 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  35.4 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4948  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.05 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  41.63 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0716  haloacid dehalogenase, IA family protein  38.01 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  38.01 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  38.01 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  38.01 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  38.01 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  38.01 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0637  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.84 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872179  normal  0.213307 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  35.81 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0734377  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  40.44 
 
 		 224 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0694  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.28 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  39.36 
 
 		 224 aa  122  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0489  HAD superfamily hydrolase  38.12 
 
 		 228 aa  121  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0493  phosphoglycolate phosphatase  38.12 
 
 		 228 aa  121  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  35.65 
 
 		 245 aa  121  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  35.37 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  35.29 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  35.45 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  34.06 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  38.71 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4184  HAD family hydrolase  32.55 
 
 		 212 aa  119  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0596  HAD-superfamily hydrolase  36.07 
 
 		 240 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  39.82 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  37.56 
 
 		 396 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  34.26 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2640  HAD family hydrolase  40 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3747  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.71 
 
 		 229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.422409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02024  hydrolase  40.1 
 
 		 206 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.247086  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1330  HAD family hydrolase  42.19 
 
 		 230 aa  116  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4176  HAD family hydrolase  40.1 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  33.85 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4120  HAD family hydrolase  35 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4061  6-phosphogluconate phosphatase  33.49 
 
 		 221 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>