More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0108 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  50.42 
 
 		 763 aa  687    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  50.42 
 
 		 780 aa  686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  57.61 
 
 		 748 aa  791    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  49.72 
 
 		 768 aa  678    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  54.99 
 
 		 747 aa  793    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  97.5 
 
 		 759 aa  1482    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  44.22 
 
 		 730 aa  641    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2044  TonB-dependent receptor  52.34 
 
 		 776 aa  719    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  49.93 
 
 		 747 aa  704    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  47.43 
 
 		 760 aa  662    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  58.03 
 
 		 748 aa  803    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  48.81 
 
 		 773 aa  683    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0992  TonB-dependent siderophore receptor  48.83 
 
 		 762 aa  665    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221466  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  57.75 
 
 		 747 aa  811    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  58.33 
 
 		 772 aa  802    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  44.09 
 
 		 730 aa  639    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  56.41 
 
 		 749 aa  830    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  44.3 
 
 		 731 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  44.36 
 
 		 730 aa  642    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  47.5 
 
 		 753 aa  664    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  54.86 
 
 		 747 aa  791    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  50.61 
 
 		 766 aa  723    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  58.03 
 
 		 748 aa  803    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  57.89 
 
 		 748 aa  801    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  44.09 
 
 		 730 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  54.99 
 
 		 747 aa  793    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  54.59 
 
 		 747 aa  800    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 759 aa  1547    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  54.33 
 
 		 747 aa  799    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  44.16 
 
 		 731 aa  634  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  44.16 
 
 		 731 aa  632  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3914  TonB-dependent receptor, putative  45.08 
 
 		 730 aa  625  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1173  TonB-dependent siderophore receptor  46.94 
 
 		 741 aa  610  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  41.89 
 
 		 826 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  43.65 
 
 		 753 aa  600  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  44.55 
 
 		 741 aa  579  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  43.68 
 
 		 769 aa  552  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0044  TonB-dependent siderophore receptor  42.31 
 
 		 794 aa  535  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  42.86 
 
 		 740 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  38.56 
 
 		 724 aa  496  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  37.8 
 
 		 751 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  39.36 
 
 		 733 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  39.44 
 
 		 765 aa  435  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  38.94 
 
 		 733 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  38.03 
 
 		 731 aa  431  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  39.12 
 
 		 732 aa  422  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2088  TonB-dependent receptor  36.4 
 
 		 793 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0823412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3335  TonB-dependent receptor, plug  35.93 
 
 		 794 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3969  TonB-dependent siderophore receptor  35.55 
 
 		 793 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  35.36 
 
 		 769 aa  402  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  36.93 
 
 		 733 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  37.3 
 
 		 764 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  36.8 
 
 		 733 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  35.1 
 
 		 760 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2837  TonB-dependent siderophore receptor  34.97 
 
 		 760 aa  384  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  37.12 
 
 		 733 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2838  catecholate siderophore receptor Fiu  34.97 
 
 		 760 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.167931 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00789  hypothetical protein  35.1 
 
 		 760 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  35.1 
 
 		 760 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0829  catecholate siderophore receptor Fiu  35.1 
 
 		 760 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0860  catecholate siderophore receptor Fiu  34.97 
 
 		 760 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  34.97 
 
 		 760 aa  382  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0576  catecholate siderophore receptor Fiu  33.83 
 
 		 754 aa  378  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000714833  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1513  TonB-dependent receptor  34.93 
 
 		 859 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.691941  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  35.94 
 
 		 821 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  36.35 
 
 		 753 aa  379  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3540  putative outer membrane TonB-dependent receptor  35.06 
 
 		 805 aa  376  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0614736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  31.68 
 
 		 743 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  34.48 
 
 		 742 aa  369  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  34.48 
 
 		 742 aa  369  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12330  TonB-dependent siderophore receptor  34.77 
 
 		 769 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  34.18 
 
 		 751 aa  364  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  34.32 
 
 		 745 aa  364  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0095  TonB-dependent siderophore receptor  36.69 
 
 		 823 aa  363  9e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1314  putative TonB-dependent receptor protein  34.92 
 
 		 843 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711074 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1637  catecholate siderophore receptor Fiu  32.44 
 
 		 763 aa  355  2e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.824429  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0700  TonB-dependent receptor  34.41 
 
 		 785 aa  351  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.241055 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1708  catecholate siderophore receptor Fiu  32.02 
 
 		 779 aa  352  2e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7102  TonB-dependent siderophore receptor  32.55 
 
 		 790 aa  339  9e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  33.11 
 
 		 732 aa  336  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  32.63 
 
 		 734 aa  333  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  32.78 
 
 		 732 aa  333  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1524  TonB-dependent siderophore receptor  30.9 
 
 		 847 aa  321  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  32.84 
 
 		 736 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  32.71 
 
 		 734 aa  312  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  31.24 
 
 		 777 aa  309  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  32.61 
 
 		 727 aa  306  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3225  TonB-dependent siderophore receptor  31.68 
 
 		 803 aa  300  6e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1078  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 748 aa  294  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0514  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 768 aa  286  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400369  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0530  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 767 aa  286  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.898854  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1948  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 815 aa  284  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  31.88 
 
 		 719 aa  282  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1055  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 		 720 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2275  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 779 aa  270  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00175316  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  31.46 
 
 		 792 aa  264  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03559  putative outer membrane receptor for iron transport  28.51 
 
 		 761 aa  255  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143456  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 		 707 aa  254  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 		 737 aa  253  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 770 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>