More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0118 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0118  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 317 aa  646    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.464415 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0111  beta-lactamase domain protein  96.21 
 
 		 317 aa  608  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524145  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  80.06 
 
 		 319 aa  498  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0121  beta-lactamase-like protein  63.11 
 
 		 309 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381436  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  60.84 
 
 		 314 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  56.46 
 
 		 306 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  56.46 
 
 		 306 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  54.24 
 
 		 306 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  53.14 
 
 		 317 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 309 aa  278  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  52.27 
 
 		 308 aa  278  7e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0531  beta-lactamase domain protein  51.95 
 
 		 308 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  48.84 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0431  beta-lactamase domain-containing protein  47.52 
 
 		 309 aa  270  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  47.57 
 
 		 306 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0583  beta-lactamase domain-containing protein  49.49 
 
 		 307 aa  267  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266418 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  48.5 
 
 		 310 aa  261  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  44.27 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  41.04 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  28.47 
 
 		 329 aa  89.4  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  27.51 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  30.19 
 
 		 205 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  25.89 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  30.87 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 		 400 aa  67  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  29.25 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  28.97 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  28.22 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  25.37 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0311  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  30.97 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.46 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  28.97 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  32.63 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  32.63 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  26.91 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  25.73 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5095  beta-lactamase domain protein  30.29 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.046641  normal  0.029207 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  32.11 
 
 		 214 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  32.93 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  31.96 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  28.86 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  37.19 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  31.58 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  31.85 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  26.1 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  26.84 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  32.98 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  27.4 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  28.19 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  28.3 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5378  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13255  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  27.36 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  33.54 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 		 595 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  26.77 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  32.1 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  32.1 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  24.9 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  32.28 
 
 		 209 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  31.85 
 
 		 208 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.33 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.68 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  25.2 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  25.57 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  32.28 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.28 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  30.97 
 
 		 209 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 		 214 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  29.41 
 
 		 218 aa  54.3  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.81 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  25.38 
 
 		 262 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  26.69 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  27.55 
 
 		 209 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  25.64 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  26.54 
 
 		 210 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.42 
 
 		 242 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  31.75 
 
 		 214 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  26.34 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  31.75 
 
 		 214 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  31.75 
 
 		 214 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  31.75 
 
 		 214 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  31.75 
 
 		 214 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  29.45 
 
 		 207 aa  53.5  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  31.55 
 
 		 214 aa  52.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  31.9 
 
 		 214 aa  52.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  27.96 
 
 		 212 aa  52.8  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.46 
 
 		 258 aa  52.8  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0421465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>