23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0079 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0079  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.860546  normal  0.390037 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0071  hypothetical protein  96.77 
 
 
62 aa  120  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1328  hypothetical protein  63.27 
 
 
60 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2719  normal  0.0317001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5286  hypothetical protein  65.12 
 
 
60 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3134  hypothetical protein  70 
 
 
82 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.542099  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3007  hypothetical protein  70 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1355  hypothetical protein  72.41 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5699  hypothetical protein  50 
 
 
69 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.023839 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5288  hypothetical protein  47.73 
 
 
60 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1694  hypothetical protein  47.73 
 
 
60 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.272098  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6472  hypothetical protein  61.29 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0520534  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6061  hypothetical protein  61.29 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.701238  normal  0.166121 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1357  hypothetical protein  61.29 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5620  hypothetical protein  69.23 
 
 
83 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0953084 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6351  hypothetical protein  69.23 
 
 
83 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.67537 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1636  hypothetical protein  47.73 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.193369 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7016  hypothetical protein  69.57 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4384  hypothetical protein  38.6 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153963  normal  0.667987 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3983  hypothetical protein  38.6 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.88036  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4238  hypothetical protein  54.29 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370959  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5971  hypothetical protein  52.94 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.625335  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4263  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.60451  normal  0.208166 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5466  hypothetical protein  65.22 
 
 
86 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>