88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0098 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0098  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0092  GCN5-related N-acetyltransferase  90.11 
 
 		 182 aa  328  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4179  GCN5-related N-acetyltransferase  74.29 
 
 		 175 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3192  acetyltransferase  77.14 
 
 		 426 aa  264  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.722637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1882  acetyltransferase  77.14 
 
 		 175 aa  262  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3175  acetyltransferase  77.14 
 
 		 175 aa  262  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2727  acetyltransferase  77.14 
 
 		 175 aa  262  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0894  acetyltransferase  77.14 
 
 		 175 aa  262  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2020  acetyltransferase  77.14 
 
 		 175 aa  262  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4801  GCN5-related N-acetyltransferase  76 
 
 		 176 aa  259  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5403  GCN5-related N-acetyltransferase  77.71 
 
 		 176 aa  255  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0191  GCN5-related N-acetyltransferase  73.71 
 
 		 176 aa  255  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5458  GCN5-related N-acetyltransferase  77.71 
 
 		 176 aa  255  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4811  GCN5-related N-acetyltransferase  76 
 
 		 176 aa  255  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329045  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3138  acetyltransferase  74.86 
 
 		 179 aa  254  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3322  GCN5-related N-acetyltransferase  75.43 
 
 		 176 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.954498  normal  0.116948 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1427  acetyltransferase  74.86 
 
 		 175 aa  250  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0394  GCN5-related N-acetyltransferase  75.29 
 
 		 198 aa  246  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.959695  normal  0.199216 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1034  GCN5-related N-acetyltransferase  66.08 
 
 		 183 aa  221  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3401  hypothetical protein  64.71 
 
 		 177 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.737914  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40130  hypothetical protein  63.53 
 
 		 177 aa  214  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2086  GCN5-related N-acetyltransferase  66.28 
 
 		 179 aa  207  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2012  GCN5-related N-acetyltransferase  54.29 
 
 		 175 aa  194  9e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.420393  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4258  GCN5-related N-acetyltransferase  56.21 
 
 		 172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4523  GCN5-related N-acetyltransferase  55.62 
 
 		 172 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31037  normal  0.0470006 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0126  GCN5-related N-acetyltransferase  60.95 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136967  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3472  GCN5-related N-acetyltransferase  55.03 
 
 		 173 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4767  GCN5-related N-acetyltransferase  58.29 
 
 		 173 aa  175  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1865  GCN5-related N-acetyltransferase  52.91 
 
 		 175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00546663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0114  acetyltransferase protein  50.3 
 
 		 174 aa  170  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1455  GCN5-related N-acetyltransferase  43.02 
 
 		 172 aa  140  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1656  GCN5-related N-acetyltransferase  41.71 
 
 		 175 aa  138  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1066  GCN5-related N-acetyltransferase  44.87 
 
 		 168 aa  137  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.172049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4479  GNAT family acetyltransferase  41.28 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.89727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5473  hypothetical protein  42.94 
 
 		 174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0372371 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0197  GCN5-related N-acetyltransferase  40.35 
 
 		 182 aa  125  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000342044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4104  GCN5-related N-acetyltransferase  43.02 
 
 		 170 aa  124  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0181775  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3293  GCN5-related N-acetyltransferase  41.86 
 
 		 170 aa  120  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00428954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3861  GCN5-related N-acetyltransferase  41.03 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6126  GCN5-related N-acetyltransferase  45.78 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350433  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3927  acetyltransferase  41.03 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0329  GCN5-related N-acetyltransferase  38.85 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000416142  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3394  acetyltransferase  38.85 
 
 		 194 aa  111  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.179299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2629  GCN5-related N-acetyltransferase  32.48 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00815719  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0582  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2839  acetyltransferase, GNAT family  32.48 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5268  GCN5-related N-acetyltransferase  45.65 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.90645 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2454  acetyltransferase, GNAT family  32.9 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2834  acetyltransferase, GNAT family  35.03 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000815753 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2828  acetyltransferase  35.03 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.738685  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2588  acetyltransferase  35.03 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00776025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2637  acetyltransferase  35.03 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.439574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2553  acetyltransferase  34.39 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3868  acetyltransferase  38.22 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052756  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1353  putative acetyltransferase protein  42.77 
 
 		 175 aa  104  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0472783  hitchhiker  0.00977736 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1142  GCN5-related N-acetyltransferase  41.83 
 
 		 153 aa  104  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.561673  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2856  acetyltransferase  33.76 
 
 		 167 aa  104  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.72924  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2877  acetyltransferase, GNAT family  32.47 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0106791  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4434  GCN5-related N-acetyltransferase  37.06 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1420  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 		 176 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4893  tabtoxin resistance protein  35.88 
 
 		 177 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 		 128 aa  52  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1415  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 		 186 aa  51.2  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175999  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6174  hypothetical protein  24.82 
 
 		 192 aa  50.8  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1014  GCN5-related N-acetyltransferase  41.3 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.683731 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3661  GCN5-related N-acetyltransferase  31.88 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4547  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.513868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4723  GCN5-related N-acetyltransferase  27.12 
 
 		 210 aa  45.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1073  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.687603  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8064  GCN5-related N-acetyltransferase  25.93 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0384361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0957  putative acetyltransferase  35 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0714  acetyltransferase, GNAT family  32.93 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0653  acetyltransferase  32.93 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2762  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 153 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  37.37 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  39.29 
 
 		 291 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3166  acetyltransferase, GNAT family  40 
 
 		 153 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0840877  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0587  acetyltransferase  33.33 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2090  GCN5-related N-acetyltransferase  36.63 
 
 		 153 aa  42  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537656  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0497  acetyltransferase, GNAT  33.33 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0643  acetyltransferase, GNAT family  33.33 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0555  acetyltransferase  33.33 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49453  predicted protein  30.61 
 
 		 200 aa  41.6  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2064  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1166  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 155 aa  41.2  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486231  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0499  acetyltransferase  31.71 
 
 		 168 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0018  GCN5-related N-acetyltransferase  29.37 
 
 		 173 aa  41.2  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>